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辣椒CaBBX2基因的克隆与表达分析
1
作者
柳佳欣
吴丹
+5 位作者
陶思政
罗英
杨凤
余婷
杨有新
周勇
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期1671-1681,共11页
为探究BBX转录因子在辣椒抵御疫霉菌侵染过程中的功能,本研究以辣椒品种007EA为材料,对辣椒BBX转录因子CaBBX2基因进行克隆和表达分析,并对其编码蛋白进行亚细胞定位和生物信息学分析。聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序结果表明,CaBBX2的...
为探究BBX转录因子在辣椒抵御疫霉菌侵染过程中的功能,本研究以辣椒品种007EA为材料,对辣椒BBX转录因子CaBBX2基因进行克隆和表达分析,并对其编码蛋白进行亚细胞定位和生物信息学分析。聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序结果表明,CaBBX2的编码区序列长为639 bp,编码212个氨基酸。蛋白理化分析结果显示,CaBBX2蛋白分子量为23.5 kDa,理论等电点(pI)值为6.17,总平均亲水系数为-0.559,表明CaBBX2为亲水性蛋白。蛋白质结构预测及蛋白序列比对结果显示,CaBBX2含有2个B-box保守结构域。进化树分析结果显示,CaBBX2蛋白属于Ⅳ亚组的BBX蛋白,与拟南芥AtBBX18和AtBBX19蛋白亲缘关系最近。启动子分析结果显示,CaBBX2启动子序列中含有与胁迫、激素和光响应有关的顺式作用元件。亚细胞定位结果显示,CaBBX2同时定位于细胞质和细胞核。组织特异性表达发现,CaBBX2基因在辣椒不同组织中均有表达,其中在叶中的表达量最高,在果皮中的表达量最低。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析CaBBX2在疫霉菌接种及茉莉酸甲酯(MeJA)处理后表达量的变化,发现接种疫病后CaBBX2的表达量明显上升,MeJA处理后CaBBX2表达量呈现明显下降趋势。上述结果表明CaBBX2可能参与激素调控响应辣椒疫病胁迫的应答过程,可为辣椒抗病分子育种提供重要的候选基因。
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关键词
辣椒
BBX转录因子
疫霉菌
表达分析
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题名
辣椒CaBBX2基因的克隆与表达分析
1
作者
柳佳欣
吴丹
陶思政
罗英
杨凤
余婷
杨有新
周勇
机构
江西农业大学农学院/果蔬贮藏与保鲜江西省重点实验室
江西农业大学生物科学与工程学院/作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室
出处
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期1671-1681,共11页
基金
国家自然科学基金(32160739)
江西省自然科学基金-面上项目(20232BAB205039)
江西省主要学科学术和技术带头人培养计划青年人才项目(20204BCJL23044)。
文摘
为探究BBX转录因子在辣椒抵御疫霉菌侵染过程中的功能,本研究以辣椒品种007EA为材料,对辣椒BBX转录因子CaBBX2基因进行克隆和表达分析,并对其编码蛋白进行亚细胞定位和生物信息学分析。聚合酶链式反应(PCR)扩增和测序结果表明,CaBBX2的编码区序列长为639 bp,编码212个氨基酸。蛋白理化分析结果显示,CaBBX2蛋白分子量为23.5 kDa,理论等电点(pI)值为6.17,总平均亲水系数为-0.559,表明CaBBX2为亲水性蛋白。蛋白质结构预测及蛋白序列比对结果显示,CaBBX2含有2个B-box保守结构域。进化树分析结果显示,CaBBX2蛋白属于Ⅳ亚组的BBX蛋白,与拟南芥AtBBX18和AtBBX19蛋白亲缘关系最近。启动子分析结果显示,CaBBX2启动子序列中含有与胁迫、激素和光响应有关的顺式作用元件。亚细胞定位结果显示,CaBBX2同时定位于细胞质和细胞核。组织特异性表达发现,CaBBX2基因在辣椒不同组织中均有表达,其中在叶中的表达量最高,在果皮中的表达量最低。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析CaBBX2在疫霉菌接种及茉莉酸甲酯(MeJA)处理后表达量的变化,发现接种疫病后CaBBX2的表达量明显上升,MeJA处理后CaBBX2表达量呈现明显下降趋势。上述结果表明CaBBX2可能参与激素调控响应辣椒疫病胁迫的应答过程,可为辣椒抗病分子育种提供重要的候选基因。
关键词
辣椒
BBX转录因子
疫霉菌
表达分析
Keywords
pepper
BBX transcription factor
Phytophthora capsici
expression analysis
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
辣椒CaBBX2基因的克隆与表达分析
柳佳欣
吴丹
陶思政
罗英
杨凤
余婷
杨有新
周勇
《核农学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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参考文献
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