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基于机器学习Rosetta的全人源化Spastin重组抗体的设计和验证
1
作者
马澳
孟智超
谭明会
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2024年第3期306-314,共9页
目的:基于机器学习软件Rosetta实现人源化Spastin重组抗体的设计、体外制备及验证。方法:使用Rosetta设计出针对人Spastin蛋白抗原表位的全人源化抗体,获得其抗体Fab段轻链及重链可变区的氨基酸序列,优化密码子后转化为核苷酸序列得到...
目的:基于机器学习软件Rosetta实现人源化Spastin重组抗体的设计、体外制备及验证。方法:使用Rosetta设计出针对人Spastin蛋白抗原表位的全人源化抗体,获得其抗体Fab段轻链及重链可变区的氨基酸序列,优化密码子后转化为核苷酸序列得到轻、重链的全长cDNA;随后将全人源化抗Spastin的轻、重链序列分别构建于重组表达载体;在293FT真核表达体系中表达并纯化该抗体;使用Western blot方法鉴定该抗体识别人Spastin重组蛋白信号的能力;通过Rosetta建模模拟抗体与抗原的结合及构象。结果:成功构建了全人源化Spastin重组抗体;该Spastin重组抗体能够在真核系统成功表达;构建的重组抗体轻、重链能够形成完整抗体,且能够特异性识别出人Spastin蛋白信号。结论:借助Rosetta软件成功设计了一种能够特异识别Spastin的重组全人源化抗体。
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关键词
ROSETTA
全人源化抗体
抗体设计
SPASTIN
人工智能
机器学习
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职称材料
题名
基于机器学习Rosetta的全人源化Spastin重组抗体的设计和验证
1
作者
马澳
孟智超
谭明会
机构
暨南大学第一临床医学院脊柱创伤一区
出处
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2024年第3期306-314,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32071033)
广东省自然科学基金面上项目(2023A1515010140)。
文摘
目的:基于机器学习软件Rosetta实现人源化Spastin重组抗体的设计、体外制备及验证。方法:使用Rosetta设计出针对人Spastin蛋白抗原表位的全人源化抗体,获得其抗体Fab段轻链及重链可变区的氨基酸序列,优化密码子后转化为核苷酸序列得到轻、重链的全长cDNA;随后将全人源化抗Spastin的轻、重链序列分别构建于重组表达载体;在293FT真核表达体系中表达并纯化该抗体;使用Western blot方法鉴定该抗体识别人Spastin重组蛋白信号的能力;通过Rosetta建模模拟抗体与抗原的结合及构象。结果:成功构建了全人源化Spastin重组抗体;该Spastin重组抗体能够在真核系统成功表达;构建的重组抗体轻、重链能够形成完整抗体,且能够特异性识别出人Spastin蛋白信号。结论:借助Rosetta软件成功设计了一种能够特异识别Spastin的重组全人源化抗体。
关键词
ROSETTA
全人源化抗体
抗体设计
SPASTIN
人工智能
机器学习
Keywords
Rosetta
fully humanized antibodies
antibody design
Spastin
artificial intelligence
machine learning
分类号
R651.19 [医药卫生—外科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于机器学习Rosetta的全人源化Spastin重组抗体的设计和验证
马澳
孟智超
谭明会
《暨南大学学报(自然科学与医学版)》
CAS
北大核心
2024
0
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