基于系统生物信息学的鼻咽癌关键预测基因筛选及实验验证

目的基于系统生物信息学分析鼻咽癌样本基因芯片数据,筛选鼻咽癌的潜在预测基因,并对其进行实验验证。方法通过基因表达综合数据库筛选鼻咽癌数据集,通过limma包进行差异分析,加权基因共表达网络包进行加权基因共表达网络分析,绘制韦恩图寻找共同基因,进行基因本体富集分析及京都基因与基因组百科全书通路分析。通过蛋白质互作网络、LASSO回归及非参数检验,进一步挖掘鼻咽癌的生物标志物。通过实时荧光定量PCR和Western blot对鼻咽癌关键预测基因的mRNA及蛋白表达情况进行检测,验证结果。结果GSE12452数据集上调基因共622个,下调基因共351个,通过limma分析及加权基因共表达网络分析并交集最终获取116个交集基因,通过富集分析,生物过程主要包括细胞增殖及调控、细胞间黏附的调节等,富集于Rap1信号通路、Ras信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等通路,经过筛选得到血管生成素2(ANGPT2)、双氧化酶2(DUOX2)、人组织因子Ⅲ(F3)、白细胞介素-15(IL-15)、脂质运载蛋白2、视黄酸受体相关孤儿受体B(RORB)共6个关键基因,实时荧光定量PCR和Western blot实验证明ANGPT2、IL-15的mRNA和蛋白在鼻咽癌细胞中高表达,DUOX2、F3、RORB的mRNA和蛋白低表达。结论ANGPT2、DUOX2、F3、IL-15、RORB为鼻咽癌的潜在预测分子标志物和治疗靶点,其机制可能与Rap1、Ras、肿瘤坏死因子等信号通路有关。

基于网络药理学和分子对接探讨参苓白术散治疗COPD骨骼肌功能障碍的作用机制

目的:本研究旨在利用网络药理学与分子对接技术,深入探索参苓白术散在COPD肌营养不良(骨骼肌功能障碍)治疗中的作用机制及其相关活性成分,从而为临床应用提供更多可能性。研究方法:首先,利用TCMSP检索参苓白术散的组成成分,包括白芍、白扁豆、桔梗、人参、茯苓、甘草、莲子心、山药、薏苡仁、砂仁等十种中药,并确定其所含的有效成分以及其作用靶点。然后,利用String数据库和Cytoscape3.6.1软件,构建参苓白术散治疗COPD肌功能障碍的蛋白互作(PPI)网络,并研究其中Hub网络的特征,最后,利用KEGG富集技术,对参苓白术散的药理活性进行深入探究,以期发现其在COPD患者康复过程中的潜在机制。通过使用Chem Office、Vina和AutoDock等工具,我们可以有效地进行分子整合。结果:设定筛选标准为口服生物利用率(OB)>30%、类药性(DL)>0.18共获得130个活性成份,共检测到黄参苓白术散治疗COPD肌营养不良的潜在靶点共232个,其中关键靶点共22个,并通过对KEGG通道的分析获得了122条通道,筛选得到治疗COPD肌营养不良的25条主要通路。结论:参苓白术散中的活性化合物能通过抑制FOXO1、碳酸酐酶Ⅲ抗体、血管紧张素转化酶的表达,提高AMP激活的蛋白激酶的表达,作用于MAPK8、MAPK14等靶点,调节多条信号通路,起到治疗COPD肌营养不良(骨骼肌功能障碍)的作用。

东莞市林下经济植物资源调查与分析

目的:通过对东莞市域内林下经济植物资源系统调查,摸清当地林下经济植物资源的种类、分布和利用现状,针对性地提出保护和利用建议。方法:依据广东省植物调查技术规范,通过野外实地线路调查,结合内业鉴定和资料整理,对其科属分布、生活型、应用价值类别进行统计分析。结果:东莞市野生林下经济植物资源共有148科451属735种,其中具有药用价值的种类有614种,具有作为蔬菜或水果食用价值的有83种,具有观赏价值的有172种,保护/特有植物49种。结论:东莞市有着丰富的野生林下经济植物资源,开发潜力大,但开发利用率较低,林下种植产业发展薄弱。应以林药模式为主、林下游憩和林菜模式为辅,发展科学合理的林下经济。

基于网络药理学、分子对接探究蒿芩清胆汤治疗新型冠状病毒的作用机制研究

目的:运用网络药理学、分子对接探究蒿芩清胆汤治疗新型冠状病毒的作用机制,为临床运用蒿芩清胆汤治疗新冠肺炎提供理论依据。方法:通过TCMSP、PDB等数据库筛选蒿芩清胆汤中的中药有效成分及其作用靶点;通过Genecards、OMIMS数据库筛选出新型冠状病毒的疾病靶点;使用String数据库、Cytoscape3.7.2软件构建“药物-靶点-疾病”网络和核心靶点相互作用关系;通过R语言对潜在靶标进行KEGG富集和GO富集;通过Autodock vina等进行分子对接。结果:经筛选、去重挖掘出蒿芩清胆汤中化合物176个,344个药物靶点,COVID-19相关靶点259个,二者交集靶点54个,关键化合物涉及槲皮素、山奈酚、木犀草素、汉黄芩素和刺芒柄花素,关键靶点涉及IL6、TNF、MAPK1、STAT1、TP53、STAT3、MAPK14、AKT1等;GO富集分析共得到628个条目,KEGG通路富集共筛选出137条信号通路;分子对接结果显示,蒿芩清胆汤核心化合物与SARS-CoV-23CL水解酶和血管紧张素转化酶II都≤-5 KJ/mol。结论:蒿芩清胆汤能通过多成分、多靶点、多通路作用于新型冠状病毒。

