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鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析
被引量:
2
1
作者
王显生
贾钰莹
+6 位作者
顾汉艳
何小玲
张桦
张巨松
石书兵
李建贵
麻浩
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期137-141,共5页
从NCBI公共数据库下载获得27904条鹰嘴豆表达序列标签EST,去除其中低质量的和冗余序列后得到全长为6198092bp的11224条无冗余EST.利用SSRIT(Simple sequence repeat identification tool)软件共在这些序列中发掘出982个SSR,它们分布于86...
从NCBI公共数据库下载获得27904条鹰嘴豆表达序列标签EST,去除其中低质量的和冗余序列后得到全长为6198092bp的11224条无冗余EST.利用SSRIT(Simple sequence repeat identification tool)软件共在这些序列中发掘出982个SSR,它们分布于865条EST中,出现频率为8.69%,平均长度为15.58bp,平均距离为6.31kb.在鹰嘴豆EST-SSR中,二核苷酸重复是最主要的重复类型(66.90%),其次是三核苷酸重复类型(30.75%),出现最多的重复基元类型是TA/AT(24.95%).
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关键词
鹰嘴豆
表达序列标签-简单重复序列
频率
特性
下载PDF
职称材料
C型凝集素受体树突细胞特异性捕获细胞间黏附分子3非整合素细胞表达模型的构建及功能研究
被引量:
3
2
作者
张宇
姚煦
+2 位作者
顾汉艳
王宝玺
刘军
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期457-460,共4页
目的构建C型凝集素受体树突细胞特异性捕获细胞间黏附分子3非整合素(DC—SIGN)细胞表达模型,为后续进行DC—SIGN蛋白受体功能研究提供基础。方法PCR扩增获得DC—SIGN分子的cDNA,克隆入真核表达载体P巨细胞病毒启动子-绿色荧光蛋白...
目的构建C型凝集素受体树突细胞特异性捕获细胞间黏附分子3非整合素(DC—SIGN)细胞表达模型,为后续进行DC—SIGN蛋白受体功能研究提供基础。方法PCR扩增获得DC—SIGN分子的cDNA,克隆入真核表达载体P巨细胞病毒启动子-绿色荧光蛋白重组质粒(PCMV—EGFP),EGFP位于Dc—SIGNN末端,转染人胚肾细胞癌I-IEK293T细胞后,流式细胞仪检测DC—SIGN重组分子的表达,激光共聚焦显微镜检测DC—SIGN—EGFP融合蛋白的细胞定位情况,并进一步检测转染表达的DC—SIGN受体对过敏原抗原的识别和内吞过程。结果构建的荧光融合蛋白重组表达质粒,经PCR及Western印迹证明DC—SIGN表达成功;经流式细胞仪检测转染DC—SIGN融合质粒的HEK293T细胞的DC—SIGN受体表达量增多(约50%)。重组表达质粒转染293T细胞后,激光共聚焦显微镜检测显示,绿色荧光标记的DC—SIGN位于细胞膜上,可结合红色荧光素标记的过敏原抗原Derp2,并可将Derp2内吞人细胞内。结论构建的DC—SIGN—EGFP融合蛋白在293T细胞内表达后具有细胞表面受体分子的特征性分布,可被DC—SIGN特异性抗体识别并具有摄取过敏原功能,是研究DC—SIGN分子功能的理想细胞模型。
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关键词
受体
有丝分裂原
重组融合蛋白质类
抗原
尘螨属
细胞系
肿瘤
原文传递
单纯疱疹病毒包膜糖蛋白gC合成及验证
被引量:
1
3
作者
张宇
姚煦
+2 位作者
顾汉艳
王宝玺
刘军
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期578-582,共5页
目的 利用基因工程技术表达单纯疱疹病毒(HSV)包膜糖蛋白(gC)并进行验证.方法 分两段合成gC蛋白,分别合成基因GC-F和GC-R,并分别将基因亚克隆进pSumo-Mut(含Stu Ⅰ和Xho Ⅰ酶切位点)和pCzn1(含Nde Ⅰ和XhoI酶切位点)表达载体,获...
目的 利用基因工程技术表达单纯疱疹病毒(HSV)包膜糖蛋白(gC)并进行验证.方法 分两段合成gC蛋白,分别合成基因GC-F和GC-R,并分别将基因亚克隆进pSumo-Mut(含Stu Ⅰ和Xho Ⅰ酶切位点)和pCzn1(含Nde Ⅰ和XhoI酶切位点)表达载体,获得pSumo-Mut-GC-F和pCzn 1-GC-R质粒.将两重组质粒转化ArcticExpress^TM(DE3)原核宿主菌,异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达目的蛋白,经Ni柱亲和纯化,最终获得高纯度蛋白.采用Western印迹法检测重组GC-F和GC-R两段蛋白与HSV IgG的结合情况.结果 应用全基因合成方法获得GC-F和GC-R基因片段,经SDS-PAGE鉴定分析,主要分布于沉淀层,经亲和层析后获得的蛋白纯度在80%以上,并可被人抗HSV-1抗体(IgG)阳性血清识别.结论 利用基因工程技术构建融合表达载体,并经IPTG诱导成功表达gC蛋白,与HSV-1感染血清反应阳性,是后续进行功能研究的理想实验材料.
