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基于人源性乳腺癌类器官的质谱成像数据分析
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作者 马可鑫 兰春燕 +2 位作者 彭颖 李玥 高华方 《生殖医学杂志》 CAS 2023年第6期898-903,共6页
目的介绍一种兼容高通量常压质谱成像数据的可视化分析流程。方法2022年10月于北京大学第三医院进行手术切除获得乳腺癌组织,并采用机械压滤法悬浮过夜获得人源性乳腺癌类器官。将类器官转移至载玻片上,喷涂2,5-二羟基苯甲酸(DHB)基质... 目的介绍一种兼容高通量常压质谱成像数据的可视化分析流程。方法2022年10月于北京大学第三医院进行手术切除获得乳腺癌组织,并采用机械压滤法悬浮过夜获得人源性乳腺癌类器官。将类器官转移至载玻片上,喷涂2,5-二羟基苯甲酸(DHB)基质进行质谱分析,并将通过常压的质谱成像数据进行格式转换后,导入MSiReader软件,经过数据预处理、二维及三维质谱成像数据的可视化,共定位分析等操作,实现对质谱成像数据的可视化分析。结果采用MSireader软件将.Raw转化为.imzML格式数据以便于读取;经数据预处理后发现,选用Mean进行数据归一化时背景去除效果最显著;在MSiReader软件中,可在二维质谱图中直观观察不同分子在类器官表面的异质性空间分布情况,质谱成像数据除了以二维伪彩图的形式展示分子的信号强度外,还可以更加清晰直观地以三维展示;MSiReader软件中的RGB共定位分析工具,除了能够查看单个分子在类器官表面的分布情况,还有利于寻找分布于特定空间区域的分子共定位情况。结论利用MSiReader软件,提出了一种基于人源性乳腺癌类器官达到可视化分析常压的质谱成像数据分析系统。 展开更多
关键词 常压质谱成像 人源性类器官 MSiReader软件 原位可视化
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氧通量对钒氧化物薄膜的可控制备
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作者 孙茂林 李雨桐 +5 位作者 马可鑫 董浩男 侯晓轩 李子豪 景维军 宫震 《辽宁科技大学学报》 CAS 2020年第3期179-182,共4页
磁控溅射纯V靶制备钒氧化物VOx薄膜,研究不同氧通量对VOx薄膜x值的调控。采用扫描电子显微镜、X射线衍射仪、拉曼光谱仪和霍尔效应仪对薄膜形貌、结构和电学性能进行表征。结果表明:随着氧通量的增加,钒氧化物形貌由尖角较大颗粒逐渐圆... 磁控溅射纯V靶制备钒氧化物VOx薄膜,研究不同氧通量对VOx薄膜x值的调控。采用扫描电子显微镜、X射线衍射仪、拉曼光谱仪和霍尔效应仪对薄膜形貌、结构和电学性能进行表征。结果表明:随着氧通量的增加,钒氧化物形貌由尖角较大颗粒逐渐圆滑缩小团聚,x值由1转变为1.5~2.5之间,最终接近2.5,同时电阻也逐渐增长。 展开更多
关键词 VOx薄膜 磁控溅射 氧通量
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肿瘤类器官的应用及展望 被引量:5
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作者 马可鑫 陈晓芳 +1 位作者 李玥 高华方 《中国肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期284-291,共8页
类器官是来源于多种类型干细胞通过自组织方式而组成的三维结构,可模拟体内疾病与正常组织的结构和功能,成为近十年内生物科学领域的重要突破之一。而肿瘤类器官作为一种可靠且稳定的体外肿瘤模型,可以捕获患者肿瘤的结构和突变特征,已... 类器官是来源于多种类型干细胞通过自组织方式而组成的三维结构,可模拟体内疾病与正常组织的结构和功能,成为近十年内生物科学领域的重要突破之一。而肿瘤类器官作为一种可靠且稳定的体外肿瘤模型,可以捕获患者肿瘤的结构和突变特征,已在建立和分析方面取得巨大进展。全文回顾了肿瘤类器官研究的最新进展及其可能在抗肿瘤药物开发和精准治疗等方面的应用。 展开更多
关键词 类器官 肿瘤 精准治疗 药物筛选
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