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基于网络药理学探讨黄芪桂枝五物汤防治糖尿病周围神经病变作用机制 被引量:7
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作者 戚金风 杜盼 +1 位作者 陶金正 李海龙 《中国中医药图书情报杂志》 2023年第2期13-18,共6页
目的 基于网络药理学探讨黄芪桂枝五物汤防治糖尿病周围神经病变(DPN)的作用靶点及分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄芪桂枝五物汤组方药物的化学成分,运用SwissTargetPrediction数据库预测成分的潜在作... 目的 基于网络药理学探讨黄芪桂枝五物汤防治糖尿病周围神经病变(DPN)的作用靶点及分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄芪桂枝五物汤组方药物的化学成分,运用SwissTargetPrediction数据库预测成分的潜在作用靶点;通过TTD、DisGeNET、GeneCards数据库获得DPN基因靶标。经韦恩分析得到交集靶点;利用STRING 11.0数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络;运用Cytoscape 3.7.2构建黄芪桂枝五物汤防治DPN的药味-成分-靶点-通路-疾病网络,通过拓扑学分析筛选核心靶点及核心成分,利用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析,预测黄芪桂枝五物汤防治DPN的作用机制。结果 获得黄芪桂枝五物汤74个有效成分,包括槲皮素、山柰酚、儿茶素等,得到黄芪桂枝五物汤防治DPN靶点108个,有效成分核心靶点主要有AKT1、MAPK8、AKT2等。KEGG通路富集结果表明,黄芪桂枝五物汤主要作用于缺氧诱导因子信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、糖尿病并发症中晚期糖基化终产物-AGE信号通路受体(AGE-RAGE)、丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)信号通路等。结论 黄芪桂枝五物汤中槲皮素、儿茶素、山柰酚等黄酮类成分可能作用于AKT1、 MAPK8等靶点,调节MAPK、 AGE-RAGE、PI3K-Akt等多条信号通路,调节糖代谢、脂代谢,发挥抗炎、抗氧化应激、改善微血管病变、促进神经保护等作用,多成分、多靶点、多通路防治DPN。 展开更多
关键词 黄芪桂枝五物汤 糖尿病周围神经病变 网络药理学 分子机制
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基于计算机辅助药物设计及网络药理学方法探究活络丸治疗骨关节炎的分子机制 被引量:10
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作者 张敏 邱璐 +7 位作者 林佳 后叶虎 张慧娟 苟丽红 陶金正 姚娟 刘永琦 靳晓杰 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期450-460,共11页
目的基于骨关节炎的发病机制以及临床药物需求,运用计算机辅助药物设计以及网络药理方法探究活络丸治疗骨关节炎的潜在药效成分及分子机制。方法采用TCMSP、TCMID和化学专业数据库检索活络丸中药化合物。多靶点分子对接、结合自由能计... 目的基于骨关节炎的发病机制以及临床药物需求,运用计算机辅助药物设计以及网络药理方法探究活络丸治疗骨关节炎的潜在药效成分及分子机制。方法采用TCMSP、TCMID和化学专业数据库检索活络丸中药化合物。多靶点分子对接、结合自由能计算逐级对化合物与骨关节炎治疗靶点COX-2、5-LOX以及凝血因子F2的亲和力进行评估,对潜在活性化合物进行层次聚类及药效团模型的构建。利用Swiss Target Prediction预测化合物潜在靶点,Cytoscape构建"药味-成分-潜在靶点"网络。GeneCards、DrugBank、TTD和CTD检索骨关节炎疾病靶点。DAVID进行GO和KEGG分析,STRING分析蛋白相互作用。结果分子对接及结合自由能计算获得了具有靶向COX-2、5-LOX、F2潜在亲和力的成分,经层次聚类分析后构建药效团模型,得到针对COX-2、5-LOX及F2的药效团模型AAH、AAA、AAR。裂叶苣荚莱内酯、芦荟大黄素、光甘草定等化合物具有的骨架结构可能对治疗骨关节炎有潜在作用。活络丸与骨关节炎共有靶点180个,PPI分析得到STAT3、SRC、CXCR4、EP300等潜在靶点179个,GO和KEGG分析得到GO条目686个、KEGG通路108条。结论本研究选择花生四烯酸代谢靶点COX-2、5-LOX以及凝血靶点F2,通过多靶点分子对接和结合自由能计算逐级筛选、聚类分析、药效团模型及网络药理学等方法,初步揭示活络丸"多点显效,协同增效"的分子机制,为具有潜在较低不良反应的骨关节炎活性中药组分或组分配伍的开发提供靶点组合和研究基础。 展开更多
关键词 骨关节炎 活络丸 COX-2 5-LOX F2 多靶点分子对接 药效团模型 网络药理学
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