广西6个地方鸡肉品质测定及差异性分析

为了解广西地方鸡的肉质特征,且为进一步推动广西地方鸡品种选种选育提供基础依据,对广西南丹瑶鸡(NDY)、霞烟鸡(XY)、广西三黄鸡(SH)、龙胜凤鸡(LSF)、广西麻鸡(GXM)和东兰乌鸡(DLW)6个地方鸡品种以及艾维茵快大型商品肉鸡于上市日龄进行屠宰,采集胸肌和腿肌,利用仪器分别测定了肉色、电导率、pH、剪切力、肌内脂肪含量等共14个指标。结果显示:广西麻鸡公鸡的胸肌和腿肌Opto值(比色值)显著高于其他品种(P<0.05);东兰乌鸡腿肌肌内脂肪含量显著高于其他地方鸡品种(P<0.05),霞烟鸡胸肌肌内脂肪含量最高但仅与南丹瑶鸡、东兰乌鸡和艾维茵鸡差异显著(P<0.05);龙胜凤鸡胸肌的肌肉电导率45 min最高且除与霞烟鸡和艾维茵鸡差异不显著外(P>0.05),与其他四个地方鸡都差异显著(P<0.05),但腿肌电导率45 min最高为霞烟鸡且除与艾维茵鸡差异不显著外(P>0.05),与其他五个地方鸡品种都差异显著(P<0.05);龙胜凤鸡母鸡胸肌的肌内脂肪含量和剪切力均显著高于其他品种(P<0.05),腿肌的肌内脂肪含量也最高但仅与广西三黄鸡、广西麻鸡和南丹瑶鸡差异显著(P<0.05),腿肌剪切力最高的为广西麻鸡,且除与龙胜凤鸡差异不显著(P>0.05)外和其他品种鸡都差异显著(P<0.05);霞烟鸡胸肌和腿肌的电导率45 min都显著高于其他品种(P<0.05)。由此可知,广西麻鸡和广西三黄鸡胸肌腿肌的色泽鲜亮,霞烟鸡公鸡胸肌部位风味相对较好,而腿肌部位则是东兰乌鸡风味较好,龙胜凤鸡公鸡和霞烟鸡母鸡的肌肉电导率较高,一定程度上反映出肌肉系水能力弱。

广西6个地方鸡品种的120日龄体尺性状测定及比较分析

为了研究广西地方鸡品种120日龄体尺性状,以及探究各体尺性状之间的相关性。对广西地方鸡品种南丹瑶鸡、霞烟鸡、广西三黄鸡、龙胜凤鸡、广西麻鸡、东兰乌鸡在120日龄的体重、体尺共8个性状进行测定分析。结果:除了南丹瑶鸡母鸡髋宽显著大于公鸡外(p<0.05),其它体重体尺性状公鸡均显著大于母鸡(p<0.05)。霞烟鸡体重、体尺指标变异系数在6个地方鸡品种中最小(<10%)。6个品种公母鸡的体重在体重体尺指标中变异系数均最大,此外龙胜凤鸡母鸡髋宽变异系数(10.47%)明显大于其他品种。比较6个品种公母鸡体重体尺性状,发现在部分品种中同一体尺性状间无显著性差异(p>0.05)。结果表明,6个品种地方鸡胫长和胫围与其他体尺性状之间的相关性较低,在有些品种中相关性不显著(p>0.05),除胫长、胫围外其他体重体尺性状间均存在极显著相关(p<0.01)。

南丹瑶鸡蛋品质性状相关SNP的筛选

为了探讨南丹瑶鸡优良蛋品质的分子基础,试验以256只产蛋期南丹瑶鸡为研究对象,测定其在整个产蛋周期(24~60周)所产蛋的蛋品质,同时翅静脉采血提取基因组DNA,利用多重PCR技术检测与蛋品质相关基因的SNP位点,并对SNP位点与蛋白高度、蛋黄颜色、蛋壳厚度、蛋壳强度、蛋形指数、蛋重及哈氏单位等7个蛋品质性状进行关联分析。结果表明:南丹瑶鸡蛋品质变异大。蛋白高度分别在32,40,48,52,56周龄关联到的显著SNP位点有1,2,1,1,1个;蛋黄颜色分别在28,56,60周龄关联到的显著SNP位点有1,2,1;蛋壳厚度分别在40,60周龄关联到的显著SNP位点有6,2个;蛋壳强度分别在36,48,56周龄关联到的显著SNP位点有2,1,1个;蛋形指数分别在24,32,40周龄关联到的显著SNP位点有1,1,1个;蛋重分别在32,48,56周龄关联到的显著SNP位点有2,1,2个;哈氏单位分别在36,40,48,56周龄关联到的显著SNP位点有1,1,1,1个。南丹瑶鸡具有优秀的蛋品质,筛选得到的与不同周龄南丹瑶鸡蛋品质显著相关的SNP位点有chr165234293、chr165234317、chr165234336、chr165258207、chr168526266、chr168526267、chr168526344、chr168526357、chr185290991、chr123349578、chr123351761、chr416561900、chr416561922、chr416562030、chr416562070、chr94769768、chr94771619、chr94771623、chr94771738、chr94771779、chr94772495共21个。说明试验筛选出的SNP位点可用于南丹瑶鸡的育种。

