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长春市2016—2020监测年度甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因特征分析 被引量:1
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作者 崔薇 初秋 +5 位作者 李晨光 龚云伟 赵春艳 孙宇 隋天卓 孙炳欣 《中国实验诊断学》 2023年第6期690-695,共6页
目的分析长春市2016—2020年度甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因特征,了解其变异情况及遗传进化特征。方法选取2016—2020年度甲型H1N1流感病毒分离株109株,PCR扩增HA基因并进行序列测定;利用生物信息学软件对分离株的HA基因进行进化和... 目的分析长春市2016—2020年度甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因特征,了解其变异情况及遗传进化特征。方法选取2016—2020年度甲型H1N1流感病毒分离株109株,PCR扩增HA基因并进行序列测定;利用生物信息学软件对分离株的HA基因进行进化和变异分析。结果长春市109株分离株与疫苗株A/California/07/2009的HA蛋白相比均有S84N、S162N和I216T共同的氨基酸位点变异,且有1株发生了HA蛋白D222N位点突变,提示此毒株可引起患者下呼吸道症状。109株病毒株的HA基因之间核苷酸同源性为96.9%~100%,氨基酸同源性为97.2%~100%。在进化树分析上,都属于6B.1大分支,并且随着时间的推移,HA在基因进化树上离早期疫苗株A/California/7/2009越来越远,同一年份里也有毒株位于不同的小分支内。结论长春市2016—2020年度甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因在不断的变异中,应持续进行监测,为预防甲型H1N1流感大流行提供参考。 展开更多
关键词 甲型H1N1流感病毒 血凝素(HA) 基因特征
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2021年长春市诺如病毒病原基因特征分析
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作者 李丹丹 李晨光 +1 位作者 隋天卓 孙炳欣 《智慧健康》 2023年第28期14-17,共4页
目的分析2021年长春市诺如病毒的病原基因特征,为诺如病毒的预防提供科学防控依据。方法采用Real-time PCR法对3家哨点医院2021年送往长春市疾病预防控制中心的诺如病毒感染性腹泻病例187份粪便样本进行核酸检测,对阳性样本进行核苷酸... 目的分析2021年长春市诺如病毒的病原基因特征,为诺如病毒的预防提供科学防控依据。方法采用Real-time PCR法对3家哨点医院2021年送往长春市疾病预防控制中心的诺如病毒感染性腹泻病例187份粪便样本进行核酸检测,对阳性样本进行核苷酸序列测定,从GenBank数据库中选取同源性较接近的参考株,应用MEGA 7.0软件构建系统进化树。结果在187份粪便样本中,Real-time PCR检测发现36份诺如病毒阳性,其检出率为19.25%;通过核苷酸测序,从36份阳性样本中成功获得30份检测结果,都是GⅡ型。系统进化树结果显示,30份阳性样本中GII.P16-GII.2基因型28份(93.3%),GⅡ.Pe-GⅡ.4基因型1份(3.3%),GⅡ.P17-GⅡ.17基因型1份(3.3%)。结论2021年长春市诺如病毒感染以GII.P16-GII.2基因型为主。 展开更多
关键词 诺如病毒 急性胃肠炎 系统进化树 基因型
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松花粉的抗氧化作用 被引量:5
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作者 徐佳 张丽梅 +3 位作者 王立成 隋天卓 王琪菲 王丽萍 《吉林大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1626-1630,共5页
先对松花粉进行脱油、水提、冻干,获得水提物冻干品,再与缺陷型大肠杆菌菌液进行混合,稀释至终质量浓度为0.5,1.0,2.0mg/mL,喂食模式生物秀丽隐杆线虫(线虫).通过测定线虫的寿命、产卵、吞咽及运动能力,确定松花粉水提物对线虫无明显毒... 先对松花粉进行脱油、水提、冻干,获得水提物冻干品,再与缺陷型大肠杆菌菌液进行混合,稀释至终质量浓度为0.5,1.0,2.0mg/mL,喂食模式生物秀丽隐杆线虫(线虫).通过测定线虫的寿命、产卵、吞咽及运动能力,确定松花粉水提物对线虫无明显毒性作用;通过10mmol/L过氧化氢体外氧化压力诱导线虫,确定0.5,1.0,2.0mg/mL松花粉水提物对线虫体外氧化压力有显著保护作用. 展开更多
关键词 松花粉 秀丽隐杆线虫 抗氧化 抗衰老
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以秀丽隐杆线虫为模型的玛咖功效评价
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作者 王丽萍 张丽梅 +5 位作者 侯思远 徐佳 隋天卓 张瑞宁 王琪菲 王立成 《吉林大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期440-445,共6页
