基于功能网络信息传播预测疾病-miRNAs的关联

为了快速发现与疾病关联的miRNA,基于功能网络信息传播,提出PMBP算法用于改进随机游走法,使用留一交叉验证评估了算法性能,最后进行案例分析.实验结果表明:对于尚未发现关联miRNA的疾病,随机游走法是失效的,而PMBP以疾病相似性作为先验信息,能够有效预测;对于已经关联miRNA的疾病,PMBP提高了预测性能,AUC值为0.866.对乳腺癌进行案例分析,预测的前50个miRNAs都被证实与乳腺癌相关,体现了PMBP算法的有效性.

基于PET/CT图像肿瘤生物靶区自动勾画算法的研究

目的对传统随机游走算法进行改进,提高肿瘤生物靶区勾画的精确度。方法通过灰度共生矩阵提取PET图像的纹理特征信息,采用模糊C均值聚类算法将图像分为高摄取区域、低摄取区域和包含肿瘤浸润边界的中摄取区。再将高摄取区全部标记为随机游走算法的前景种子点,低摄取区域全部标记为背景种子点,并结合图像的方差纹理特征量和PET SUV值计算随机游走算法顶点间边的权重函数。结果通过相似性和灵敏性对实验结果进行评估。该方法的相似性指标较阈值法提高约14.4%,较传统随机游走算法提高约11.2%;灵敏性指标较阈值法提高了约19.8%,较传统随机游走算法提高了约16.4%。三种方法分割图像得到的相似性和灵敏性差异均具有统计学意义(F=82.06、214.12,P均<0.01)。结论实验结果表明本文方法在相似性和敏感性较阈值法和传统随机游走算法有较大的提高。