人CD8^+T细胞基因调控网络研究

为研究CD8^+T细胞的功能异常机制,对功能异常状态CD8^+T细胞和3种正常CD8^+T细胞亚型[中央记忆CD8^+T细胞(HCM)、效应记忆CD8^+T细胞(HEM)和naive CD8^+T细胞(HW)]的ATAC-seq(Assay for transposase accessible chromatin with high-throughput sequencing)数据进行基因调控网络比较,结果表明,3种正常CD8^+T细胞特异表达的基因参与维持相应T细胞正常功能的信号通路,功能异常CD8^+T细胞特异的基因参与癌症相关通路。转录因子调控网络比较分析发现功能异常CD8^+T细胞GMEB2转录因子表达关闭。细胞表面受体调控网络比较分析发现功能异常CD8^+T细胞CD7和P4HB受体的表达关闭。采用基因调控网络的数据进行比较分析,发现CD8^+T细胞功能异常机制可能与GMEB2转录因子、CD7和P4HB受体表达关闭有关,这为抗病育种寻找特定基因提供新思路。

新时期初中班主任工作经验探讨

在当今社会,我国社会教育快速发展,在全国各个地区进行各种教育改革的大趋势下,班主任在新时期新形势下的管理工作至关重要。班主任是学校教育的重要成员,担任着管理各个班级的工作。特别是对于不同年龄段的学生的教育工作,年龄特点对班主任有更高的要求,需要班主任有独特的管理方法。本文主要针对新时期的初中班主任的教育管理方式进行一定的分析和讨论,希望对新时期的管理工作有所帮助。

脂多糖结合蛋白在胃癌组织中的表达及其意义的生物信息学分析

目的:通过生物信息学方法分析脂多糖结合蛋白(LBP)在胃癌组织中的表达及意义。方法:从Ualcan数据库获取正常胃组织及胃癌组织LBP表达数据,利用GEPIA数据库分析LBP表达与胃癌患者预后的关系,在LinkedOmics中检索LBP在胃癌中的共表达基因,通过GO富集分析、KEGG通路分析确定这些基因参与的生物学过程及功能。最后利用STRING数据库分析相关基因编码蛋白的互作网络。结果:与正常胃组织相比,Ⅰ和Ⅲ分期、老年和男性患者胃癌组织中LBP表达水平均明显升高,但与幽门螺杆菌感染与否无显著相关性。在胃癌中与LBP共表达的基因主要涉及急性炎症反应、激活蛋白级联、蛋白质-脂质复合物亚基组织等生物学过程,介导货物受体活性、脂多糖结合、蛋白质-脂质复合物的绑定、糖胺聚糖绑定等分子功能,富集于血液微粒、蛋白质-脂质复合物、内质网腔等细胞组分。富集的KEGG信号通路主要与补体和凝血级联、胆固醇代谢、PPAR信号等通路相关。LBP高表达患者的总生存率和无病生存率明显低于LBP低表达患者。LBP蛋白与TLR4、STAT3、IL-6、STAT6、IL-4、IL-10、JAK1、JAK2、JAK3、SOCS3等存在互作关系。结论:LBP在胃癌组织中高表达,且与胃癌的发生、发展及预后密切相关,可以作为胃癌筛选、预后预测的标志物之一。

基于网络药理学对金银花抗癌机制的研究

目的:研究金银花治疗癌症的有效成分及作用机制。方法:通过数据库检索金银花的有效成分、作用靶蛋白等信息,构建"药物-化学成分-靶蛋白-疾病"网络,进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路、基因本体(GO)富集分析,研究金银花活性成分的抗癌机制。结果:构建一种药物,23种有效活性成分,248个相应靶蛋白的"药物-化学成分-靶蛋白-疾病"网络。有效成分包括槲皮素、木犀草素、金圣草素和山柰酚等;作用靶蛋白包括肿瘤转移相关的基质金属蛋白酶(MMP2、MMP1)、肿瘤坏死因子(TNF)等;KEGG通路富集分析包括磷脂酰肌醇激酶3(PI3K)等97条通路。结论:金银花抗癌是多成分、多靶标、多途径的作用机制。

小鼠黑色素瘤功能异常CD8^+T细胞基因调控网络构建与分析

疾病是全球范围内危害畜禽健康的主要问题,解析免疫系统调控相关基因成为当前抗病分子育种的研究热点。为研究小鼠黑色素瘤模型功能异常CD8^+T细胞对免疫抗体处理的应答机制,通过基因调控网络方法筛选功能异常CD8^+T细胞在Ig G和PD1抗体处理的特定基因、转录因子和细胞表面受体。结果发现对照组、PD1抗体与Ig G抗体处理组分别有28、17、33个特定表达基因。与对照组相比,Ig G和PD1处理组有2个转录因子Zfx、Zfhx3关闭表达,PD1处理组细胞表面受体Raet1b表达。Raet1b基因的表达可能使小鼠黑色素瘤功能异常CD8^+T细胞恢复功能,结果为抗病育种的相关基因研究提供理论基础。