2022年苏州市住院肺炎病例呼吸道多病原流行病学特征分析

目的了解苏州市住院肺炎病例呼吸道多病原感染流行病学特征,为制定防控措施提供依据。方法收集2022年苏州市哨点医院送检的住院肺炎病例标本,采用超多重荧光定量PCR试剂盒和单纯疱疹病毒试剂盒检测流感病毒等共21种常见呼吸道病原体。结果435份住院肺炎标本中,呼吸道病原核酸阳性检出率为35.86%,检出率前5位为肺炎链球菌(7.82%)、鼻病毒(7.13%)、单纯疱疹病毒(5.75%)、人偏肺病毒(3.45%)、肺炎支原体(3.45%)。男、女性标本阳性检出率分别为35.91%和35.80%,差异无统计学意义(χ^(2)=0.00,P>0.05)。春、夏、秋、冬四季阳性检出率分别为21.70%、40.71%、31.86%、49.51%,差异有统计学意义(χ^(2)=19.53,P<0.05)。混合感染率为9.89%,阳性样本中以肺炎链球菌(41.86%)、鼻病毒(34.88%)、单纯疱疹病毒(23.26%)混合其他病原体感染较为常见。结论2022年苏州市住院肺炎病例病原体主要为肺炎链球菌、鼻病毒、单纯疱疹病毒、人偏肺病毒和肺炎支原体,肺炎链球菌、鼻病毒和单纯疱疹病毒病毒混合其他病原体感染较为常见。

病原体多重PCR检测技术研究进展

引起某一症候群传染病病原体种类繁多,且可能存在复合感染,快速、准确地诊断病原体,既可有效预防疾病传播,也可以很好地指导临床用药。多重PCR(multiplex polymerase chain reaction,MPCR)技术,可在一个反应体系中同时检测多个病原体,满足突发公共卫生事件中迅速查明病因需要。根据MPCR产物检测信号的时机不同,MPCR技术可分为PCR反应实时检测、终点检测、反应后检测3种类型。本文主要针对这3种类型的MPCR技术研究进展进行综述,并探讨此类技术的发展方向。

389例艾滋病病毒感染者丙肝、梅毒血清学检测结果分析

目的:了解苏州市艾滋病病毒(HIV)感染人群丙型肝炎病毒(HCV)和梅毒螺旋体(TP)的感染情况和流行病学特征。方法:根据389例HIV感染者的血清学结果,对苏州市HIV感染人群HCV、TP的感染情况和流行特征进行分析。结果:389例监测对象中,HIV/HCV合并感染4例(1.0%),男女性别比1∶1;HIV/TP合并感染(包含既往感染) 125例(32.1%);HIV/TP合并感染(现症感染) 47例(12.1%),均为男性,其中有男男同性性行为史占72.3%;HIV/HCV/TP合并感染1例,为男性。结论:年龄≥25岁男性,特别是男男性行为人群HIV/TP合并感染的风险较大,建议建立HIV抗体检测和梅毒抗体检测双向检测机制,加强对HIV、HCV、TP合并感染流行状况和发展趋势的监测。

分子鉴别诊断(MDD)技术在呼吸道病原体检测中的应用

目的:以靶序列富集多重PCR(Tem-PCR)和液相芯片(xMAP)检测技术结合,建立常见呼吸道病原体的分子鉴别诊断(MDD)平台,对其可靠性进行评估,并用于临床样品的检测。方法:采集苏州大学附属儿童医院呼吸科住院病例呼吸道灌洗液样品22例和苏州大学附属第一医院呼吸内科门诊病例咽拭子样品20例,使用Tem-PCR技术对样品的核酸进行多重扩增,以液相芯片技术进行高通量的多重检测。结果:对已知样品的检测表明该平台具有高度的特异性和敏感性。对42例临床样品进行检测的结果显示,22例呼吸道灌洗液的阳性检出率为63.6%。呼吸道灌洗液阳性检出率高于门诊病例咽拭子样品的阳性检出率,RNA病原体(以病毒为主)的阳性率高于DNA病原体(以细菌为主)的阳性率。结论:建立了呼吸道病原体的MDD平台,具备了对呼吸道传染性疾病的高通量快速诊断能力。

