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骨髓增生异常综合征的特征基因筛选及分析
被引量:
1
1
作者
张飞飞
袁红
+1 位作者
谢映春
韩润川
《国际检验医学杂志》
CAS
2023年第17期2122-2128,共7页
目的筛选骨髓增生异常综合征(MDS)患者的疾病特征基因并分析其与免疫细胞浸润的关系。方法从高通量基因表达数据库(GEO)中下载MDS患者及健康人的基因表达谱数据。应用生物信息学的方法对表达谱数据进行差异基因、加权基因共表达网络(WGC...
目的筛选骨髓增生异常综合征(MDS)患者的疾病特征基因并分析其与免疫细胞浸润的关系。方法从高通量基因表达数据库(GEO)中下载MDS患者及健康人的基因表达谱数据。应用生物信息学的方法对表达谱数据进行差异基因、加权基因共表达网络(WGCNA)及免疫细胞浸润分析。初步探究MDS的疾病特征基因。结果该研究共获得88个差异表达基因(DEGs),其中上调基因11个,下调基因77个。基因本体(GO)富集分析显示,DEGs在生物学过程层面主要富集于免疫应答、信号通路传导等;在细胞组分层面,DEGs主要在细胞质膜外侧面执行功能;在分子功能层面主要是结合DNA及蛋白质。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果显示,DEGs主要富集于原发性免疫缺陷、造血细胞谱系、B细胞受体信号传导等。WGCNA分析及Lasso回归筛选出4个关键的下调基因,分别是AKAP12、ARPP21、MME、NPY。免疫浸润显示AKAP12、ARPP21、MME、NPY与活化B细胞、成熟B细胞、记忆B细胞、嗜酸性粒细胞、Ⅱ型辅助T细胞、Treg细胞、活化的CD4^(+)T细胞呈正相关,与效应记忆型CD8^(+)T细胞、中央记忆T细胞(CD4^(+)与CD8^(+))、成熟的树突状细胞、Ⅰ型辅助T细胞呈负相关。结论该研究通过WGCNA及Lasso分析筛选出了骨髓增生异常综合征患者中4种特征基因:AKAP12、ARPP21、MME、NPY,这些基因与免疫细胞之间有一定的相关性。以上研究结果对深入了解MDS的发病机制及预后评估具有一定的参考价值。
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关键词
骨髓增生异常综合征
加权基因共表达网络分析
核心基因
免疫浸润
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职称材料
高效液相色谱-荧光法测定多囊卵巢综合征患者血浆中吲哚类物质
2
作者
韩润川
班艳娜
+3 位作者
甄乾娜
周莹
张晓清
丁敏
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期1337-1342,共6页
建立了一种同时测定血浆吲哚类物质(吲哚丙酸、吲哚乙酸、吲哚与3-甲基吲哚)的高效液相色谱-荧光法(HPLC-FLD)。以液-液萃取法进行样本预处理,采用Shim-pack VP-ODS色谱柱(150 mm×4.6 mm, 4.6μm)分离,流动相为15 mmol/L磷酸二氢...
建立了一种同时测定血浆吲哚类物质(吲哚丙酸、吲哚乙酸、吲哚与3-甲基吲哚)的高效液相色谱-荧光法(HPLC-FLD)。以液-液萃取法进行样本预处理,采用Shim-pack VP-ODS色谱柱(150 mm×4.6 mm, 4.6μm)分离,流动相为15 mmol/L磷酸二氢钠溶液-甲醇(42∶58, v/v),柱温为30℃,流速为0.8 mL/min。吲哚丙酸、吲哚乙酸、吲哚与3-甲基吲哚在各自范围内线性关系良好。该方法的日内与日间相对标准偏差均小于6.31%,平均回收率为97.5%~107.0%。利用该方法对多囊卵巢综合征(PCOS)患者(n=61)与作为对照的正常育龄期女性(n=25)的血浆样本进行测定,结果发现PCOS患者血浆吲哚类物质显著高于对照组,其中吲哚是PCOS的危险因子和潜在的诊断标志物。该方法操作简便,灵敏度高,适用于临床检测和实验室研究。
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关键词
高效液相色谱-荧光法
多囊卵巢综合征
吲哚类物质
血浆
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职称材料
妊娠期乙型肝炎患者血清免疫因子检测的临床意义
3
作者
刘宗能
周晓梅
韩润川
《国际检验医学杂志》
CAS
2022年第S01期59-61,共3页
目的 探讨妊娠期乙型肝炎患者免疫球蛋白lgE、lgM、lgA、lgG和补体C3、C4与C反应蛋白(CRP)等免疫因子水平的变化,了解免疫因子之间及它们与疾病的关系。方法 用免疫凝集法检测31例妊娠期乙型肝炎患者和20例健康孕妇血浆中的免疫因子。结...
