基于关联系数的社区划分算法

不同于一般社区划分衡量标准——模块度Q值,从社区结构本质出发,提出一种用关联系数评判社区划分好坏的方法,即求社区内部连接与外部连接的关联系数。该方法不但能克服模块度Q值只适用于无向无权网络的缺陷,而且更符合社区结构的定义。

基于云聚合理论的城市社区划分算法研究

城市可以看做是由若干社区构成的一种特殊的社会网络,合理有效的城市社区划分不仅能够提高居民的生活质量,同时也有助于管理部门更好地实现城市的管理,以弥补现有城市规划存在的基础设施分配不健全等问题。根据云的形成过程提出一种创新的基于云聚合理论的城市社区划分算法,将社区节点作为个体,以水蒸气聚合成云、云重组过程为理论支撑,对节点进行逐步凝聚划分及重组,最终达到均衡稳定的状态。为验证算法的可行性,在MATLAB实验平台上进行仿真。显示提出算法的模块度量Q值为0.6572,较高于同类凝聚算法的模块度量值0.6121,表明所提算法的性能优于同类的凝聚算法,能较好地反映真实的城市社区结构,此外还能够获取优于现实社区的划分结果,更好地服务于居民和管理部门。

基于两阶段混合拍卖的虚拟网络资源分配模型

网络虚拟化技术作为解决当前网络问题的有效手段,仍有很多方面有待提高。针对虚拟网络资源分配方法在分配效率和最大化资源价值存在的问题,提出基于两阶段混合拍卖(two-stages hybrid auction,T-SHA)的虚拟网络资源分配模型,即第一阶段采用向上叫价式拍卖以及第二阶段采取第一价格密封拍卖的方式。随后结合独立私有价值模型,对混合拍卖的收益、有效性和公平性作了理论上的推导。最后由实验得出结果并推出结论:T-SHA、先到先服务的公平性指数和资源利用率分别为0.58和0.9、0.5和0.78,T-SHA更有助于提升用户之间的公平性。向上叫价拍卖、T-SHA、VCG(Vickrey-Clarke-Groves)的SP参与率分别为0.7、0.93、0.83,T-SHA可以吸引SP(service provider)的参与,从而增加拍卖的激烈程度,提高最终的成交价。

基于代理的OD矩阵反推模型

OD(Origin-Destination)矩阵是分析交通流、了解城市交通流特性并进行交通规划、管理、控制和诱导的重要基础和前提条件。基于代理有效反推OD矩阵,其依据道路外在环境和驾驶员认知、选择等内在因素对OD分布的影响,完成驾驶员对交通小区和行驶路线的决策,提出包括感知层、代理层、决策层和输出层四个层次的OD反推模型(ODABM)。实验中ODABM模型各时间段仿真车流量与路网实测车流量的平均范数平均相对误差减小到10.2%。结果表明:ODABM模型精度更高,更符合现实路网,并能反映交通流的时变性和出行目的分布,是提高交通仿真真实度的有效方法。

基于智能代理的交通分配建模

针对现有交通分配研究对驾驶员有限理性、道路交通动态随机性的忽视,提出一种基于智能代理的动态交通分配模型IATAM,其以驾驶员为代理,依据驾驶员的路线偏好,综合驾驶员信息处理的模糊随机过程,考虑邻居驾驶员影响,提出神经网络结构的驾驶员智能路线决策机制。实验中IATAM模型检测点车流量与真实车流量的平均相对误差减小到6.42%,表明IATAM模型实验精度更高,更符合复杂多变的交通环境。基于智能代理进行交通分配,更能反映驾驶员的异构性和路线决策的模糊随机性,并有效提高交通分配精度。

翻译后修饰蛋白质组学助力实现精准医疗

与基因组学相比,蛋白质组学能够即时反映病人在疾病状态与正常状态下的蛋白表达和修饰谱,从而进行精准诊断和治疗,因此在临床领域越来越具有应用前景。蛋白质组学早期聚焦于细胞不同发育时期或疾病状态下的蛋白质表达水平变化,然而,许多至关重要的生命进程不仅与蛋白质相对丰度有关,更重要的是被时空特异分布的、可逆的翻译后修饰调控。在蛋白质组学、抗体亲和色谱与质谱分析、生物信息学等跨学科知识基础上发展的PTMScan?技术,在定性、定量分析翻译后修饰蛋白质位点方面具有显著优势。介绍了PTMScan?翻译后修饰蛋白质组学技术,其能够快速、准确、高通量地分析肺癌、黑色素瘤等多种疾病中信号通路关键节点蛋白质磷酸化、乙酰化、甲基化、泛素化和类泛素化等修饰的变化,满足精准医疗与伴随诊断对于疾病生物标志物鉴定、药物靶点筛选、靶向用药指导、疾病预后指示的需求,真正实现精准医疗,将正确的药物在最恰当的时间治疗真正需要的患者。

翻译后修饰蛋白质组学研究的新技术策略

利用Cell Signaling Technology(CST)公司开发的针对蛋白质翻译后修饰(PTM)基序(motif)抗体,在肽段水平上免疫亲和富集带有不同PTM的肽段,利用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)进行定量分析,能够快速、准确、高通量地分析多种疾病相关信号通路关键节点蛋白磷酸化、乙酰化、甲基化和泛素化修饰的变化,满足创新性研究、生物标志物鉴定、药物靶点筛选和评价的需求。