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根际化学与生物多样性的表征方法:组学技术的机遇与挑战
1
作者
黄红林
吕丽丽
+5 位作者
吕继涛
饶子渔
耿方兰
曹冬
康跃惠
温蓓
《环境化学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期210-223,共14页
根际是联结植物、土壤和微生物的重要界面,是化学与生物过程耦合最活跃的区域.根际环境影响土壤中有机和无机污染物的行为,而研究方法的完善与提升有助于阐释根际中复杂的过程与作用机制.本文从传统的化学和生物学方法到新兴的组学技术...
根际是联结植物、土壤和微生物的重要界面,是化学与生物过程耦合最活跃的区域.根际环境影响土壤中有机和无机污染物的行为,而研究方法的完善与提升有助于阐释根际中复杂的过程与作用机制.本文从传统的化学和生物学方法到新兴的组学技术对根际科学的方法学研究进展进行了综述,重点讨论了当今组学技术在根际研究中应用机遇与挑战,同时展望了今后需要关注的科学问题.根际化学组分的传统分析方法涵盖了光谱、色谱、质谱和色质联用等技术,主要聚焦于低分子量有机酸等小分子的定性定量测定,导致对根际化学多样性的认知偏差;传统的根际微生物研究依赖于培养技术,对微生物多样性的描述存在很大的局限.揭示根际异质性和复杂性,亟需采用高端的技术,组学方法显示出极大的优势,显著提高了研究者对根际科学的认识.基于靶向和非靶向代谢组学有利于深入研究根际复杂的化学多样性过程;基于宏基因组学、转录组学和蛋白组学等组学工具能够提供微生物组基因和蛋白的表达、功能特性等更详细的信息,可以全面地揭示根际微生物的多样性.应该强调的是,未来多组学整合分析更是表征根际化学与生物多样性的一个强有力工具,但需要更多的模型、框架和计算基础来实现根际基因、蛋白、转录和代谢水平的多层次关联,以助于挖掘根-微生物-土壤界面大量尚未揭示的关键过程、机理及生态环境效应.
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关键词
根际
生物化学多样性
分析方法
组学技术
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职称材料
傅里叶变换离子回旋共振质谱分子表征^(15)N同位素标记羟胺衍生化天然有机质
2
作者
曹冬
耿方兰
+1 位作者
饶子渔
康跃惠
《环境化学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1118-1127,共10页
羟胺化合物是地球氮循环过程中的重要中间产物.天然有机质(NOM)作为环境中普遍存在的复杂有机混合物,对羟胺的环境转化有重要影响.本研究采用傅里叶变换离子回旋共振质谱(FTICRMS)在分子层面表征羟胺与NOM的相互作用产物,采用^(15)N同...
羟胺化合物是地球氮循环过程中的重要中间产物.天然有机质(NOM)作为环境中普遍存在的复杂有机混合物,对羟胺的环境转化有重要影响.本研究采用傅里叶变换离子回旋共振质谱(FTICRMS)在分子层面表征羟胺与NOM的相互作用产物,采用^(15)N同位素标记羟胺作为反应物以排除NOM本身存在的化合物的质谱峰干扰,特异性识别^(15)N同位素标记羟胺衍生化NOM的质谱信号;同时考察了反应时间对NOM与羟胺反应活性的影响.结果表明,NOM与过量^(15)N同位素标记羟胺在室温条件反应下10 h,可以鉴定到2137个^(15)N同位素标记羟胺衍生化NOM产物分子式,其中包括,1个^(15)N同位素标记羟胺分子与1个仅含C、H、O元素的NOM分子反应形成的产物分子式1346个(CHO^(15)N_(1),约占产物分子式总数63%),两个^(15)N同位素标记羟胺分子与一个仅含C、H、O元素的NOM分子反应形成的产物分子式194个(CHO^(15)N_(2),约占产物分子式总数9%),一个^(15)N同位素标记羟胺分子与一个仅含C、H、O和一个S元素的NOM分子反应形成的产物分子式376个(CHOS1^(15)N_(1),约占产物分子式总数18%),一个^(15)N同位素标记羟胺分子与一个仅含C、H、O和一个N元素的NOM分子反应形成的产物分子式221个(CHON_(1)^(15)N_(1),约占产物分子式总数10%).这些羟胺衍生化NOM产物主要属于维管植物源多酚类和高不饱和酚类化合物,86%以上的产物很可能通过羟胺与NOM分子所含的羰基基团发生肟化反应形成.CHO^(15)N_(1)类产物的形成具有高度的时间依赖性,高氧化高饱和度的NOM化合物需要较长的反应时间才能形成羟胺衍生化NOM产物,表明此类化合物与羟胺的反应活性较弱;而低氧化高不饱和度的NOM化合物仅需要较短的时间便能形成羟胺衍生化产物,且随着反应时间延长,其中的部分化合物可以进一步生成多肟化产物或不稳定的其他产物,此结果表明这类NOM化合物对羟胺的反应活性较强.本研究采用FTICR-MS首次在分子水平全面表征了羟胺与FTICR-MS相互作用产物信息,可为羟胺在地球氮循环过程中的迁移转化机制研究提供全新视角和信息.