苏州市14起诺如病毒胃肠炎暴发疫情流行特征分析

目的了解苏州市诺如病毒胃肠炎暴发疫情的流行病学特征。方法对2010-2014年发生的14起诺如病毒胃肠炎暴发疫情进行描述性流行病学分析,采用聚合酶链反应对病例肛拭子、粪便、呕吐物、水、环境涂抹标本进行核酸检测。结果 2011-2014年,苏州市共报告14起诺如病毒胃肠炎暴发疫情,罹患率波动范围为0.89%~21.18%。14起疫情中12起（85.71%）发生于托幼机构和中小学校,医院、农村各1起。全年均有发生,但以寒冷季节发生较多。仅1起查明与二次供水受到污染有关,13起未证实暴发原因。核酸检测结果12起由诺如病毒GII基因组引起,2起由GI基因组引起。结论诺如病毒已成为苏州市急性胃肠炎暴发疫情的重要病原,托幼机构和学校是高发场所,GII基因组是主要基因组。在暴发疫情处理中,应加强传染源和传播途径的调查。

2011—2015年苏州市男男性行为人群HIV新发感染率变化趋势及影响因素

目的了解苏州市男男性行为人群(MSM)HIV新发感染率变化趋势及影响因素。方法依托国家艾滋病哨点监测,应用BED HIV-1捕获酶免疫法,对该市MSM人群进行连续5年的横断面调查,采用logistic回归模型分析变化趋势及影响因素。结果 2011—2015年每年招募300名左右的MSM参加调查,共招募MSM 1 636名,HIV新发感染率从2011年的4.89%快速上升至2015年的16.23%(P<0.01)。多因素分析显示,网络招募、最近6个月发生无保护性肛交及正在感染梅毒是MSM人群感染HIV的主要危险因素(P值均<0.05)。结论该市MSM人群HIV新发感染率呈上升趋势。促进安全套使用和HIV/梅毒筛查仍为该人群性病艾滋病防治工作的重点。

2010—2015年苏州市艾滋病自愿检测门诊男男性行为人群血清学检测结果

目的了解苏州市自愿咨询检测(VCT)门诊男男性行为(MSM)人群中HIV、梅毒和丙型肝炎病毒(HCV)感染情况。方法对2010—2015年首次至苏州市疾控中心VCT门诊的MSM,收集其人口学信息,采集血样进行HIV、梅毒和HCV抗体检测。结果 2010—2015年,共有2 120名MSM检测,检出HIV抗体阳性421例,阳性检出率19.9%,各年分别为9.7%、12.6%、21.3%、27.6%、27.2%、29.2%,有逐年增高趋势(χ2趋势=76.148,P<0.01)。梅毒TPPA和RPR阳性138例,阳性率6.5%;HCV抗体阳性6例,阳性率0.3%。HIV和梅毒阳性51例,合并感染率2.4%。不同年龄、文化程度、婚姻状况、户籍MSM人群HIV阳性检出率差异均有统计学意义(P值均<0.05)。结论苏州市VCT门诊MSM人群HIV、梅毒阳性检出率较高,需进一步加强对MSM人群的干预工作。

2016—2018年苏州市重症肺炎病例流感病毒感染监测分析

目的了解苏州市重症肺炎患者流感病毒感染情况,为治疗和预防提供科学依据。方法对疑似流感/禽流感感染的重症肺炎患者进行采样,采用实时荧光-逆转录聚合酶链反应(real-time RT-PCR)方法进行流感病毒通用和分型的核酸检测。结果 2016年1月—2018年8月,共收集重症肺炎呼吸道标本1665份,病例主要为51～90岁老年人。重症肺炎流感病毒核酸检测阳性率为24.62%,其中H7N9禽流感病毒68份,H1N1(pdm09)有177份,季节性H3N2有92份,B型流感病毒73份。2016年流感病毒阳性检出率为27.56%,主要病原亚型为H7N9和H1N1(pdm09);2017年流感病毒阳性检出率为17.42%,主要病原亚型为H3N2,2018年流感病毒阳性检出率为29.88%,主要病原亚型为H1N1(pdm09)和B型。结论季节性流感仍然是引起苏州市重症肺炎的重要病原体,且不能忽视禽流感,建议将其他细菌列入重症肺炎的监测。

