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基于机器学习识别与振荡剪切应力相关的特征基因
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作者 毛波 贺一鸣 +2 位作者 孙滔 韩孟桃 王东海 《临床医学进展》 2024年第7期888-900,共13页
背景:动脉粥样硬化(AS)是中风的根本原因,而振荡剪切应力或低剪切应力是动脉粥样硬化的原因之一。我们研究的目的是通过机器学习筛选出受剪切应力调控的基因,并分析其生物学功能,以帮助动脉粥样硬化的诊断和治疗。方法:从基因表达综合... 背景:动脉粥样硬化(AS)是中风的根本原因,而振荡剪切应力或低剪切应力是动脉粥样硬化的原因之一。我们研究的目的是通过机器学习筛选出受剪切应力调控的基因,并分析其生物学功能,以帮助动脉粥样硬化的诊断和治疗。方法:从基因表达综合数据库(GEO)中检索了GSE20739、GSE16706和GSE1518数据集。首先使用limma软件包筛选差异基因,然后使用蛋白质–蛋白质相互作用(PPI)网络删除一些不相互作用的基因。利用三种机器学习算法——最小绝对收缩和选择算子(LASSO)、随机森林和支持向量机(SVM)——筛选特征基因。通过受试者工作特征(ROC)曲线评估特征基因的诊断性能。结果:筛选出四个受剪切应力调控的特征基因(ADM, RAMP2, GNA14, FABP5),这些基因与动脉粥样硬化相关。ADM和GNA14与振荡剪切应力之间存在强相关性,ADM和FABP5之间存在基因共表达。结论:我们的研究识别了四个受剪切应力调控的基因,这些基因影响动脉粥样硬化的发生和发展,这可能有助于未来动脉粥样硬化的预防和治疗。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 内皮细胞 震荡剪切应力 层流剪切应力 机器学习 基因
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缺血型烟雾病脑血管搭桥术后并发症危险因素分析 被引量:5
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作者 刘恺宁 孙涛 +4 位作者 韩孟桃 张平 赵鹏 王东海 李刚 《中国现代神经疾病杂志》 CAS 北大核心 2022年第5期380-385,共6页
目的分析缺血型烟雾病患者术前相对血糖比值与脑血管搭桥术安全性之间的关系。方法以2016年12月至2019年12月在山东大学齐鲁医院神经外科住院治疗的178例缺血型烟雾病患者为观察对象,共行186例次颞浅动脉-大脑中动脉搭桥术。收集患者入... 目的分析缺血型烟雾病患者术前相对血糖比值与脑血管搭桥术安全性之间的关系。方法以2016年12月至2019年12月在山东大学齐鲁医院神经外科住院治疗的178例缺血型烟雾病患者为观察对象,共行186例次颞浅动脉-大脑中动脉搭桥术。收集患者入院时空腹血糖和糖化血清白蛋白数据、计算相对血糖比值,记录术后并发症发生率;单因素与多因素Logistic回归分析筛查术后并发症危险因素。结果术后并发症发生率为28.49%(53/186),其中,重型占8.60%(16/186),均为症状性脑梗死;轻型占19.89%(37/186),其中短暂性神经功能障碍97.30%(36/37)、硬膜下出血2.70%(1/37)。Logistic回归分析显示,高血压(OR=3.696,95%CI:1.805~7.569;P=0.000)、手术间隔<2个月(OR=2.186,95%CI:1.041~4.590;P=0.039)、相对血糖比值升高(OR=1.484,95%CI:1.071~2.058;P=0.018)是术后并发症的危险因素。结论烟雾病患者急性缺血性发作后脑血管搭桥术时间可延长至2个月后,同时关注术前相对血糖比值、严格控制围手术期血压,以降低术后并发症发生风险。 展开更多
关键词 脑底异常血管网病 卒中 脑缺血 血糖 脑血管重建术 手术后并发症 LOGISTIC模型
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