目的:探讨仙鹤草干预糖尿病的有效成分及作用机制。方法:通过中医药系统药理学数据库(Traditional Chinese Medicines Systems Pharmacology,TCMSP)和相关文献筛选出仙鹤草的活性化合物,使用生物活性小分子目标预测平台(SwissTarget Pre...目的:探讨仙鹤草干预糖尿病的有效成分及作用机制。方法:通过中医药系统药理学数据库(Traditional Chinese Medicines Systems Pharmacology,TCMSP)和相关文献筛选出仙鹤草的活性化合物,使用生物活性小分子目标预测平台(SwissTarget Prediction)预测这些有效成分的潜在靶点,并结合人类基因数据库(GeneCards)、基因疾病关联数据库(DisGeNET)、在线人类孟德尔遗传数据库(On-line Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、治疗靶点数据库(Therapeutic Target Database,TTD)和药物靶点数据库(DrugBank)挖掘与糖尿病相关的靶点。将获取的有效成分靶点与疾病靶点取交集,得到仙鹤草干预糖尿病的预测靶点。利用功能蛋白关联分析数据库(STRING)构建预测靶点的蛋白互作网络,并通过基因注释数据库(Metascape)对预测靶点进行生物过程和通路富集分析。之后,利用Cytoscape软件构建仙鹤草成分-糖尿病靶点-通路网络,利用分子对接软件(AutoDock)对仙鹤草化学成分与重要靶点进行分子对接验证。结果:鞣花酸、山柰酚、(+)-儿茶素、毛地黄黄酮和槲皮素等被确认为仙鹤草调控糖尿病的核心有效成分,胰岛素、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、白细胞介素6、肿瘤坏死因子和肿瘤蛋白53等被确认为核心靶点。分子对接验证显示,肿瘤坏死因子与槲皮素结合最稳定,丝裂原活化蛋白激酶8、环氧合酶2和丝裂原活化蛋白激酶1均与熊果酸结合最稳定。通路富集显示,仙鹤草参与的通路主要有癌症通路、血流剪切应力信号转导通路、辅助性T细胞17细胞分化通路、爱帕琳肽信号通路等。结论:仙鹤草在调节糖尿病方面具备多元素-多目标-多途径的功能特性,综合干预胰岛素释放与信号传递。展开更多
文摘目的:探讨仙鹤草干预糖尿病的有效成分及作用机制。方法:通过中医药系统药理学数据库(Traditional Chinese Medicines Systems Pharmacology,TCMSP)和相关文献筛选出仙鹤草的活性化合物,使用生物活性小分子目标预测平台(SwissTarget Prediction)预测这些有效成分的潜在靶点,并结合人类基因数据库(GeneCards)、基因疾病关联数据库(DisGeNET)、在线人类孟德尔遗传数据库(On-line Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、治疗靶点数据库(Therapeutic Target Database,TTD)和药物靶点数据库(DrugBank)挖掘与糖尿病相关的靶点。将获取的有效成分靶点与疾病靶点取交集,得到仙鹤草干预糖尿病的预测靶点。利用功能蛋白关联分析数据库(STRING)构建预测靶点的蛋白互作网络,并通过基因注释数据库(Metascape)对预测靶点进行生物过程和通路富集分析。之后,利用Cytoscape软件构建仙鹤草成分-糖尿病靶点-通路网络,利用分子对接软件(AutoDock)对仙鹤草化学成分与重要靶点进行分子对接验证。结果:鞣花酸、山柰酚、(+)-儿茶素、毛地黄黄酮和槲皮素等被确认为仙鹤草调控糖尿病的核心有效成分,胰岛素、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、白细胞介素6、肿瘤坏死因子和肿瘤蛋白53等被确认为核心靶点。分子对接验证显示,肿瘤坏死因子与槲皮素结合最稳定,丝裂原活化蛋白激酶8、环氧合酶2和丝裂原活化蛋白激酶1均与熊果酸结合最稳定。通路富集显示,仙鹤草参与的通路主要有癌症通路、血流剪切应力信号转导通路、辅助性T细胞17细胞分化通路、爱帕琳肽信号通路等。结论:仙鹤草在调节糖尿病方面具备多元素-多目标-多途径的功能特性,综合干预胰岛素释放与信号传递。