苏州市人感染H7N9禽流感聚集性疫情调查分析

目的调查分析苏州市两起家庭聚集性人感染H7N9禽流感疫情流行病学及病原学特征,为该地区人感染H7N9病毒疫情防控提供科学依据。方法采集聚集性疫情中H7N9病例及其密切接触者咽拭子标本,同时收集流行病学及临床资料,应用实时荧光-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测流感病毒及H7N9亚型的特异性基因,对H7N9阳性标本进行病毒分离并测序,比对分析H7N9病毒血凝素基因变异状况。结果第一起聚集性疫情中2例H7N9病例被成功救治。而第二起聚集性疫情中的1例H7N9死亡,另1例存活。两起疫情中的其他密切接触者无发病报告。H7N9病毒的受体结合位点没有发生变异。引起这两起人感染H7N9禽流感聚集性疫情的病毒血凝素切割位点的氨基酸序列为PEIPKGR↓GLF。耐药位点E120G、R153K、H276Y及R294K未发生改变。结论 H7N9病毒在有血缘关系的近亲属之间可能更容易传播,对于H7N9患者应加强院感防控,防止密切接触者感染。目前,H7N9病毒仅具有有限的人传人能力,尚不能在人际间持续传播,第二起聚集性疫情中的H7N9病毒血凝素基因序列高度同源且仍对奥司他韦等神经氨酸酶抑制剂敏感。

网格式电极钛板次氯酸钠发生器产生次氯酸钠液消毒效果的观察

网格式电极钛板次氯酸钠发生器产生次氯酸钠液消毒效果的观察江苏省苏州市卫生防疫站２１５００３雅雪蓉，申宗俊含氯制剂是目前我国最常用的一种化学消毒剂，次氯酸钠则是含氯制剂中较为常见的一种。本文对网格式电极钛板次氯酸钠发生器产生的液体消毒效果进行了观察，现...

2858名企业工人HBV血清学检测结果分析

为贯彻执行《劳动法》和《江苏省劳动安全卫生条例》，控制乙型肝炎(下称乙肝)的传播，我们对企业工人进行了乙型肝炎表面抗原(HBsAg)的检测。并对HBsAg阳性者加测了乙肝其余四项标志物(抗-HBs、HBeAg、抗-HBe、抗-HBc)。现将结果报告如下。

苏州市流行性感冒病毒监测结果

流行性感冒(简称流感)好发于冬春季，常可引起学校、单位内的暴发。为摸清苏州市流感病毒流行株，我们于1998年12月～1999年4月进行了流感病毒分离鉴定。现将结果报告如下.

苏州市一起聚集性人感染柯萨奇病毒A组4型基因特征

目的 对苏州市一起人呼吸道感染不明病原的聚集性疫情病例咽拭子样本进行初步病原分子鉴定,为疫情处置提供技术支撑。方法 采集该起疫情病例咽拭子标本,实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(Real-time reverse transcription polymerase chain reaction, Real-time RT-PCR)方法检测可引起聚集性呼吸道感染疫情的常见病原(甲/乙型流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒、鼻病毒、偏肺病毒和腺病毒)核酸,同时采用FilmArray全自动医用PCR分析系统进行多病原筛查。对病例咽拭子标本进行高通量测序,并用特异性引物探针检测柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4, CV-A4)进行验证。结果 该起疫情采样送检的18份咽拭子样本经Real-time RT-PCR方法检测,其中14份样本柯萨奇A4型病毒检测阳性。Real-time RT-PCR和高通量基因测序方法在病例咽拭子标本中均检出柯萨奇A4型病毒特异性基因片段。序列分析表明苏州该起疫情病毒株全基因组序列与NCBI数据库的MN964082病毒核酸一致性最高,为98.11%;VP1蛋白氨基酸序列与原型株AY421762一致性为98.03%,发现6个位点突变(T23V、A34T、S102A、A200T、I262V和Y285H)。结论 CV-A4可引起聚集性呼吸道感染疫情,对学龄儿童等免疫力较弱的人群应加强健康监测以便疫情早期处置。