先对玛咖进行脱油、水提、冻干,再将所得水提物冻干品与Escherichia coli OP50菌液进行混合,稀释至终质量浓度为1,2mg/mL.以秀丽隐杆线虫(简称线虫)为模型,考察玛咖水提物对线虫的抗氧化作用:经寿命、产卵、吞咽、运动能力实验表明,玛... 先对玛咖进行脱油、水提、冻干,再将所得水提物冻干品与Escherichia coli OP50菌液进行混合,稀释至终质量浓度为1,2mg/mL.以秀丽隐杆线虫(简称线虫)为模型,考察玛咖水提物对线虫的抗氧化作用:经寿命、产卵、吞咽、运动能力实验表明,玛咖水提物对线虫无明显毒性作用,且1,2mg/mL玛咖水提物均能显著延长线虫寿命;由玛咖水提物对线虫热激氧化压力诱导表明,玛咖水提物对线虫体外热激氧化压力有保护作用;通过油红O对脂肪染色表明,玛咖水提物具有一定降脂功效. 展开更多
关键词 玛咖 秀丽隐杆线虫 抗氧化剂 降脂
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长春市2018-2020监测年度甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因特征分析
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作者 崔薇 孙炳欣 +6 位作者 李晨光 李元果 初秋 张智丽 隋天卓 孙宇 张兴国 《中国实验诊断学》 2022年第2期235-240,共6页
目的分析长春市2018-2020年度甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因特征,了解其变异情况及遗传进化特征。方法选取2018-2020年度甲型H1N1流感病毒分离株72株,PCR扩增NA基因并进行序列测定;利用生物信息学软件对分离株的NA基因进行进化和... 目的分析长春市2018-2020年度甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因特征,了解其变异情况及遗传进化特征。方法选取2018-2020年度甲型H1N1流感病毒分离株72株,PCR扩增NA基因并进行序列测定;利用生物信息学软件对分离株的NA基因进行进化和变异分析。结果长春市72株分离株与疫苗株A/California/07/2009的NA蛋白相比均有V13I、I34V、L40I、N44S、V81A、N200S、V241I、N248D、N270K、Y351F、N369K、N386K、K432E、N449D共同的氨基酸位点变异,且有1株发生了NA蛋白H275Y耐药位点的突变,提示此毒株为奥司他韦耐药株。72株病毒株NA基因之间核苷酸同源性为97.6%-100%,氨基酸同源性为97.2%-100%。在进化树分析上,呈集中分布态势,都属于6B.1分支。结论长春市2018-2020年度甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因持续发生变异,但大部分甲型H1N1流感病毒仍对神经氨酸酶抑制剂敏感。未来仍应加强耐药性监测,为预防甲型H1N1流感大流行提供参考。 展开更多
关键词 甲型H1N1流感病毒 神经氨酸酶(NA) 基因特征
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一株神经氨酸酶H275Y突变的甲型H1N1流感病毒全基因组序列特征分析
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作者 崔薇 孙炳欣 +7 位作者 李晨光 宋亚男 初秋 隋天卓 孙宇 王宇冰 乔凤娟 张兴国 《中国实验诊断学》 2022年第6期809-816,共8页
目的了解1株含有神经氨酸酶H275Y突变的甲型H1N1流感病毒的变异情况及遗传进化特征,为疫情防控和治疗用药提供依据。方法选取长春市2018-2020年度甲型H1N1流感病毒分离株,PCR扩增NA基因并进行序列测定,筛选出1株甲型H1N1流感病毒株A/Jil... 目的了解1株含有神经氨酸酶H275Y突变的甲型H1N1流感病毒的变异情况及遗传进化特征,为疫情防控和治疗用药提供依据。方法选取长春市2018-2020年度甲型H1N1流感病毒分离株,PCR扩增NA基因并进行序列测定,筛选出1株甲型H1N1流感病毒株A/Jilin-Chaoyang/SWL112/2019(H1),含有神经氨酸酶H275Y耐药位点的突变,对其进行全基因组测序分析。结果流感病毒A/Jilin-Chaoyang/SWL112/2019(H1)8个节段与早期疫苗株A/California/07/2009相比,核苷酸的同源性为96.1%-98.3%,氨基酸同源性为94.9%-99.2%;与同期疫苗株A/Brisbane/02/2018相比,核苷酸的同源性为98.8%-99.7%,氨基酸同源性为98.7%-100%。其HA基因和NA基因在各自的系统进化树上都属于6B.1A5簇,其NA基因具有H275Y耐药位点突变,M2基因具有S31N耐药位点突变。结论本次研究的甲型H1N1流感病毒,具有金刚烷胺类药物和奥司他韦耐药位点突变,未来仍应加强耐药位点监测,为预防甲型H1N1流感大流行提供参考依据。 展开更多
关键词 甲型H1N1流感病毒 全基因组特征 神经氨酸酶
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