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布鲁氏菌介导的mmu-miR-671-5p的靶基因预测与功能富集性分析 被引量:1
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作者 赵宇 罗艺晨 +8 位作者 顾国靖 李博文 李文杰 周志雄 帅学宏 伍莉 陈吉轩 黄庆洲 焦寒伟 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第10期2843-2850,共8页
为进行布鲁氏菌介导的mmu-miR-671-5p的靶基因预测,本试验利用布鲁氏菌(Brucella)感染RAW264.7细胞后,分别运用miRanda和TargetScan软件进行差异表达的mmu-miR-671-5p靶基因的预测,预测的靶基因分别有11 953和9 252个,将预测结果取交集... 为进行布鲁氏菌介导的mmu-miR-671-5p的靶基因预测,本试验利用布鲁氏菌(Brucella)感染RAW264.7细胞后,分别运用miRanda和TargetScan软件进行差异表达的mmu-miR-671-5p靶基因的预测,预测的靶基因分别有11 953和9 252个,将预测结果取交集进行韦恩(Venn)分析,重叠部分的靶基因有3 681个;利用GO与KEGG进行功能富集性分析,再利用PicTar软件进一步对mmu-miR-671-5p的靶基因进行预测,将预测结果与Venn分析结果进一步取交集,结果显示,mmu-miR-671-5p的预测靶基因有7个;实时荧光定量PCR分别验证7个预测靶基因的相对表达量发现,Tnfrsf1b与Tnip 1基因相对表达量极显著降低(P<0.01);在RAW264.7细胞中转染mmu-miR-671-5p inhibitors,分别验证7个预测靶基因的相对表达量发现,Tnfrsf1b与Tnip 1基因的相对表达量极显著升高(P<0.01);对mmu-miR-671-5p与Tnfrsf1b和Tnip1的3′非翻译区(3′UTR)结合靶位点分别进行预测,结果初步表明,mmu-miR-671-5p的靶基因为Tnfrsf1b与Tnip 1,其预测结合靶位点均只有1个,分别位于Tnfrsf1b和Tnip1 3′UTR全长位置的91和305 bp。本研究结果为进一步揭示mmu-miR-671-5p在布鲁氏菌感染RAW264.7细胞过程中的功能提供科学依据。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 RAW264.7细胞 mmu-miR-671-5p 靶基因预测 功能富集性分析
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“科研式”教学法在动物生理学课程教学改革中的探索与实践 被引量:5
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作者 焦寒伟 周志雄 +7 位作者 顾国靖 李博文 李文杰 赵宇 伍莉 陈吉轩 帅学宏 黄庆洲 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2019年第9期118-119,F0004,共3页
动物生理学是我国动物医学和动物科学专业的核心基础理论课程,是研究生理条件下,即正常动物体的机能活动及其生命活动规律的学科,是生物学的重要分支,也是学术型研究生入学考试的专业课之一,因此,在本科教学过程中,具有十分重要的地位[1... 动物生理学是我国动物医学和动物科学专业的核心基础理论课程,是研究生理条件下,即正常动物体的机能活动及其生命活动规律的学科,是生物学的重要分支,也是学术型研究生入学考试的专业课之一,因此,在本科教学过程中,具有十分重要的地位[1-3]。作为一门核心专业基础理论课程,主要培养学生全面系统掌握动物机体各个系统、器官和细胞的正常活动过程,尤其是各个细胞和器官之间,相互调控和作用,从而在复杂的外界环境中,维持正常生命活动的机制。不仅要让学生理解知识点,还要能够学以致用,解决生产实践中的实际问题。但在科学技术快速发展的今天,随着信息化和智能化的进一步普及,传统的动物生理学教学模式,很难满足当今高等教育所要求培养的,具有原创性思维和探索型的高素质人才的目标[4-5]。因此,“科研式”教学法在新形势下,针对动物生理学课程的教学改革显得极其重要,为培养具有创新性思维、勇于探索和富有创造能力的高素质人才,提供坚实的基础和保障。 展开更多
关键词 学术型研究生 探索型 动物生理学 基础理论课程 生命活动规律 生理条件 创新性思维 入学考试
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羊种布氏杆菌介导巨噬细胞mmu-miR-146a-5p的差异表达及其靶基因的初步鉴定
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作者 焦寒伟 赵宇 +7 位作者 罗艺晨 顾国靖 李博文 李文杰 周志雄 伍莉 王红均 黄庆洲 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1320-1324,共5页
羊种布氏杆菌(Brucella melitensis,B.melitensis)感染巨噬细胞后,运用高通量测序技术挖掘出mmu-miR-146a-5p差异表达。利用TargetScan和miRDB数据库分别进行mmu-miR-146a-5p靶基因的在线预测,结果分别有224和125个,利用韦恩分析发现,2... 羊种布氏杆菌(Brucella melitensis,B.melitensis)感染巨噬细胞后,运用高通量测序技术挖掘出mmu-miR-146a-5p差异表达。利用TargetScan和miRDB数据库分别进行mmu-miR-146a-5p靶基因的在线预测,结果分别有224和125个,利用韦恩分析发现,2个数据库的在线预测结果交集有70个;进一步利用PicTar数据库进行mmumiR-146a-5p靶基因的在线预测,并与韦恩分析结果取交集;转染mmu-miR-146a-5p mimics至巨噬细胞中,通过荧光定量PCR方法检测预测靶基因的相对表达量,发现Ptpra与Tfdp2表达量显著降低,结果初步表明,mmu-miR-146a-5p的靶基因为Ptpra与Tfdp2。该试验为进一步研究mmu-miR-146a-5p在羊种布氏杆菌感染巨噬细胞过程中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 羊种布氏杆菌 巨噬细胞 mmu-miR-146a-5p Ptpra Tfdp2
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