广西麻鸡STMN2基因克隆、生物信息学及组织表达分析

为了探究Stathmin-like 2(STMN2)在广西麻鸡中的蛋白结构和组织表达水平,本研究克隆了广西麻鸡STMN2基因并进行生物信息和组织表达谱分析。通过克隆获得STMN2基因CDS序列全长,利用qRTPCR分析STMN2基因在不同组织中的表达水平。结果显示,STMN2基因编码区序列全长540bp,共编码179个氨基酸。生物信息学分析表明,广西麻鸡STMN2氨基酸序列与原鸡、雉鸡、绿头鸭、鸽、人、小鼠的同源性分别为99.3%、98.8%、96.1%、97.8%、85.7%、87.9%。进化树分析结果显示,STMN2基因在禽类和哺乳类之间存在明显的遗传距离,其中广西麻鸡与原鸡的亲缘关系最近,与雏鸡的亲缘关系较近,鸽和绿头鸭次之。STMN2蛋白的分子质量20.88 ku,等电点为8.72,是不具有跨膜结构和信号肽的不稳定亲水碱性蛋白。qRT-PCR结果显示,STMN2基因在脑中表达量最高,显著高于其他组织或器官。本实验结果为进一步研究鸡STMN2基因功能提供了理论参考。

广西麻鸡kpna3基因克隆、生物信息学及组织表达分析

为了探究广西麻鸡核转运蛋白α3(karyopherin subunit alpha 3, kpna3)的结构和组织表达谱,试验采集了6只120日龄广西麻鸡的大脑、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、胰腺、睾丸、肾脏、腺胃、肌胃、胸肌、腿肌、腹脂、背部皮脂组织,克隆了kpna3基因并进行生物信息学和组织表达谱分析。结果表明:kpna3基因全长1 572 bp,共编码523个氨基酸。kpna3基因序列与原鸡、雉鸡、绿头鸭、鸽、人和小鼠的相似性分别为99.6%、98.3%、95.9%、95.4%、88.1%和88.5%;与原鸡的亲缘关系最近,其次是雉鸡,然后依次绿头鸭和野鸽;kpna3蛋白分子质量为35.86 ku,等电点为9.43,为不稳定的亲水碱性蛋白,不含跨膜结构和信号肽。kpna3基因在广西麻鸡大脑、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、胰腺、睾丸、肾脏、腺胃、肌胃、胸肌、腿肌、腹脂、背部皮脂14个组织中均有表达,在肌胃中表达量显著高于其他组织(P<0.05)。说明成功克隆广西麻鸡kpna3基因的编码区(coding sequence, CDS)序列,在肌胃组织中表达量高可能与基因功能有关。

广西麻鸡FOXL2基因的克隆、序列分析及在高低产蛋量卵巢中的表达

为了研究鸡FOXL2基因的结构和功能,本研究克隆了广西麻鸡FOXL2基因编码区序列,分析了其突变位点及与其他物种的同源性和进化距离,以及在高产组和低产组母鸡卵巢组织中的表达水平。结果表明:广西麻鸡FOXL2基因的编码区长度为918 bp,共编码305个氨基酸,存在一处错义突变和两处同义突变。通过物种间的同源性分析显示,广西麻鸡FOXL2基因与原鸡(Gallus gallus)、雉鸡(Phasianus colchicus)、绿头鸭(Anas platyrhynchos)、野鸽(Columba livia)、人(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)的同源性分别为99.7%、98.8%、95.1%、92.0%、75.7%、75.5%。通过种间进化树分析表明,广西麻鸡与原鸡(Gallus gallus)的亲缘关系最近,与小鼠(Mus musculus)的亲缘关系最远。FOXL2在高低产蛋量鸡卵巢中的表达水平结果显示:FOXL2基因在高产蛋组中的表达量显著高于低产蛋组中的表达量(P<0.05)。该研究结果提示鸡FOXL2的序列相对较保守,对卵巢功能的维持和提高产蛋量具有功能性作用。