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基于网络药理学和分子对接探讨小青龙汤合人参汤防治高原肺水肿的作用机制
1
作者
马莉娉
马雪曼
+2 位作者
杨文珂
王强
赵玉荣
《中医学》
2023年第12期3482-3495,共14页
目的:基于网络药理学和分子对接技术分析小青龙汤合人参汤抗高原肺水肿的作用机制。方法:通过TCMSP获取小青龙汤合人参汤主要活性成分及其靶点;通过OMIM、Genecards和DisGeNET数据库获取高原肺水肿主要作用靶点;通过Venn Diagram得到小...
目的:基于网络药理学和分子对接技术分析小青龙汤合人参汤抗高原肺水肿的作用机制。方法:通过TCMSP获取小青龙汤合人参汤主要活性成分及其靶点;通过OMIM、Genecards和DisGeNET数据库获取高原肺水肿主要作用靶点;通过Venn Diagram得到小青龙汤合人参汤与高原肺水肿的共同靶点;利用String数据库获得数据,用Cytoscape3.9.1建立蛋白质互作(PPI)网络;采用David数据库分析生物过程及信号通路,采用Cytoscape3.9.1软件构建“活性成分–靶点”网络,并运用AutoDock及Pymol对关键靶点与相应活性成分进行分子对接验证。结果:从小青龙汤合人参汤中筛选得到159种活性成分及329个作用靶点,与887个高原肺水肿相关靶点取交集,得到62个共同靶点,GO功能富集分析中生物过程(BP)得到214条,分子功能(MF)得到25条,细胞成分(CC)得到13条;KEGG信号通路富集分析获得93条。结论:小青龙汤和人参汤防治高原肺水肿的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等,关键靶点为IL6、TNF、VEGFA等;小青龙汤合人参汤防治高原肺水肿主要涉及HIF-1信号传导途径、脂质和动脉硬化、Toll样受体信号通路、TNF信号传导途径等。
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关键词
高原肺水肿
小青龙汤
人参汤
网络药理学
分子对接
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职称材料
基于网络药理学方法和分子对接技术探究六君二陈解毒汤治疗非小细胞肺癌的潜在作用机制
2
作者
杨文珂
赵玉荣
+4 位作者
王强
马莉娉
苏占海
董秋霞
马雪曼
《中国高原医学与生物学杂志》
CAS
2023年第4期243-254,共12页
目的利用网络药理学方法和分子对接技术,探究六君二陈解毒汤治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的潜在作用机制。方法基于网络药理学方法检索TCMSP数据库收集六君二陈解毒汤的药物活性成分,并预测其作用靶点;检索GenCa...
目的利用网络药理学方法和分子对接技术,探究六君二陈解毒汤治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的潜在作用机制。方法基于网络药理学方法检索TCMSP数据库收集六君二陈解毒汤的药物活性成分,并预测其作用靶点;检索GenCards、OMIM、PharmGKB数据库获得NSCLC疾病靶点;使用Venny(2.1)在线工具获得药物活性成分与疾病的交集靶点后,通过STRING数据库构建蛋白互作图并做拓扑学分析;使用Cytoscape Version(3.9.2)软件的MCODE插件对核心靶点进行聚类分析;使用DAVID数据库对核心靶点进行GO生物功能和KEGG通路富集分析;运用Kaplan-Meier Plotter数据库对核心靶点进行生存分析。基于分子对接技术使用AutoDock(1.5.6)软件对网络药理学预测结果进行分子对接验证。结果基于网络药理学方法得到六君二陈解毒汤的主要活性成分198个、潜在作用靶点968个;检索疾病数据库收集筛选得到NSCLC靶点1093个,取交集后得到NSCLC治疗靶点12个。蛋白互作图和拓扑学分析结果显示,EGFR、CAV1、PTEN等10个靶点可能是六君二陈解毒汤治疗NSCLC的核心靶点。聚类分析得到1个具有相似功能的子簇,涉及PARK2、MCL1、EGFR等8个核心靶点。GO生物功能和KEGG通路富集分析表明,六君二陈解毒汤通过影响癌症信号通路和FAK、PI3K-act等信号通路发挥作用。生存分析结果显示,EGFR、CAV1、PTEN、MCL1、MET、RASA1、VCAM1核心靶点的表达与NSCLC患者总生存率有关。基于分子对接技术得到六君二陈解毒汤活性成分中β-谷甾醇与核心靶点MCL1有较好的结合能力,其结合能为-4.33 kJ/mol。结论基于网络药理学方法预测出六君二陈解毒汤主要通过槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素等药物活性成分作用于EGFR、CAV1、MCL1等核心靶点发挥治疗作用;通过分子对接技术证明,活性成分β-谷甾醇与核心靶点MCL1密切相关。
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关键词
六君二陈解毒汤
非小细胞肺癌
网络药理学
分子
对接
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职称材料
活血化瘀法治疗乳腺癌的研究进展
3
作者
王强
赵玉荣
+4 位作者
杨文珂
马莉娉
彭艳
高祎
马雪曼
《巴楚医学》
2022年第3期106-109,共4页
乳腺癌居女性恶性肿瘤首位,其发病率、死亡率逐年上升。中医乳腺癌属“癌肿”类,其病机可用“痰、瘀、虚、毒”四字概括。其中,瘀血是肿瘤的病理基础,贯穿乳腺癌发生发展。活血化瘀法切中肿瘤瘀血阻滞病理的关键,在临床乳腺癌治疗中应...