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关键词
15N
同位素标记羟胺
傅里叶变换离子回旋共振质谱
天然有机质
羟胺衍生化天然有机质
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职称材料
PM2.5的透射电镜及能谱表征
3
作者
耿方兰
曹冬
+3 位作者
饶子渔
周益奇
黎刚
康跃惠
《现代科学仪器》
2016年第4期59-63,共5页
大气颗粒物中单个颗粒物本身的微观化学和物理性质各不相同,其化学组成也不均匀。本文利用高分辨透射电镜结合EDX能谱技术,对大气中PM2.5进行表征分析,得到颗粒物的形貌及能谱分析结果,单个颗粒形貌差异较大,大部分颗粒物的化学...
大气颗粒物中单个颗粒物本身的微观化学和物理性质各不相同,其化学组成也不均匀。本文利用高分辨透射电镜结合EDX能谱技术,对大气中PM2.5进行表征分析,得到颗粒物的形貌及能谱分析结果,单个颗粒形貌差异较大,大部分颗粒物的化学组成为0、Si、Al、Fe、Ca、K、Mg、C等常规元素,也有部分颗粒物中检测到Cr、W、Mn、Ti等重金属元素。以此对颗粒物的来源进行推测,此大气颗粒物主要为扬尘及汽车尾气等。同时对电镜高真空强电子轰击条件下颗粒的形貌变化进行了追踪分析,大部分颗粒有趋于圆形的变化,但是不同颗粒变形前后其元素相对含量变化也不同。
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关键词
PM2.5
高分辨透射电镜
能谱
MAPPING
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职称材料
题名
根际化学与生物多样性的表征方法:组学技术的机遇与挑战
1
作者
黄红林
吕丽丽
吕继涛
饶子渔
耿方兰
曹冬
康跃惠
温蓓
机构
中国科学院生态环境研究中心
中国科学院大学
出处
《环境化学》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期210-223,共14页
基金
国家自然科学基金(21876187,22076213,41877479,21577155)资助。
文摘
根际是联结植物、土壤和微生物的重要界面,是化学与生物过程耦合最活跃的区域.根际环境影响土壤中有机和无机污染物的行为,而研究方法的完善与提升有助于阐释根际中复杂的过程与作用机制.本文从传统的化学和生物学方法到新兴的组学技术对根际科学的方法学研究进展进行了综述,重点讨论了当今组学技术在根际研究中应用机遇与挑战,同时展望了今后需要关注的科学问题.根际化学组分的传统分析方法涵盖了光谱、色谱、质谱和色质联用等技术,主要聚焦于低分子量有机酸等小分子的定性定量测定,导致对根际化学多样性的认知偏差;传统的根际微生物研究依赖于培养技术,对微生物多样性的描述存在很大的局限.揭示根际异质性和复杂性,亟需采用高端的技术,组学方法显示出极大的优势,显著提高了研究者对根际科学的认识.基于靶向和非靶向代谢组学有利于深入研究根际复杂的化学多样性过程;基于宏基因组学、转录组学和蛋白组学等组学工具能够提供微生物组基因和蛋白的表达、功能特性等更详细的信息,可以全面地揭示根际微生物的多样性.应该强调的是,未来多组学整合分析更是表征根际化学与生物多样性的一个强有力工具,但需要更多的模型、框架和计算基础来实现根际基因、蛋白、转录和代谢水平的多层次关联,以助于挖掘根-微生物-土壤界面大量尚未揭示的关键过程、机理及生态环境效应.
关键词
根际
生物化学多样性
分析方法
组学技术
Keywords
rhizosphere
chemo-and biodiversity
analytical methods
omics technology
分类号
X17 [环境科学与工程—环境科学]
X144 [环境科学与工程—环境科学]
S154.4 [农业科学—土壤学]
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职称材料
题名
傅里叶变换离子回旋共振质谱分子表征^(15)N同位素标记羟胺衍生化天然有机质
2
作者
曹冬
耿方兰
饶子渔
康跃惠
机构
中国科学院生态环境研究中心
出处
《环境化学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1118-1127,共10页
基金
国家自然科学基金(重点项目22036007)资助.
