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基于网络药理学和分子对接探究木犀草素保护鸡氨气暴露的作用机制
1
作者
刘佳豪
雷江英
+2 位作者
沈凡钰
何闳翃
陈德纯
《西南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2023年第3期289-296,共8页
借助网络药理学和分子对接技术探讨木犀草素干预鸡氨气暴露后细胞焦亡的机制.先使用反向药效团匹配方法(PharmMapper)和中药系统药理学分析平台(TCMSP)预测木犀草素相关靶点;采用GeneCards数据库、OMIM数据库搜集氨气中毒疾病的相关靶点...
借助网络药理学和分子对接技术探讨木犀草素干预鸡氨气暴露后细胞焦亡的机制.先使用反向药效团匹配方法(PharmMapper)和中药系统药理学分析平台(TCMSP)预测木犀草素相关靶点;采用GeneCards数据库、OMIM数据库搜集氨气中毒疾病的相关靶点,并通过比对已知文献对其进行整理与筛选;其次通过利用Cytoscape 3.82软件,搭建“木犀草素-氨气中毒-靶点”网络图;在STRING数据库中对所得靶点进行检索,以得到各个靶点互作的网络关系数据,再使用Cytoscape 3.82工具绘制PPI图;然后靶点被上传到DAVID数据库中完成富集分析;最后木犀草素和核心的靶蛋白被上传到Schr9dinger Maestro软件中进行了分子对接.结果显示,筛选得到共62个相关靶点,其中核心靶点有ALB、TP53、CASP3、JUN、VEGFA、NFκBIA等;这些靶点主要涉及相同蛋白结合、酶结合等分子功能及白细胞介素-17信号通路从而发挥木犀草素干预氨气暴露后细胞焦亡的作用.结果表明,木犀草素可以通过多靶点、多途径干预鸡氨气暴露后细胞焦亡的发生.
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关键词
氨中毒
网络药理学
木犀草素
分子对接
细胞焦亡
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职称材料
传统牦牛酸奶中产细菌素乳酸菌的筛选及鉴定
被引量:
1
2
作者
梁小东
汤承
+2 位作者
雷江英
沈凡钰
陈德纯
《中国酿造》
CAS
北大核心
2022年第8期77-82,共6页
采用溶钙圈法对来自青海海南藏族自治区、四川阿坝、甘孜理塘的牦牛酸奶样品的菌株进行分离筛选,采用形态学观察和16S r RNA序列分析进行鉴定;测定筛选菌株上清液对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、大肠杆菌(Escherichia coli)...
采用溶钙圈法对来自青海海南藏族自治区、四川阿坝、甘孜理塘的牦牛酸奶样品的菌株进行分离筛选,采用形态学观察和16S r RNA序列分析进行鉴定;测定筛选菌株上清液对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、大肠杆菌(Escherichia coli)抑菌活性;考察筛选菌株上清液对蛋白酶的耐受性及对抗生素的敏感性,并确定细菌素种类。结果表明,共分离筛选出6株菌(编号为A1~A2及G1~G4),其中菌株A1~A2被鉴定为嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus),菌株G1~G4被鉴定为屎肠球菌(Enterococcus faecium);菌株G3对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌的抑菌圈直径>20 mm,且对蛋白酶不耐受,表明该菌株产细菌素,对常见抗生素敏感,经细菌素基因鉴定证实,该菌株产肠球菌素A和肠球菌素P。综上,菌株G3可作为产细菌素益生菌的候选菌株。
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关键词
传统牦牛酸奶
乳酸菌
细菌素
分离
鉴定
抑菌性能
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职称材料
牦牛源产细菌素屎肠球菌的分离鉴定和益生特性
被引量:
4
3
作者
王朝
冉旋
+1 位作者
雷江英
陈德纯
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期3454-3466,共13页
【背景】抗生素的滥用导致牦牛肠道常见病原菌耐药性增加,益生菌作为对抗耐药性细菌的新型武器,应用前景广阔。【目的】获取益生特性优良的牦牛源益生菌。【方法】将20份牦牛粪便样本在含0.5%CaCO3的MRS培养基上分离纯化,以大肠杆菌和...
