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基于RefSeq的人类基因荧光定量PCR引物库的构建
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作者 周贵良 洪来法 +2 位作者 梁敏玲 郑柳城 陈转贤 《生物信息学》 2010年第2期139-141,共3页
利用NCBI提供的RefSeq序列,通过BLAT、Sim4和自主开发的剪接比对程序Ealter1.0对人类RefSeq转录本进行外显子预测,根据预测的外显子信息,采用自主开发SYBR Green I Real Time PCR引物设计程序E-qPCR-Design1.0高通量设计21,118对SYBR Gr... 利用NCBI提供的RefSeq序列,通过BLAT、Sim4和自主开发的剪接比对程序Ealter1.0对人类RefSeq转录本进行外显子预测,根据预测的外显子信息,采用自主开发SYBR Green I Real Time PCR引物设计程序E-qPCR-Design1.0高通量设计21,118对SYBR Green I Real Time PCR引物,同时选取5000条基因进行SYBR Green I Real Time PCR引物验证,95.92%的基因引物取得良好效果,1.64%的基因引物产生引物二聚体,1.08%的基因引物有非特异性扩增,通过生物信息技术分析与实验验证,建立了基于RefSeq的人类基因荧光定量PCR引物库。 展开更多
关键词 RefSeq转录本数据库 实时定量PCR
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