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子痫前期胎盘组织环状RNA表达谱的鉴定、验证与分析 被引量:3
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作者 陈维 白宇翔 +3 位作者 饶海英 陶越兰 漆洪波 罗欣 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期620-626,共7页
目的:描绘人胎盘组织中环状RNA(circular RNA,circRNA)的表达谱,发现并验证子痫前期胎盘组织异常表达的circRNA,研究分析其可能的调控网络。方法:利用高通量测序技术对子痫前期和正常胎盘组织中RNA进行测序和鉴定分析,并利用DeSeq2进行... 目的:描绘人胎盘组织中环状RNA(circular RNA,circRNA)的表达谱,发现并验证子痫前期胎盘组织异常表达的circRNA,研究分析其可能的调控网络。方法:利用高通量测序技术对子痫前期和正常胎盘组织中RNA进行测序和鉴定分析,并利用DeSeq2进行差异性分析。然后利用qRT-PCR在组织水平上对分析结果进行验证。随后利用生物信息学对验证的差异性circRNA进行GO分析和KEGG通路分析。结果:测序结果显示,与正常胎盘组织相比,重度子痫前期胎盘共检测出300种异常表达的circRNA,包括151种高表达和149种低表达。qRT-PCR验证结果显示,hg38circ0014736 (1.418 0±0.106 5 vs. 1.044 0±0.127 1,P=0.035)和hsacirc0015382 (0.895 8±0.180 2 vs. 0.688 8±0.025 3,P=0.025)在子痫前期胎盘组织中高表达,hsacirc0007121(0.395 8±0.200 4 vs. 1.301 0±0.240 7,P=0.000)在子痫前期胎盘组织中明显下调。生物信息学分析显示这些异常表达的circRNA与预测到的靶miRNA及靶基因可能参与调节细胞增殖、缺氧应激、转录后调控等功能。结论:与正常胎盘组织相比,子痫前期胎盘组织存在异常表达的circRNA。生物信息学分析显示,这些异常表达的circRNA或可以通过某些通路参与子痫前期发病。 展开更多
关键词 子痫前期 胎盘组织 环状RNA 高通量测序
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