珠江源头入侵种波氏吻虾虎的遗传多样性分析

为了解入侵种波氏吻虾虎Rhinogobius cliffordpopei在珠江源头地区的遗传多样性分布特征及其影响成因,本研究以线粒体细胞色素b(cyt b)基因为分子标记,对珠江源头的9个水库自然种群进行了遗传多样性与遗传分化分析。获得该物种cyt b基因全序列1 141 bp,其中保守位点1 072个,变异位点69个,无插入和缺失位点。96只个体具有5个单倍型,群体单倍型多样性为0.359±0.059,核苷酸多样性为0.021±0.010,表现为低单倍型多样性与高核苷酸多样性的群体遗传特征。以外群子陵吻虾虎R.giurinus、褐吻虾虎R.brunneus和短吻红斑吻虾虎R.rubromaculatus构建的分子系统发育树和网络分支图显示,波氏吻虾虎群体的所有单倍型与外群物种分开,构成一个单系群,并分化为2个明显的系统分支。分子变异分析结果表明,种群间和种群内的遗传变异率分别为62.99%、37.01%,固定指数为0.630(P<0.01),证实波氏吻虾虎群体形成了显著的遗传分化结构。波氏吻虾虎在珠江源头入侵地具有较高的遗传多样性水平与显著的遗传结构,入侵种群可能受到了奠基者事件和遗传瓶颈效应的影响,而多次人为引入和水利大坝的隔离作用可能为该物种扩散分布和积累突变提供了条件。研究结果将为防治波氏吻虾虎的入侵危害及保护土著鱼类物种多样性提供科学指导。

小桐子MYB基因家族的鉴定及JcMYB308基因的克隆与低温表达分析

MYB转录因子家族参与植物生长发育及对环境胁迫的应答等过程。该实验基于小桐子基因组数据库,对MYB基因家族进行鉴定,克隆了小桐子Jc MYB308基因,并对其功能结构域、系统进化、基因结构及低温表达特性进行了分析。结果表明,小桐子全基因组共鉴定到213个MYB基因家族成员,聚类为6个亚家族。克隆的Jc MYB308基因片段长度为713 bp,基因结构具有较高的保守性,均含有两个外显子,进化树显示其与同属大戟科的蓖麻亲缘关系最近,序列一致性为62.7%。q RT-PCR表达分析表明,小桐子Jc MYB308基因的表达存在组织表达特异性,在根中表达量较高,而在叶片中表达量相对较低,在根与茎中低温胁迫24 h时达到最大表达量。

云贵高原银星竹鼠的遗传多样性与遗传结构研究

作为一类营地下生活的啮齿动物,银星竹鼠Rhizomys pruinosus具有较高的食用价值和药用价值,已成为我国南方地区特种经济动物养殖业的重点发展物种。以核内重组蛋白激活基因1(RAG1)的基因片段为分子标记,采用分子生物学方法,本研究对来自12个采样点的173个银星竹鼠个体进行群体遗传分析,探讨该物种群体遗传多样性和遗传结构。序列多态性分析结果显示,银星竹鼠RAG1基因部分序列848 bp,共检测出多态性位点18个,其中单突变位点3个,简约信息位点15个。遗传多样性分析表明,173份样本共统计出RAG1基因单倍型11个,单倍型多样性为0.712±0.025,核苷酸多样性为0.002 64±0.003 71,显著低于其他啮齿动物。最大似然法、邻接法和贝叶斯法构建的系统发育树显示,银星竹鼠群体分化为3个分支,其谱系地理格局出现明显分化。同时,分子变异分析结果证实,银星竹鼠种群间的遗传变异极显著高于种群内的,说明该物种存在显著的遗传结构和遗传分化水平。上述研究结果综合表明,银星竹鼠群体的遗传多样性水平较低,遗传分化结构较为显著,这可能与该物种的地下生活方式、扩散能力弱、山脉河流阻隔作用、地质气候事件等因素有关。本研究结果将为云贵高原地区物种多样性、生物多样性保护提供科学的参考依据。

南盘江破碎生境中子陵吻虾虎鱼的遗传多样性

众多的水利设施和附属高原湖泊引起南盘江流域出现严重的生境破碎。以子陵吻虾虎鱼作为研究对象,探讨南盘江流域破碎化的生境对鱼类种群遗传多样性的影响。子陵吻虾虎鱼因经济价值低而未被人工驯化,可作为评估生境破碎化影响的理想物种。以线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(COXⅠ)基因作为分子标记,对来自南盘江水系13个隔离种群子陵吻虾虎鱼的遗传多样性和遗传结构进行分析。在13个种群194尾子陵吻虾虎鱼的COXⅠ基因、Cyt b基因及联合线粒体基因中观察到了27、22、49个变异位点和11、13、26个单倍型,平均单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.691、0.813、0.881和0.0053、0.0060、0.0056。系统发育树结果均显示,子陵吻虾虎鱼的13个群体聚类为2个进化分支,但并未出现明显的地理聚类现象。分子方差分析结果表明,子陵吻虾虎鱼群体的遗传变异主要来自种群间。上述结果表明,南盘江破碎生境中的子陵吻虾虎鱼群体呈现出了较高的遗传多样性和显著的遗传分化。可能因较强的生存适应能力及稳定的有效种群大小,子陵吻虾虎鱼呈现出了较高的遗传多样性水平,同时又在较弱的迁移能力和破碎化生境的隔离效应的共同影响下,导致了子陵吻虾虎鱼种群间显著的遗传分化。

干旱胁迫对白刺花根尖细胞有丝分裂的影响

为探讨白刺花(Sophora davidii)种子萌发期对干旱的适应性,采用PEG-6000模拟干旱胁迫环境对白刺花根尖细胞有丝分裂、染色体畸变、微核变化等进行研究。结果表明,短时间(0~6 h)、低浓度(10%)胁迫对白刺花根尖细胞有丝分裂指数有促进作用,分裂指数由8.78%上升至9.09%;中度处理及长时间、高浓度胁迫致使细胞分裂指数下降,抑制效应明显,尤其当浓度达到50%时,细胞分裂指数由3.14%下降至1.96%。在染色体畸变类型中,出现类型最多是染色体断片,当PEG-6000浓度为0~20%时,白刺花根尖细胞染色体畸变率在10%以下;当浓度大于30%,染色体畸变率均在10%以上。微核的观察随处理时间和胁迫浓度的变化而变化,当PEG-6000浓度小于20%时,微核率的大小在10‰以下;当PEG-6000浓度高于20%后,微核率均大于10‰;尤其当浓度达到50%时,处理48h的微核率最高,达15.76‰,且多以间期微核和单微核为主。

植物质体型ω-3脂肪酸去饱和酶7基因的密码子偏性分析

脂肪酸去饱和酶7是不饱和脂肪酸合成途径中催化亚油酸(Δ^(9,12)-C_(18:2))形成α-亚麻酸(Δ^(9,12,15)-C_(18:3),ALA)的关键酶。本研究利用Codon W、CHIPS及CUSP等程序分析植物FAD7基因的密码子偏性。结果表明,FAD7基因偏好使用以A或T结尾的密码子。其中,AGA(RSCU=2.46)、AGT(RSCU=1.60)、CCT(RSCU=1.51)等属于高频使用密码子。分析的36种植物中,大部分双子叶植物的GC3s含量小于50%,预示FAD7基因更适合导入双子叶植物。