目的 探讨妊娠期乙型肝炎患者免疫球蛋白lgE、lgM、lgA、lgG和补体C3、C4与C反应蛋白(CRP)等免疫因子水平的变化,了解免疫因子之间及它们与疾病的关系。方法 用免疫凝集法检测31例妊娠期乙型肝炎患者和20例健康孕妇血浆中的免疫因子。结果 妊娠期乙型肝炎患者的lgE、lgM、lgA、lgG、C3、C4和CRP水平明显高于健康孕妇。结论 免疫因子的检测有助于了解妊娠期乙型肝炎患者病情,对于指导治疗,改善预后可能具有重要的临床价值。
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关键词
免疫因子
乙型肝炎
妊娠期
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职称材料
题名
骨髓增生异常综合征的特征基因筛选及分析
被引量:
1
1
作者
张飞飞
袁红
谢映春
韩润川
机构
四川省医学科学院·四川省人民医院输血科
陕西省中医医院检验科
出处
《国际检验医学杂志》
CAS
2023年第17期2122-2128,共7页
基金
中国医学科学院创新工程项目(2016-I2M-3-024)。
文摘
目的筛选骨髓增生异常综合征(MDS)患者的疾病特征基因并分析其与免疫细胞浸润的关系。方法从高通量基因表达数据库(GEO)中下载MDS患者及健康人的基因表达谱数据。应用生物信息学的方法对表达谱数据进行差异基因、加权基因共表达网络(WGCNA)及免疫细胞浸润分析。初步探究MDS的疾病特征基因。结果该研究共获得88个差异表达基因(DEGs),其中上调基因11个,下调基因77个。基因本体(GO)富集分析显示,DEGs在生物学过程层面主要富集于免疫应答、信号通路传导等;在细胞组分层面,DEGs主要在细胞质膜外侧面执行功能;在分子功能层面主要是结合DNA及蛋白质。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果显示,DEGs主要富集于原发性免疫缺陷、造血细胞谱系、B细胞受体信号传导等。WGCNA分析及Lasso回归筛选出4个关键的下调基因,分别是AKAP12、ARPP21、MME、NPY。免疫浸润显示AKAP12、ARPP21、MME、NPY与活化B细胞、成熟B细胞、记忆B细胞、嗜酸性粒细胞、Ⅱ型辅助T细胞、Treg细胞、活化的CD4^(+)T细胞呈正相关,与效应记忆型CD8^(+)T细胞、中央记忆T细胞(CD4^(+)与CD8^(+))、成熟的树突状细胞、Ⅰ型辅助T细胞呈负相关。结论该研究通过WGCNA及Lasso分析筛选出了骨髓增生异常综合征患者中4种特征基因:AKAP12、ARPP21、MME、NPY,这些基因与免疫细胞之间有一定的相关性。以上研究结果对深入了解MDS的发病机制及预后评估具有一定的参考价值。
关键词
骨髓增生异常综合征
加权基因共表达网络分析
核心基因
免疫浸润
Keywords
myelodysplastic syndromes
WGCNA
Hub gene
immune infiltration
分类号
R551.3 [医药卫生—血液循环系统疾病]
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职称材料
题名
高效液相色谱-荧光法测定多囊卵巢综合征患者血浆中吲哚类物质
2
作者
韩润川
班艳娜
甄乾娜
周莹
张晓清
丁敏
机构
重庆医科大学检验医学院
重庆医科大学附属第一医院生殖健康与不孕症专科
重庆医科大学附属第一医院内分泌科
出处
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第12期1337-1342,共6页
基金
重庆市教育委员会科学技术研究青年项目(2018-9-76)
重庆市研究生科研创新项目(CQCYS17137)~~
文摘
建立了一种同时测定血浆吲哚类物质(吲哚丙酸、吲哚乙酸、吲哚与3-甲基吲哚)的高效液相色谱-荧光法(HPLC-FLD)。以液-液萃取法进行样本预处理,采用Shim-pack VP-ODS色谱柱(150 mm×4.6 mm, 4.6μm)分离,流动相为15 mmol/L磷酸二氢钠溶液-甲醇(42∶58, v/v),柱温为30℃,流速为0.8 mL/min。吲哚丙酸、吲哚乙酸、吲哚与3-甲基吲哚在各自范围内线性关系良好。该方法的日内与日间相对标准偏差均小于6.31%,平均回收率为97.5%~107.0%。利用该方法对多囊卵巢综合征(PCOS)患者(n=61)与作为对照的正常育龄期女性(n=25)的血浆样本进行测定,结果发现PCOS患者血浆吲哚类物质显著高于对照组,其中吲哚是PCOS的危险因子和潜在的诊断标志物。该方法操作简便,灵敏度高,适用于临床检测和实验室研究。
关键词
高效液相色谱-荧光法
多囊卵巢综合征
吲哚类物质
血浆
Keywords
high performance liquid chromatography-fluorescence detection(HPLC-FLD)
polycystic ovarian syndrome(PCOS)
indoles
plasma
分类号
O658 [理学—分析化学]
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职称材料
题名
妊娠期乙型肝炎患者血清免疫因子检测的临床意义
3
作者
刘宗能
周晓梅
韩润川
机构
四川省妇幼保健院检验科
成都市第二人民医院
出处
《国际检验医学杂志》
CAS
2022年第S01期59-61,共3页
文摘
目的 探讨妊娠期乙型肝炎患者免疫球蛋白lgE、lgM、lgA、lgG和补体C3、C4与C反应蛋白(CRP)等免疫因子水平的变化,了解免疫因子之间及它们与疾病的关系。方法 用免疫凝集法检测31例妊娠期乙型肝炎患者和20例健康孕妇血浆中的免疫因子。结果 妊娠期乙型肝炎患者的lgE、lgM、lgA、lgG、C3、C4和CRP水平明显高于健康孕妇。结论 免疫因子的检测有助于了解妊娠期乙型肝炎患者病情,对于指导治疗,改善预后可能具有重要的临床价值。
关键词
免疫因子
乙型肝炎
妊娠期
Keywords
immune factors
hepatitis B
pregnancy
分类号
R71 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
骨髓增生异常综合征的特征基因筛选及分析
张飞飞
袁红
谢映春
韩润川
《国际检验医学杂志》
CAS
2023
1
下载PDF
职称材料
2
高效液相色谱-荧光法测定多囊卵巢综合征患者血浆中吲哚类物质
韩润川
班艳娜
甄乾娜
周莹
张晓清
丁敏
《色谱》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
下载PDF
职称材料
3
妊娠期乙型肝炎患者血清免疫因子检测的临床意义
刘宗能
周晓梅
韩润川
《国际检验医学杂志》
CAS
2022
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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