基于RS与GIS的东莞市热岛效应动态变化分析

以2011年Landsat-5和2014年Landsat-8为数据源,利用RS和GIS建模反演东莞市地表温度,研究东莞市2011年和2014年热岛效应,结果表明:用Landsat-5、Landsat-8反演地表温度是可行的;东莞市热岛效应的分布与植被、水体及下垫面有重要关系;2011年东莞市热岛强度以强热岛为主,2014年以中热岛为主;2014年与2011年相比,热岛效应总体下降。

基于Landsat8的东莞市热岛效应研究

以2014年广东省东莞市Landsat 8卫星的热红外波段数据建立模型,反演东莞市地表温度,研究东莞市热岛效应分布情况,从优势度指数、分维数指数和形状指数来分析热力场景观格局,根据热岛效应的不同影响因素分析东莞市热岛现象的成因。结果表明:Landsat 8卫星影像反演2014年东莞市地表温度是可行的;东莞市热力景观以中热岛为主,热岛效应不明显,分布呈西北偏高,中部地区和东南区域偏低;热力景观斑块较复杂、热力场呈条带状零星分布;受绿化、水体影响区域的热岛强度较小,而受人为热源、道路、城市下垫面和建筑等因素影响的区域,热岛强度较大。

基于GIS的东莞市大岭山森林公园信息资源可视与表达

文章应用GIS技术对广东省东莞市大岭山森林公园信息资源进行计算机图形化的管理,并通过电子地图的方式进行快速、高效关联,在此基础上,针对各类专题要素的特点,设计了不同的地图符号进行表达,同时采用柱状、饼状等统计图表方式展示各类统计数据,从而实现了对大岭山森林公园信息资源的可视化表达,直观再现了大岭山森林公园的景区、景点分布、森林资源统计分析、林班专题要素等,有效地辅助了大岭山森林公园的信息管理与决策分析。

东莞林地土壤肥力空间异质性分析

应用地统计学结合地理信息系统研究了广东省东莞市森林表层土壤（0～25 cm）有机质、全氮、全钾、全磷和pH值等5种土壤肥力指标的空间变异规律。研究表明：全磷、全钾、有机质、全氮为中等变异；pH值属于弱变异；全钾、pH值的变异函数曲线的理论模型符合球状模型，有机质、全氮、全磷适用模型为指数模型；全磷、全钾、有机质、pH值具有中等空间相关性，全氮的空间相关性较弱；5种肥力指标的空间自相关范围存在明显差异，变化范围为2218～19297 m。用普通克立格法进行最优内插，得各肥力指标含量分布图，并分析了各土壤肥力指标的分布状态。

东莞市森林土壤有机质空间变异性研究

应用地统计学和地理信息系统(GIS),对广东省东莞市森林土壤有机质(0～1 m)的空间变异性和主要林分土壤有机质含量进行分析,结果表明:东莞市森林土壤有机质属中等变异性;具有中等的空间相关性;空间分布呈东西高、中北低的趋势;主要林分土壤有机质含量由小至大依次为:荔枝林、桉树林、马尾松林、针阔叶混交林、马占相思林、阔叶混交林。

基于网络药理学分析蚓黄散治疗糖尿病足溃疡的作用机制

目的:基于网络药理学研究应用蚓黄散治疗糖尿病足溃疡的作用机制。方法:基于网络药理学方法,分析药物有效成分-靶标的相互作用,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行GO功能富集分析及KEGG通路功能富集分析,研究应用蚓黄散治疗糖尿病足溃疡的作用机制。结果:蚓黄散中可用于治疗糖尿病足溃疡的药物活性成分多达30种,涉及76个靶点及20条信号通路。蚓黄散的主要药物活性成分为槲皮素、异紫堇杷明、氢化小檗碱、β-谷甾醇、豆甾醇等,其关键治疗靶点为AR、ESR1、PPARG、NOS2,涉及PI3K-Akt信号通路、癌症相关通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路等20条通路。结论:蚓黄散可通过多成分、多靶点、多信号通路协同治疗糖尿病足溃疡。

东莞市城区城市森林物种组成和群落空间结构特征分析

以东莞市中心城区城市森林为研究对象,分析东莞市城区城市森林的物种组成和群落空间结构。结果表明:城市森林中维管植物426种,隶属于104科307属;乡土植物有82种,占比较小,仅有40.59%;木本植物67科可分为10个分布区类型,180属可分为13个分布区类型,均以热带性质为主,少数为温带性质类型;植物群落重要值上,乔木层小叶榕、蜜缘桉、肉桂居前三,灌木层阴香、鹅掌柴、幌伞枫居前三,草本层地毯草、细叶结缕草和浆草居前三;物种多度方面阴香个体数量最多;城市森林空间结构上,乔木的平均胸径为14.44cm,和其他多数城市森林研究结果一致,平均高度为8.52m,平均冠幅为3.76m,城市森林结构有向上发展的潜力;乔木胸径与树高以及冠幅呈现正相关关系,阴香和四季桂的树高和冠幅受胸径影响最大。