文摘
羟胺化合物是地球氮循环过程中的重要中间产物.天然有机质(NOM)作为环境中普遍存在的复杂有机混合物,对羟胺的环境转化有重要影响.本研究采用傅里叶变换离子回旋共振质谱(FTICRMS)在分子层面表征羟胺与NOM的相互作用产物,采用^(15)N同位素标记羟胺作为反应物以排除NOM本身存在的化合物的质谱峰干扰,特异性识别^(15)N同位素标记羟胺衍生化NOM的质谱信号;同时考察了反应时间对NOM与羟胺反应活性的影响.结果表明,NOM与过量^(15)N同位素标记羟胺在室温条件反应下10 h,可以鉴定到2137个^(15)N同位素标记羟胺衍生化NOM产物分子式,其中包括,1个^(15)N同位素标记羟胺分子与1个仅含C、H、O元素的NOM分子反应形成的产物分子式1346个(CHO^(15)N_(1),约占产物分子式总数63%),两个^(15)N同位素标记羟胺分子与一个仅含C、H、O元素的NOM分子反应形成的产物分子式194个(CHO^(15)N_(2),约占产物分子式总数9%),一个^(15)N同位素标记羟胺分子与一个仅含C、H、O和一个S元素的NOM分子反应形成的产物分子式376个(CHOS1^(15)N_(1),约占产物分子式总数18%),一个^(15)N同位素标记羟胺分子与一个仅含C、H、O和一个N元素的NOM分子反应形成的产物分子式221个(CHON_(1)^(15)N_(1),约占产物分子式总数10%).这些羟胺衍生化NOM产物主要属于维管植物源多酚类和高不饱和酚类化合物,86%以上的产物很可能通过羟胺与NOM分子所含的羰基基团发生肟化反应形成.CHO^(15)N_(1)类产物的形成具有高度的时间依赖性,高氧化高饱和度的NOM化合物需要较长的反应时间才能形成羟胺衍生化NOM产物,表明此类化合物与羟胺的反应活性较弱;而低氧化高不饱和度的NOM化合物仅需要较短的时间便能形成羟胺衍生化产物,且随着反应时间延长,其中的部分化合物可以进一步生成多肟化产物或不稳定的其他产物,此结果表明这类NOM化合物对羟胺的反应活性较强.本研究采用FTICR-MS首次在分子水平全面表征了羟胺与FTICR-MS相互作用产物信息,可为羟胺在地球氮循环过程中的迁移转化机制研究提供全新视角和信息.
关键词
15N
同位素标记羟胺
傅里叶变换离子回旋共振质谱
天然有机质
羟胺衍生化天然有机质
Keywords
15N-labelled hydroxylamine
FTICR-MS
natural organic matter
hydroxylaminederivatized organic matter
分类号
P595 [天文地球—地球化学]
X142 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
PM2.5的透射电镜及能谱表征
3
作者
耿方兰
曹冬
饶子渔
周益奇
黎刚
康跃惠
机构
中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理国家重点实验室
出处
《现代科学仪器》
2016年第4期59-63,共5页
基金
生态环境研究中心仪器设备功能开发技术创新预研项目(2015yyxm02)
文摘
大气颗粒物中单个颗粒物本身的微观化学和物理性质各不相同,其化学组成也不均匀。本文利用高分辨透射电镜结合EDX能谱技术,对大气中PM2.5进行表征分析,得到颗粒物的形貌及能谱分析结果,单个颗粒形貌差异较大,大部分颗粒物的化学组成为0、Si、Al、Fe、Ca、K、Mg、C等常规元素,也有部分颗粒物中检测到Cr、W、Mn、Ti等重金属元素。以此对颗粒物的来源进行推测,此大气颗粒物主要为扬尘及汽车尾气等。同时对电镜高真空强电子轰击条件下颗粒的形貌变化进行了追踪分析,大部分颗粒有趋于圆形的变化,但是不同颗粒变形前后其元素相对含量变化也不同。
关键词
PM2.5
高分辨透射电镜
能谱
MAPPING
Keywords
PM2.5
HRTEM
EDS mapping
分类号
X132 [环境科学与工程—环境科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
根际化学与生物多样性的表征方法:组学技术的机遇与挑战
黄红林
吕丽丽
吕继涛
饶子渔
耿方兰
曹冬
康跃惠
温蓓
《环境化学》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
2
傅里叶变换离子回旋共振质谱分子表征^(15)N同位素标记羟胺衍生化天然有机质
曹冬
耿方兰
饶子渔
康跃惠
《环境化学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
3
PM2.5的透射电镜及能谱表征
耿方兰
曹冬
饶子渔
周益奇
黎刚
康跃惠
《现代科学仪器》
2016
0
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职称材料
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