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基于符号网络的药物靶标相互作用关系预测
1
作者
雷涵清
蒋亚健
+2 位作者
习智威
张万成
陈明
《现代计算机》
2022年第12期65-68,74,共5页
药物-靶标相互作用(DTI)预测在新药物研发中具有重要意义。大多数计算方法将其建模为二元预测问题,忽视了DTI的具体类型。考虑DTI的积极或消极作用,将有利于研究多种药物对共同靶标的综合作用机理。通过构建药物靶标符号网络,将DTI预测...
药物-靶标相互作用(DTI)预测在新药物研发中具有重要意义。大多数计算方法将其建模为二元预测问题,忽视了DTI的具体类型。考虑DTI的积极或消极作用,将有利于研究多种药物对共同靶标的综合作用机理。通过构建药物靶标符号网络,将DTI预测问题转化为药物与靶标异构网络的符号链路预测问题,并引入Logistic回归与随机游走构建学习系统。在两个数据集进行实验,其预测结果呈现出良好的指标,表明该思路的可行性。
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关键词
药物-靶标相互作用
符号网络
链路预测
LOGISTIC回归
随机游走
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职称材料
题名
基于符号网络的药物靶标相互作用关系预测
1
作者
雷涵清
蒋亚健
习智威
张万成
陈明
机构
湖南师范大学信息科学与工程学院
出处
《现代计算机》
2022年第12期65-68,74,共5页
基金
湖南省教育厅科学研究项目(18C0016)
湖南省大学生创新创业训练计划项目(S202010542075)。
文摘
药物-靶标相互作用(DTI)预测在新药物研发中具有重要意义。大多数计算方法将其建模为二元预测问题,忽视了DTI的具体类型。考虑DTI的积极或消极作用,将有利于研究多种药物对共同靶标的综合作用机理。通过构建药物靶标符号网络,将DTI预测问题转化为药物与靶标异构网络的符号链路预测问题,并引入Logistic回归与随机游走构建学习系统。在两个数据集进行实验,其预测结果呈现出良好的指标,表明该思路的可行性。
关键词
药物-靶标相互作用
符号网络
链路预测
LOGISTIC回归
随机游走
Keywords
drug-target interaction
signed network
link prediction
logistic regression
random walk
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
O157.5 [理学—基础数学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于符号网络的药物靶标相互作用关系预测
雷涵清
蒋亚健
习智威
张万成
陈明
《现代计算机》
2022
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