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骨髓增生异常综合征的特征基因筛选及分析 被引量:1
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作者 张飞飞 袁红 +1 位作者 谢映春 韩润川 《国际检验医学杂志》 CAS 2023年第17期2122-2128,共7页
目的筛选骨髓增生异常综合征(MDS)患者的疾病特征基因并分析其与免疫细胞浸润的关系。方法从高通量基因表达数据库(GEO)中下载MDS患者及健康人的基因表达谱数据。应用生物信息学的方法对表达谱数据进行差异基因、加权基因共表达网络(WGC... 目的筛选骨髓增生异常综合征(MDS)患者的疾病特征基因并分析其与免疫细胞浸润的关系。方法从高通量基因表达数据库(GEO)中下载MDS患者及健康人的基因表达谱数据。应用生物信息学的方法对表达谱数据进行差异基因、加权基因共表达网络(WGCNA)及免疫细胞浸润分析。初步探究MDS的疾病特征基因。结果该研究共获得88个差异表达基因(DEGs),其中上调基因11个,下调基因77个。基因本体(GO)富集分析显示,DEGs在生物学过程层面主要富集于免疫应答、信号通路传导等;在细胞组分层面,DEGs主要在细胞质膜外侧面执行功能;在分子功能层面主要是结合DNA及蛋白质。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果显示,DEGs主要富集于原发性免疫缺陷、造血细胞谱系、B细胞受体信号传导等。WGCNA分析及Lasso回归筛选出4个关键的下调基因,分别是AKAP12、ARPP21、MME、NPY。免疫浸润显示AKAP12、ARPP21、MME、NPY与活化B细胞、成熟B细胞、记忆B细胞、嗜酸性粒细胞、Ⅱ型辅助T细胞、Treg细胞、活化的CD4^(+)T细胞呈正相关,与效应记忆型CD8^(+)T细胞、中央记忆T细胞(CD4^(+)与CD8^(+))、成熟的树突状细胞、Ⅰ型辅助T细胞呈负相关。结论该研究通过WGCNA及Lasso分析筛选出了骨髓增生异常综合征患者中4种特征基因:AKAP12、ARPP21、MME、NPY,这些基因与免疫细胞之间有一定的相关性。以上研究结果对深入了解MDS的发病机制及预后评估具有一定的参考价值。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 加权基因共表达网络分析 核心基因 免疫浸润
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高效液相色谱-荧光法测定多囊卵巢综合征患者血浆中吲哚类物质
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作者 韩润川 班艳娜 +3 位作者 甄乾娜 周莹 张晓清 丁敏 《色谱》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1337-1342,共6页
建立了一种同时测定血浆吲哚类物质(吲哚丙酸、吲哚乙酸、吲哚与3-甲基吲哚)的高效液相色谱-荧光法(HPLC-FLD)。以液-液萃取法进行样本预处理,采用Shim-pack VP-ODS色谱柱(150 mm×4.6 mm, 4.6μm)分离,流动相为15 mmol/L磷酸二氢... 建立了一种同时测定血浆吲哚类物质(吲哚丙酸、吲哚乙酸、吲哚与3-甲基吲哚)的高效液相色谱-荧光法(HPLC-FLD)。以液-液萃取法进行样本预处理,采用Shim-pack VP-ODS色谱柱(150 mm×4.6 mm, 4.6μm)分离,流动相为15 mmol/L磷酸二氢钠溶液-甲醇(42∶58, v/v),柱温为30℃,流速为0.8 mL/min。吲哚丙酸、吲哚乙酸、吲哚与3-甲基吲哚在各自范围内线性关系良好。该方法的日内与日间相对标准偏差均小于6.31%,平均回收率为97.5%~107.0%。利用该方法对多囊卵巢综合征(PCOS)患者(n=61)与作为对照的正常育龄期女性(n=25)的血浆样本进行测定,结果发现PCOS患者血浆吲哚类物质显著高于对照组,其中吲哚是PCOS的危险因子和潜在的诊断标志物。该方法操作简便,灵敏度高,适用于临床检测和实验室研究。 展开更多
关键词 高效液相色谱-荧光法 多囊卵巢综合征 吲哚类物质 血浆
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妊娠期乙型肝炎患者血清免疫因子检测的临床意义
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作者 刘宗能 周晓梅 韩润川 《国际检验医学杂志》 CAS 2022年第S01期59-61,共3页
目的 探讨妊娠期乙型肝炎患者免疫球蛋白lgE、lgM、lgA、lgG和补体C3、C4与C反应蛋白(CRP)等免疫因子水平的变化,了解免疫因子之间及它们与疾病的关系。方法 用免疫凝集法检测31例妊娠期乙型肝炎患者和20例健康孕妇血浆中的免疫因子。结... 目的 探讨妊娠期乙型肝炎患者免疫球蛋白lgE、lgM、lgA、lgG和补体C3、C4与C反应蛋白(CRP)等免疫因子水平的变化,了解免疫因子之间及它们与疾病的关系。方法 用免疫凝集法检测31例妊娠期乙型肝炎患者和20例健康孕妇血浆中的免疫因子。结果 妊娠期乙型肝炎患者的lgE、lgM、lgA、lgG、C3、C4和CRP水平明显高于健康孕妇。结论 免疫因子的检测有助于了解妊娠期乙型肝炎患者病情,对于指导治疗,改善预后可能具有重要的临床价值。 展开更多
关键词 免疫因子 乙型肝炎 妊娠期
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