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藜麦SOD家族基因的鉴定及其对混合盐碱胁迫的响应
被引量:
1
1
作者
邓玉荣
韩联
+5 位作者
王金龙
韦兴翰
王旭东
赵颖
魏小红
李朝周
《中国农业科技导报》
CSCD
北大核心
2024年第1期28-39,共12页
超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)是植物抗氧化系统的关键酶,在保护植物免受生物和非生物胁迫方面发挥重要作用。以拟南芥SOD为基础,通过序列比对在藜麦基因组中鉴定出12个SOD基因,分别定位于细胞核、微体及线粒体,在11条染色...
超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)是植物抗氧化系统的关键酶,在保护植物免受生物和非生物胁迫方面发挥重要作用。以拟南芥SOD为基础,通过序列比对在藜麦基因组中鉴定出12个SOD基因,分别定位于细胞核、微体及线粒体,在11条染色体上不均匀分布,其编码蛋白质三级结构显示Cu/Zn-SODs与Fe-SODs为同源二聚体,Mn-SODs为同源四聚体。CqSOD基因内含子/外显子分布模式不尽相同,内含子数介于4~7个,保守基序差异明显。系统发育关系显示,SOD蛋白可分为Cu/Zn-SODs、Fe-SODs及Mn-SODs 3个亚族。此外,所有的CqFe-SODs及CqMn-SODs启动子区都含有脱落酸激素反应顺式元件,CqSOD12与11个CqSOD蛋白及4个CqCAT蛋白存在相互作用。表达谱分析表明,12个CqSOD基因对混合盐碱及硝普钠均有较强响应。研究结果为SOD基因在植物发育和胁迫响应中的作用及分子机制研究奠定基础。
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关键词
藜麦
SOD家族基因
盐碱胁迫
生物信息学分析
表达分析
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职称材料
题名
藜麦SOD家族基因的鉴定及其对混合盐碱胁迫的响应
被引量:
1
1
作者
邓玉荣
韩联
王金龙
韦兴翰
王旭东
赵颖
魏小红
李朝周
机构
甘肃农业大学生命科学技术学院
甘肃农业大学
出处
《中国农业科技导报》
CSCD
北大核心
2024年第1期28-39,共12页
基金
甘肃农业大学省级大学生创新创业训练计划项目(S202010733077)
甘肃农业大学干旱生境作物学重点实验室开放基金课题项目(GSCS-2021-10)。
文摘
超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)是植物抗氧化系统的关键酶,在保护植物免受生物和非生物胁迫方面发挥重要作用。以拟南芥SOD为基础,通过序列比对在藜麦基因组中鉴定出12个SOD基因,分别定位于细胞核、微体及线粒体,在11条染色体上不均匀分布,其编码蛋白质三级结构显示Cu/Zn-SODs与Fe-SODs为同源二聚体,Mn-SODs为同源四聚体。CqSOD基因内含子/外显子分布模式不尽相同,内含子数介于4~7个,保守基序差异明显。系统发育关系显示,SOD蛋白可分为Cu/Zn-SODs、Fe-SODs及Mn-SODs 3个亚族。此外,所有的CqFe-SODs及CqMn-SODs启动子区都含有脱落酸激素反应顺式元件,CqSOD12与11个CqSOD蛋白及4个CqCAT蛋白存在相互作用。表达谱分析表明,12个CqSOD基因对混合盐碱及硝普钠均有较强响应。研究结果为SOD基因在植物发育和胁迫响应中的作用及分子机制研究奠定基础。
关键词
藜麦
SOD家族基因
盐碱胁迫
生物信息学分析
表达分析
Keywords
Chenopodium quinoa
SOD family genes
salt-alkaline stress
bioinformatics analysis
expression analysis
分类号
S519 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
藜麦SOD家族基因的鉴定及其对混合盐碱胁迫的响应
邓玉荣
韩联
王金龙
韦兴翰
王旭东
赵颖
魏小红
李朝周
《中国农业科技导报》
CSCD
北大核心
2024
1
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