ChiVMV在滇重楼上的首次发现及部分基因序列分析

滇重楼(Paris yunnanensis)是主要分布在我国西南地区尤其是云南的珍贵药材。2016年,从云南省德宏州芒市的滇重楼种植基地上观察到叶片斑驳、皱缩、坏死和花叶的滇重楼罹病植株。利用马铃薯Y病毒属(Potyvirus)、烟草花叶病毒属(Tobamovirus)、黄症病毒属(Luteovirus)和菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)病毒的通用引物和重楼X病毒(paris polyphylla virus X,PPVX)的特异引物,对采集的13份滇重楼样品进行病毒检测,结果发现利用马铃薯Y病毒属的通用引物CIFor/CIRev,能从罹病植株中扩增到与引物设计相符的条带。将目标产物克隆、测序,结果显示与辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus, ChiVMV)云南烟草分离物在ci基因核心区域具有99%的核苷酸序列一致性,表明染病滇重楼有ChiVMV的侵染。利用ChiVMV的特异引物,对2016-2018年采自云南省保山市龙陵县、德宏州芒市、怒江州泸水县、丽江市古城区、迪庆州香格里拉市和四川省攀枝花市盐边县的93份滇重楼样品进行RT-PCR检测,结果除泸水县采集的8个样品没有检测到ChiVMV外,其他5个地区采集的85个样品中有25个检测到ChiVMV的侵染。将ChiVMV丽江分离物及迪庆分离物的PCR产物进行克隆和测序,序列分析显示2个ChiVMV滇重楼分离物(YLJ-CL1,MW408193;YDQ-CL1,MW404246)在部分NIb基因及完整cp基因共1 269 nt的区域,具有相互间100%的核苷酸序列一致性,以及与ChiVMV其它分离物相应区域82.4%~99.1%的核苷酸序列一致性。利用不同ChiVMV分离物中该区域1 269 nt核苷酸序列构建的系统发育树,表明侵染滇重楼的ChiVMV分离物与侵染云南烟草的ChiVMV分离物亲缘关系最近。这是ChiVMV在重楼属(Paris)乃至黑药花科(Melanthiaceae)植物上的首次报道。