沙雅县胡杨林土壤可培养细菌的多样性分析

【目的】了解新疆沙雅县胡杨林土壤可培养细菌的多样性。【方法】沙雅县胡杨林采集土壤样品，采用两种不同的培养基（LB，TSA）分离纯化细菌，并对它们进行16SrDNA测定和系统进化分析。【结果】分离纯化不同表型的57株细菌。对它们16SrDNA序列分析表明，57株菌分别属于3个大类群厚壁菌门（Firmicutes），放线菌门（Actinobacteria），γ-变形菌纲（γ-Proteobacteria），13个属，33个种；芽孢杆菌属是优势细菌种群，它占已测种群的67．2％。其中6株菌M28，M13，CT3，YS30—1，CM5，CL19初步被认为是潜在的新种（16SrDNA相似率为96．780％～97．961％）。【结论】沙雅县胡杨林可培养细菌不仅具有比较高的多样性，并存在一些潜在的新的细菌菌种资源，极具进一步发掘的潜力。

新疆Kiyik废弃古河道天然胡杨林地可培养细菌的多样性研究

【目的】研究新疆塔里木河中游的Kiyik废弃古河道天然胡杨林地可培养细菌群落结构和多样性。【方法】从Kiyik废弃古河道胡杨林两个采样点(采样点I,采样点II)采集样品,采用LB、TSA和YPG等3种不同培养基分离纯化细菌,并对它们进行16 S r DNA测定和系统进化分析。【结果】108株菌来自于采样点I,85株菌来自于采样点II,共分离纯化了不同表型的193株菌。16 S r DNA序列分析结果表明193株菌分别属于5个大类群:厚壁菌门(Firmicutes)占59.6%,γ-变形菌纲(Gamma-proteobacteria)占29.5%,放线菌门(Actinobacteria)占7.3%,β-变形菌纲(Beta-proteobacteria)占2.6%,α-变形菌纲(Alpha-proteobacteria)占1.6%,26个属,62个种。其中有34株菌的16 S r DNA相似率﹤98.0%,分别属于11个属的25个物种,是胡杨林本源的潜在新菌种。假单孢菌属(Pseudomonas,34.3%)是采样点I中分离到的优势细菌属,而采样点II的优势细菌属为芽孢杆菌属(Bacillus,54.1%)。芽孢杆菌属和微杆菌属(Microbacterium)是两个采样点共有的属,在物种水平上仅有芽孢杆菌属的4个物种为两个采样点共有,而其他菌种仅发现于单个样点。【结论】在两个采样位点中分离到的可培养细菌具有较高的多样性,两个样点菌种分布的差异极显著。存在的潜在新细菌菌种资源较丰富,具有进一步发掘的潜力。

新疆库米什金矿土壤可培养细菌的多样性分析

【目的】了解新疆库米什一处金矿土壤可培养细菌的多样性及建立菌种资源库。【方法】采集库米什金矿土壤样品,采用两种不同培养基(LB,TSB)分离纯化细菌,对其进行形态观察(菌落及细胞)、生理测定、16SrDNA测序和系统进化分析。【结果】从两种培养基上总共得到50株细菌,根据基于16S rDNA的系统进化分析表明,50株菌分别属于3个大类群:厚壁菌门(Firmicutes),放线菌门(Actinobacteria),γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria),12个属,30个分类单元。其中芽孢杆菌属(Bacillus)为优势细菌种群,占已测种群的63.3%。菌株L10-5与Bacillus foraminis(AJ717382)有96.463%的相似率,可能为潜在新种。【结论】库米什金矿土壤可培养细菌具有较高的多样性,存在潜在新菌种资源,值得进一步研究。

西昆仑山2个海拔位点可培养细菌多样性分析

以西昆仑山2个海拔样点的土样为对象,利用(LB和TSA)2种培养基,基于16S rRNA基因序列的系统发育,采用纯培养法对其可培养细菌多样性进行研究。2样点中共分离到91株细菌,分为25个属,52个种。厚壁菌门(Firmicutes)占总菌数的48.75%,放线菌门(Actinobacteria)占36.25%,γ-变形菌亚门(γ-Proteobacteria)占15%。其中,Bacillus属(占所有菌株的27%)为优势菌群,Arthrobacter属(占15%),Pseudomonas属(占10%)为次优势菌群。大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种,其典型菌株之间存在一定的遗传差异,16S rRNA基因序列相似性为98.2%～99.9%;其中至少有10个菌株(占所有菌株的11%)代表潜在的新分类单元(它们与最近源模式菌株的16S rRNA基因序列相似性低于97.8%)。分离到的细菌大部分与土壤、冰川、海洋、盐湖、沙漠、动物内脏等环境分离的细菌具有高度相似性。辛普森多样性指数(Simpson’s diversity index);香农-威纳指数(Shannon-Wie-ner index);香农-威纳均匀度指数(Shannon-Wiener’s evenness index)分析显示,高海拔地区(3 100 m)可培养细菌多样性高于低海拔地区(2 795 m),而高海拔地区可培养细菌的分布均匀度则低于低海拔地区。表明西昆仑山可培养细菌不仅具有丰富的多样性,还蕴藏着较多具有地域特点的新菌种资源。