2010—2014年苏州市流感病原学监测结果分析

目的了解苏州市2010—2014年的流感样病例（Influenza—likeillness，ILI）病原学特点，为苏州市流感的防控工作提供科学依据。方法对苏州市立医院本部和苏州市儿童医院的呼吸科就诊病人进行监测采样，获得成人及儿童流感样病例咽拭子标本，采用实时荧光-PCR方法进行病毒核酸检测，并对结果信息进行描述分析。结果2010—2014年苏州市共采集ILI咽拭子标本8035份，其中流感阳性标本959份，总阳性率为11．94％，相邻年份阳性率差异有统计学意义（，=77．78，P〈0．0001）。各个年龄组病例阳性率最高的是10～19岁年龄组，最低的是40～49岁年龄组；苏州市流感的流行季节为冬春季和夏季，B型流感主要在冬春季流行，而A型流感在全年流行，各个亚型交替流行。结论苏州地区2011—2014年流感病毒感染人群各个年龄组，发病高峰为每年的冬春季和夏季，各种流感亚型交替流行，因此需要长期对苏州市流感进行病原学监测，为进一步控制流感的传播提供理论基础。

2011-2015年苏州市手足口病相关病原监测

目的 对苏州市2010-2015年的手足口病相关病毒进行病原学监测分析,为苏州市预防和控制手足口病提供科学依据.方法 以苏州每个区为单位,每月采集至少五个轻症病例标本,重症病例均采样,采用实时荧光PCR方法进行病毒核酸检测,并对结果信息进行描述分析.结果苏州市2011-2015年共采集手足口病标本4 552份,检测结果为阳性的手足口标本2 818份（总阳性率为61.90%）,相邻年份阳性率差异有统计学意义（x2=186.09,P〈0.0001）.手足口病主要感染1~5岁的儿童,其中66.17%是1~3岁儿童.EV71和CVA16是苏州市2011、2012年和2014年手足口病主要的病原;重症病例主要与EV71感染有关,2013年的肠道病毒其他亚型占主导地位,重症患者显著减少.结论 EV71和CVA16仍然是苏州市手足口病的重要病原体,但其他亚型的肠道病毒也占有一定比例,建议从肠道病毒的非EV71和CVA16中选择个别优势手足口病病原纳入手足口病监测.

甲型H1N1流感病毒制备方法的优化

2009年3月新型H1N1流感病毒首次在墨西哥暴发,截止2009年11月,全球已有20万人感染H1N1流感病毒,死亡6000多人,引起全球恐慌,流感成为第一个实施全球监控的疾病。之后H1N1病毒并未从此销声匿迹,2010年下半年,甲型H1N1又重新在人群中出现,逐渐成为优势株,虽然未发生大流行,然而该病毒始终是公共卫生安全的重大威胁。目前预防流感最有效的方法是疫苗接种,疫苗的质量依赖于高滴度流感病毒的获得[1,2]。

2017-2018年江苏省苏州市手足口病病原学及重症监测分析

目的对苏州市2017-2018年手足口病相关病毒进行病原学监测分析,为苏州市预防和控制手足口病提供科学依据。方法以苏州市各区为单位,每月采集至少5份轻症病例标本,重症病例均采样,采用实时荧光-PCR方法进行病毒核酸检测,并对结果信息进行描述分析。结果苏州市2017-2018年共采集手足口病病例标本1 377份,检测结果为阳性的1 085份(总阳性率78.79%),各年阳性率分别为79.38%和82.48%,差异无统计学意义(χ^2=2.11,P=0.15)。EV 71和CA16是苏州市2017年手足口病主要病原,CA6是2018年手足口病主要病原;2017年重症病例主要与EV 71感染有关,EV 71占重症病例总数的67.05%,2018年重症病例的主要病原为EV 71和CA6,其病例分别占重症病例总数的22.72%和20.45%;手足口病的优势病原体由2017年的EV 71和CA16转变为2018年的CA6,CA16和其他肠道病原为辅,重症病例2018年比2017年显著减少。结论手足口病重症病例明显减少可能与手足口病EV 71疫苗的普及有关。建议加强疫苗宣传,加强手足口病监测,控制手足口病的传播,进一步减少重症病例。

