青海沙地白刺根际解淀粉芽孢杆菌DGL1的牧草促生活性及其基因组分析

本研究测定了分离自青海大格勒干旱沙地白刺(Nitraria tangutorum)根围的解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)DGL1的生物学活性,并对菌株DGL1进行全基因组测序拼接分析。结果表明:通过平板对峙法测定菌株拮抗瓜类枯萎病菌(Fusarium oxysporum)、锐顶镰孢病菌(Fusarium acuminatum)、小麦赤霉病菌(Fusarium graminearum)活性,发现DGL1对3种病原真菌均具拮抗活性(抑菌圈平均直径均>26 mm);采用羧甲基纤维素钠培养基测定菌株降解纤维素活性,发现菌株具有一定的降解纤维素活性;改良阿须贝(Ashby)无氮培养基检测证明菌株有固氮活性。对菌株促高原牧草燕麦(Avena sativa)、冷地早熟禾(Poa crymophila)、紫羊茅(Festuca rubra)、中华羊茅(Festuca sinensis)生长活性进行分析,发现DGL1具有促进4种牧草种子萌发和幼苗生长的能力;采用二代测序平台Illumina Hiseq×10对菌株DGL1进行全基因组测序拼接分析,表明菌株DGL1基因组DNA全长3915550 bp,GC含量为46.47%,CDS数量为3972,有86个tRNA,27个rRNA,与COG,GO,KEGG数据库比对分别注释到2970,2926,2160个功能基因。本研究结合生物特性与基因组分析对菌株DGL1进行了促生和抑菌相关功能基因预测,为其促牧草生长提供了理论依据。