【背景】抗生素的滥用导致牦牛肠道常见病原菌耐药性增加,益生菌作为对抗耐药性细菌的新型武器,应用前景广阔。【目的】获取益生特性优良的牦牛源益生菌。【方法】将20份牦牛粪便样本在含0.5%CaCO3的MRS培养基上分离纯化,以大肠杆菌和金黄色葡萄球菌为指示菌,用牛津杯法筛选有抑菌活性的菌株;排除酸和过氧化氢后,经耐酸耐热试验和蛋白酶敏感试验筛选产细菌素菌株,用形态学和16S rRNA基因序列分析鉴定;通过对大肠杆菌、沙门氏菌等腹泻病原菌体外抑菌试验、耐模拟胃肠液、测定自聚集能力和疏水性及抗生素敏感试验分析益生特性。【结果】从20份牦牛粪便样本中共分离出11株产生溶钙圈的菌株,其中6株对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌抑菌效果显著,经复筛得到2株产细菌素的乳酸菌SC6和SC9,经鉴定均为屎肠球菌(Enterococcus faecium)。其中SC9对腹泻病原菌抑菌效果明显,有良好的耐受性和肠道黏附能力,对5种常用抗生素均敏感。【结论】屎肠球菌SC9有一定的抗逆性和潜在的益生能力,具备作为益生菌的潜力。
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关键词
牦牛
细菌素
屎肠球菌
分离鉴定
益生特性
原文传递
题名
基于网络药理学和分子对接探究木犀草素保护鸡氨气暴露的作用机制
1
作者
刘佳豪
雷江英
沈凡钰
何闳翃
陈德纯
机构
西南民族大学畜牧兽医学院
出处
《西南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2023年第3期289-296,共8页
基金
国家自然科学基金(32202871)
四川省自然科学基金项目(22NSFSC3161)
中央高校基本科研业务费专项资金优秀学生培养工程项目(2023NYXXS125)。
文摘
借助网络药理学和分子对接技术探讨木犀草素干预鸡氨气暴露后细胞焦亡的机制.先使用反向药效团匹配方法(PharmMapper)和中药系统药理学分析平台(TCMSP)预测木犀草素相关靶点;采用GeneCards数据库、OMIM数据库搜集氨气中毒疾病的相关靶点,并通过比对已知文献对其进行整理与筛选;其次通过利用Cytoscape 3.82软件,搭建“木犀草素-氨气中毒-靶点”网络图;在STRING数据库中对所得靶点进行检索,以得到各个靶点互作的网络关系数据,再使用Cytoscape 3.82工具绘制PPI图;然后靶点被上传到DAVID数据库中完成富集分析;最后木犀草素和核心的靶蛋白被上传到Schr9dinger Maestro软件中进行了分子对接.结果显示,筛选得到共62个相关靶点,其中核心靶点有ALB、TP53、CASP3、JUN、VEGFA、NFκBIA等;这些靶点主要涉及相同蛋白结合、酶结合等分子功能及白细胞介素-17信号通路从而发挥木犀草素干预氨气暴露后细胞焦亡的作用.结果表明,木犀草素可以通过多靶点、多途径干预鸡氨气暴露后细胞焦亡的发生.
