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大叶桉根、茎、叶转录组比较和AP 2/ERF基因家族分析
1
作者
陈欢
张健
+4 位作者
黄恒成
唐正涛
韦联健
周韬
邓紫宇
《福建林业科技》
2024年第1期1-8,共8页
2021年对广西六峰山林场的大叶桉(Eucalyptus robusta)进行采样,采用Hiseq 2000对大叶桉根、茎、叶组织分别进行转录组测序。结果获得40786个Unigene;通过数据库比对,共注释了31662个Unigene。GO注释结果最多的条目为膜组成部分;KEGG注...
2021年对广西六峰山林场的大叶桉(Eucalyptus robusta)进行采样,采用Hiseq 2000对大叶桉根、茎、叶组织分别进行转录组测序。结果获得40786个Unigene;通过数据库比对,共注释了31662个Unigene。GO注释结果最多的条目为膜组成部分;KEGG注释结果表明,5654条序列参与129条代谢通路,参与基因最多的通路为核糖体。对比分析大叶桉根部和茎,以及根部和叶之间的转录差异,发现多条富集的通路,包括α-亚麻酸代谢和萜类骨架生物合成等。鉴定出AP 2/ERF家族基因84个,其中AP 2家族含有9个基因,RAV家族含有2个基因,ERF家族包含73个基因,各基因家族在根茎叶中的表达模式有所差异。
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关键词
大叶桉
转录组比较
AP
2/ERF基因家族
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题名
大叶桉根、茎、叶转录组比较和AP 2/ERF基因家族分析
1
作者
陈欢
张健
黄恒成
唐正涛
韦联健
周韬
邓紫宇
机构
广西林业集团有限公司桂钦林浆纸有限公司
广西壮族自治区林业科学研究院、广西南宁桉树森林生态系统定位观测研究站广西优良用材林资源培育重点实验室
海南大学林学院
出处
《福建林业科技》
2024年第1期1-8,共8页
基金
广西林业科技推广示范项目(桂林科研[2022]第10号)
海南省重点研发项目(ZDYF2020046)。
文摘
2021年对广西六峰山林场的大叶桉(Eucalyptus robusta)进行采样,采用Hiseq 2000对大叶桉根、茎、叶组织分别进行转录组测序。结果获得40786个Unigene;通过数据库比对,共注释了31662个Unigene。GO注释结果最多的条目为膜组成部分;KEGG注释结果表明,5654条序列参与129条代谢通路,参与基因最多的通路为核糖体。对比分析大叶桉根部和茎,以及根部和叶之间的转录差异,发现多条富集的通路,包括α-亚麻酸代谢和萜类骨架生物合成等。鉴定出AP 2/ERF家族基因84个,其中AP 2家族含有9个基因,RAV家族含有2个基因,ERF家族包含73个基因,各基因家族在根茎叶中的表达模式有所差异。
关键词
大叶桉
转录组比较
AP
2/ERF基因家族
Keywords
Eucalyptus robusta
transcriptome comp arison
AP 2/ERF gene family
分类号
S792.39 [农业科学—林木遗传育种]
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题名
作者
出处
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被引量
操作
1
大叶桉根、茎、叶转录组比较和AP 2/ERF基因家族分析
陈欢
张健
黄恒成
唐正涛
韦联健
周韬
邓紫宇
《福建林业科技》
2024
0
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