一株褐家鼠戊型肝炎病毒的发现鉴定及系统发生分析

对云南省大理市小型哺乳动物携带的戊型肝炎病毒(HEV)进行调查,用巢式RT-PCR对捕获的小型哺乳动物样品中的病毒进行检测,用高通量测序对阳性HEV样本进行毒株全基因组测序,用MEGA-X、BESTv1.10.4和Geneious软件进行生物信息学分析。本研究筛查了6属7种共114只小型哺乳动物样本,结果显示:HEV在褐家鼠中的阳性率为8.00%(2/25);高通量测序获得1株编号为DL147的HEV全基因组,经系统发生分析确定其为HEV-C1基因型,与香港1例戊型肝炎患者血清中发现的HEV同源性最高,核苷酸序列一致性达95.21%,两株病毒的最早分歧时间约为2003年。研究证实,云南省大理市褐家鼠存在HEV-C1感染,其与近期报道的人源新发HEV高度同源,有较近的系统发生关系,对戊型肝炎防控有指导作用。