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关键词
湿疹
单纯疱疹病毒属
包膜糖蛋白
原文传递
题名
鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析
被引量:
2
1
作者
王显生
贾钰莹
顾汉艳
何小玲
张桦
张巨松
石书兵
李建贵
麻浩
机构
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室
新疆农业大学农业生物技术重点实验室
出处
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期137-141,共5页
基金
国家科技支撑计划项目(2006BAD09A04
2006BAD09A08
+4 种基金
2007BAC15B06)
国家自然科学基金项目(30860152)
国家博士后科学基金项目(20080431107)
高等学校学科创新引智计划项目(教育部)
科技支疆项目(200991254)
文摘
从NCBI公共数据库下载获得27904条鹰嘴豆表达序列标签EST,去除其中低质量的和冗余序列后得到全长为6198092bp的11224条无冗余EST.利用SSRIT(Simple sequence repeat identification tool)软件共在这些序列中发掘出982个SSR,它们分布于865条EST中,出现频率为8.69%,平均长度为15.58bp,平均距离为6.31kb.在鹰嘴豆EST-SSR中,二核苷酸重复是最主要的重复类型(66.90%),其次是三核苷酸重复类型(30.75%),出现最多的重复基元类型是TA/AT(24.95%).
关键词
鹰嘴豆
表达序列标签-简单重复序列
频率
特性
Keywords
chickpea
EST-SSR
frequency
characteristics
分类号
S529.024 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
C型凝集素受体树突细胞特异性捕获细胞间黏附分子3非整合素细胞表达模型的构建及功能研究
被引量:
3
2
作者
张宇
姚煦
顾汉艳
王宝玺
刘军
机构
中国医学科学院北京协和医学院皮肤病研究所
南京大学医学院附属鼓楼医院皮肤科
出处
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期457-460,共4页
基金
国家自然科学基金(81171501)
江苏省自然科学基金(BK2011127)
文摘
目的构建C型凝集素受体树突细胞特异性捕获细胞间黏附分子3非整合素(DC—SIGN)细胞表达模型,为后续进行DC—SIGN蛋白受体功能研究提供基础。方法PCR扩增获得DC—SIGN分子的cDNA,克隆入真核表达载体P巨细胞病毒启动子-绿色荧光蛋白重组质粒(PCMV—EGFP),EGFP位于Dc—SIGNN末端,转染人胚肾细胞癌I-IEK293T细胞后,流式细胞仪检测DC—SIGN重组分子的表达,激光共聚焦显微镜检测DC—SIGN—EGFP融合蛋白的细胞定位情况,并进一步检测转染表达的DC—SIGN受体对过敏原抗原的识别和内吞过程。结果构建的荧光融合蛋白重组表达质粒,经PCR及Western印迹证明DC—SIGN表达成功;经流式细胞仪检测转染DC—SIGN融合质粒的HEK293T细胞的DC—SIGN受体表达量增多(约50%)。重组表达质粒转染293T细胞后,激光共聚焦显微镜检测显示,绿色荧光标记的DC—SIGN位于细胞膜上,可结合红色荧光素标记的过敏原抗原Derp2,并可将Derp2内吞人细胞内。结论构建的DC—SIGN—EGFP融合蛋白在293T细胞内表达后具有细胞表面受体分子的特征性分布,可被DC—SIGN特异性抗体识别并具有摄取过敏原功能,是研究DC—SIGN分子功能的理想细胞模型。
关键词
受体
有丝分裂原
重组融合蛋白质类
抗原
尘螨属
细胞系
肿瘤
Keywords
Receptors, mitogen
Recombinant fusion proteins
Antigens, dermatophagoides
Cell line, tumor
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
原文传递
题名
单纯疱疹病毒包膜糖蛋白gC合成及验证
被引量:
1
3
作者
张宇
姚煦
顾汉艳
王宝玺
刘军
机构
中国医学科学院北京协和医学院皮肤病研究所
南京大学医学院附属鼓楼医院皮肤科
出处
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期578-582,共5页
基金
国家自然科学基金(81171501)
江苏省自然科学基金(BK2011127)
文摘
目的 利用基因工程技术表达单纯疱疹病毒(HSV)包膜糖蛋白(gC)并进行验证.方法 分两段合成gC蛋白,分别合成基因GC-F和GC-R,并分别将基因亚克隆进pSumo-Mut(含Stu Ⅰ和Xho Ⅰ酶切位点)和pCzn1(含Nde Ⅰ和XhoI酶切位点)表达载体,获得pSumo-Mut-GC-F和pCzn 1-GC-R质粒.将两重组质粒转化ArcticExpress^TM(DE3)原核宿主菌,异丙基硫代半乳糖苷(IPTG)诱导表达目的蛋白,经Ni柱亲和纯化,最终获得高纯度蛋白.采用Western印迹法检测重组GC-F和GC-R两段蛋白与HSV IgG的结合情况.结果 应用全基因合成方法获得GC-F和GC-R基因片段,经SDS-PAGE鉴定分析,主要分布于沉淀层,经亲和层析后获得的蛋白纯度在80%以上,并可被人抗HSV-1抗体(IgG)阳性血清识别.结论 利用基因工程技术构建融合表达载体,并经IPTG诱导成功表达gC蛋白,与HSV-1感染血清反应阳性,是后续进行功能研究的理想实验材料.
关键词
湿疹
单纯疱疹病毒属
包膜糖蛋白
Keywords
Eczema
Simplexvirus
Glycoprotein C
分类号
R752.11 [医药卫生—皮肤病学与性病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鹰嘴豆EST资源中SSR的信息分析
王显生
贾钰莹
顾汉艳
何小玲
张桦
张巨松
石书兵
李建贵
麻浩
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010
2
下载PDF
职称材料
2
C型凝集素受体树突细胞特异性捕获细胞间黏附分子3非整合素细胞表达模型的构建及功能研究
张宇
姚煦
顾汉艳
王宝玺
刘军
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
原文传递
3
单纯疱疹病毒包膜糖蛋白gC合成及验证
张宇
姚煦
顾汉艳
王宝玺
刘军
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
原文传递
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