猪METTL3基因生物信息学分析及靶基因预测

[目的]获得猪METTL3蛋白理化性质、二、三级结构、蛋白保守性、甲基化位点及靶基因等信息,为进一步了解猪METTL3基因的功能提供了理论依据。[方法]利用生物信息学软件对猪METTL3蛋白质的理化性质、二、三级结构及保守结构域、甲基化位点、蛋白互作和靶基因等进行预测分析。[结果]猪METTL3为亲水性不稳定蛋白,主要由无规卷曲和α-螺旋、β-转角构成,主要存在于细胞核中,与METTL14、WTAP和POLR2B等蛋白具有互作关系。METTL3有4个高可信度m^(6)A位点,经M6A2 Target软件预测该基因与CASP1、PYCR1、RANBP2、LIRB4、APOBEC3A、ADAM19等134个基因存在靶向关系。[结论]猪METTL3是一种主要存在于细胞核中的亲水性不稳定蛋白,主要通过m^(6)A甲基化修饰作用于靶基因而发挥作用。