关键词
氨中毒
网络药理学
木犀草素
分子对接
细胞焦亡
Keywords
ammonia poisoning
network pharmacology
luteolin
molecular docking
pyroptosis
分类号
S852.3 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
传统牦牛酸奶中产细菌素乳酸菌的筛选及鉴定
被引量:
1
2
作者
梁小东
汤承
雷江英
沈凡钰
陈德纯
机构
西南民族大学畜牧兽医学院
动物医学四川省高校重点实验室
出处
《中国酿造》
CAS
北大核心
2022年第8期77-82,共6页
基金
西南民族大学中央高校基本科研业务费专项资金项目(2021NYYXS91)。
文摘
采用溶钙圈法对来自青海海南藏族自治区、四川阿坝、甘孜理塘的牦牛酸奶样品的菌株进行分离筛选,采用形态学观察和16S r RNA序列分析进行鉴定;测定筛选菌株上清液对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、大肠杆菌(Escherichia coli)抑菌活性;考察筛选菌株上清液对蛋白酶的耐受性及对抗生素的敏感性,并确定细菌素种类。结果表明,共分离筛选出6株菌(编号为A1~A2及G1~G4),其中菌株A1~A2被鉴定为嗜热链球菌(Streptococcus thermophilus),菌株G1~G4被鉴定为屎肠球菌(Enterococcus faecium);菌株G3对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌的抑菌圈直径>20 mm,且对蛋白酶不耐受,表明该菌株产细菌素,对常见抗生素敏感,经细菌素基因鉴定证实,该菌株产肠球菌素A和肠球菌素P。综上,菌株G3可作为产细菌素益生菌的候选菌株。
关键词
传统牦牛酸奶
乳酸菌
细菌素
分离
鉴定
抑菌性能
Keywords
traditional yak yogurt
lactic acid bacterium
bacteriocin
isolation
identification
antibacterial performance
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
下载PDF
职称材料
题名
牦牛源产细菌素屎肠球菌的分离鉴定和益生特性
被引量:
4
3
作者
王朝
冉旋
雷江英
陈德纯
机构
西南民族大学畜牧兽医学院
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期3454-3466,共13页
基金
西南民族大学引进人才科研启动金资助项目(RQD2021074)。
文摘
【背景】抗生素的滥用导致牦牛肠道常见病原菌耐药性增加,益生菌作为对抗耐药性细菌的新型武器,应用前景广阔。【目的】获取益生特性优良的牦牛源益生菌。【方法】将20份牦牛粪便样本在含0.5%CaCO3的MRS培养基上分离纯化,以大肠杆菌和金黄色葡萄球菌为指示菌,用牛津杯法筛选有抑菌活性的菌株;排除酸和过氧化氢后,经耐酸耐热试验和蛋白酶敏感试验筛选产细菌素菌株,用形态学和16S rRNA基因序列分析鉴定;通过对大肠杆菌、沙门氏菌等腹泻病原菌体外抑菌试验、耐模拟胃肠液、测定自聚集能力和疏水性及抗生素敏感试验分析益生特性。【结果】从20份牦牛粪便样本中共分离出11株产生溶钙圈的菌株,其中6株对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌抑菌效果显著,经复筛得到2株产细菌素的乳酸菌SC6和SC9,经鉴定均为屎肠球菌(Enterococcus faecium)。其中SC9对腹泻病原菌抑菌效果明显,有良好的耐受性和肠道黏附能力,对5种常用抗生素均敏感。【结论】屎肠球菌SC9有一定的抗逆性和潜在的益生能力,具备作为益生菌的潜力。
关键词
牦牛
细菌素
屎肠球菌
分离鉴定
益生特性
Keywords
yak
bacteriocin
Enterococcus faecium
isolation and identification
probiotic properties
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接探究木犀草素保护鸡氨气暴露的作用机制
刘佳豪
雷江英
沈凡钰
何闳翃
陈德纯
《西南民族大学学报(自然科学版)》
CAS
2023
0
下载PDF
职称材料
2
传统牦牛酸奶中产细菌素乳酸菌的筛选及鉴定
梁小东
汤承
雷江英
沈凡钰
陈德纯
《中国酿造》
CAS
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
3
牦牛源产细菌素屎肠球菌的分离鉴定和益生特性
王朝
冉旋
雷江英
陈德纯
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
4
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