2016—2017年苏州市人感染H7N9禽流感病毒HA基因进化分析

目的监测分析2016—2017年苏州市第五波H7N9禽流感疫情中病毒分子流行特征,为本地区H7N9流感病毒感染防控提供科学依据。方法采集疑似急重症呼吸道感染病例咽拭子标本并提取病毒核酸,应用实时荧光定量-聚合酶链反应(Real-timePCR)方法检测甲/乙型流感病毒核酸,阳性标本继续进行各亚型分型检测(H1N1,H3N2,H5N1)。H7N9阳性标本进一步进行病毒分离和血凝素HA基因测序分析。结果2016年10月至2017年5月间苏州人感染H7N9病毒总体病死率为40%(22/55)。检出高峰在12月份至次年2月,以60岁以上老年人居多,患者中位年龄为58岁。超过80%的确诊患者发病前有活禽暴露史。序列分析表明血凝素HA基因同源性为98.7%~100%。受体结合位点中的关键氨基酸也没有发生突变。此外,HA基因血凝素连接肽位置也没有发生多个碱性氨基酸插入。结论目前H7N9病毒不会在人群中持续传播,直接接触活禽或被病毒污染的环境是人感染H7N9病毒的主要途径;在苏州流行的H7N9病毒对禽类仍然是低致病性的。

苏州市艾滋病抗病毒治疗病毒学效果及耐药研究

【目的】了解苏州市艾滋病抗病毒治疗病毒抑制和耐药位点突变情况。【方法】对2005年3月1日-2018年12月31日期间入组进行艾滋病抗病毒治疗、治疗时间≥6个月、年龄≥16岁者进行血浆HIV病毒载量(VL)及基因型耐药突变位点检测。【结果】共2 881人纳入研究,2 541人(88. 2%) VL持续≤1 000 copies/mL,340人(11. 8%)曾检出VL>1 000 copies/mL;最近1次VL检测中2 728人(94. 7%)≤1 000 copies/m L,153人(5. 3%)>1 000 copies/mL,病毒学失败率为5. 3%。离异或丧偶、基线CD4≤200个/mm^3、治疗时间<1年或≥1年且<3年、初始治疗方案为AZT(齐多夫定)+3TC(拉米夫定)+EFV(依非韦伦)或AZT+3TC+NVP(奈韦拉平)者病毒学失败率高,差异有统计学意义(P<0. 05)。340名VL>1 000 copies/mL者中,278人(81. 8%)成功扩增样本,其中135人(48. 6%)检出耐药突变位点,以核苷类和非核苷类反转录酶抑制剂类耐药为主,突变频率最高位点分别为M184V/I和K103N/Q。年龄36~45岁、基线CD4计数≤200个/mm^3、CRF01_AE亚型者耐药发生比例高,分别为53. 3%、67. 9%、55. 4%。【结论】苏州市艾滋病抗病毒治疗病毒抑制率较高,但病毒学失败者中耐药突变位点检出率高。应针对重点人群开展早期治疗和依从性教育,定期开展VL和耐药监测,最大限度地发挥抗病毒治疗的作用。

流感病毒培养的影响因素

随着流感在全球的爆发,人们越来越重视流感疫苗的接种。流感疫苗的制备需要以流感毒株为基础,全国各地的CDC都将流感毒株的制备作为日常工作,因为刚刚开展,还有许多技术不成熟。毒株的培养有很多影响因素,例如用于培养流感病毒的细胞,试剂,操作步骤以及样品等,本文都列举出来,希望给同仁提供一定的参考,也希望大家一起来补充指正,共同提高我国流感毒株培养的水平。