乳腺癌居女性恶性肿瘤首位,其发病率、死亡率逐年上升。中医乳腺癌属“癌肿”类,其病机可用“痰、瘀、虚、毒”四字概括。其中,瘀血是肿瘤的病理基础,贯穿乳腺癌发生发展。活血化瘀法切中肿瘤瘀血阻滞病理的关键,在临床乳腺癌治疗中应用广泛,疗效显著。本综述拟对近年来活血化瘀法治疗乳腺癌的研究进行归纳总结,从抑制乳腺癌细胞增殖、促进癌细胞凋亡、改善血液高凝状态、增强免疫、逆转肿瘤耐药、增效减毒等多方面探索活血化瘀法抗乳腺癌的作用机制,以期为其临床应用提供参考。
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关键词
活血化瘀法
乳腺癌
癌肿
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接探讨小青龙汤合人参汤防治高原肺水肿的作用机制
1
作者
马莉娉
马雪曼
杨文珂
王强
赵玉荣
机构
青海大学医学部中医系
青海省中藏药预防肿瘤重点实验室
出处
《中医学》
2023年第12期3482-3495,共14页
文摘
目的:基于网络药理学和分子对接技术分析小青龙汤合人参汤抗高原肺水肿的作用机制。方法:通过TCMSP获取小青龙汤合人参汤主要活性成分及其靶点;通过OMIM、Genecards和DisGeNET数据库获取高原肺水肿主要作用靶点;通过Venn Diagram得到小青龙汤合人参汤与高原肺水肿的共同靶点;利用String数据库获得数据,用Cytoscape3.9.1建立蛋白质互作(PPI)网络;采用David数据库分析生物过程及信号通路,采用Cytoscape3.9.1软件构建“活性成分–靶点”网络,并运用AutoDock及Pymol对关键靶点与相应活性成分进行分子对接验证。结果:从小青龙汤合人参汤中筛选得到159种活性成分及329个作用靶点,与887个高原肺水肿相关靶点取交集,得到62个共同靶点,GO功能富集分析中生物过程(BP)得到214条,分子功能(MF)得到25条,细胞成分(CC)得到13条;KEGG信号通路富集分析获得93条。结论:小青龙汤和人参汤防治高原肺水肿的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等,关键靶点为IL6、TNF、VEGFA等;小青龙汤合人参汤防治高原肺水肿主要涉及HIF-1信号传导途径、脂质和动脉硬化、Toll样受体信号通路、TNF信号传导途径等。
关键词
高原肺水肿
小青龙汤
人参汤
网络药理学
分子对接
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
基于网络药理学方法和分子对接技术探究六君二陈解毒汤治疗非小细胞肺癌的潜在作用机制
2
作者
杨文珂
赵玉荣
王强
马莉娉
苏占海
董秋霞
马雪曼
机构
青海大学医学部
青海红十字医院
出处
《中国高原医学与生物学杂志》
CAS
2023年第4期243-254,共12页
基金
青海省自然科学基金项目(项目编号:2020ZJ949Q)。
文摘
目的利用网络药理学方法和分子对接技术,探究六君二陈解毒汤治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的潜在作用机制。方法基于网络药理学方法检索TCMSP数据库收集六君二陈解毒汤的药物活性成分,并预测其作用靶点;检索GenCards、OMIM、PharmGKB数据库获得NSCLC疾病靶点;使用Venny(2.1)在线工具获得药物活性成分与疾病的交集靶点后,通过STRING数据库构建蛋白互作图并做拓扑学分析;使用Cytoscape Version(3.9.2)软件的MCODE插件对核心靶点进行聚类分析;使用DAVID数据库对核心靶点进行GO生物功能和KEGG通路富集分析;运用Kaplan-Meier Plotter数据库对核心靶点进行生存分析。基于分子对接技术使用AutoDock(1.5.6)软件对网络药理学预测结果进行分子对接验证。结果基于网络药理学方法得到六君二陈解毒汤的主要活性成分198个、潜在作用靶点968个;检索疾病数据库收集筛选得到NSCLC靶点1093个,取交集后得到NSCLC治疗靶点12个。蛋白互作图和拓扑学分析结果显示,EGFR、CAV1、PTEN等10个靶点可能是六君二陈解毒汤治疗NSCLC的核心靶点。聚类分析得到1个具有相似功能的子簇,涉及PARK2、MCL1、EGFR等8个核心靶点。GO生物功能和KEGG通路富集分析表明,六君二陈解毒汤通过影响癌症信号通路和FAK、PI3K-act等信号通路发挥作用。生存分析结果显示,EGFR、CAV1、PTEN、MCL1、MET、RASA1、VCAM1核心靶点的表达与NSCLC患者总生存率有关。基于分子对接技术得到六君二陈解毒汤活性成分中β-谷甾醇与核心靶点MCL1有较好的结合能力,其结合能为-4.33 kJ/mol。结论基于网络药理学方法预测出六君二陈解毒汤主要通过槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素等药物活性成分作用于EGFR、CAV1、MCL1等核心靶点发挥治疗作用;通过分子对接技术证明,活性成分β-谷甾醇与核心靶点MCL1密切相关。
关键词
六君二陈解毒汤
非小细胞肺癌
网络药理学
分子
对接
Keywords
Liujun Erchang Detoxification Tang
non-small cell lung cancer
network pharmacology
molecule
docking
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
活血化瘀法治疗乳腺癌的研究进展
3
作者
王强
赵玉荣
杨文珂
马莉娉
彭艳
高祎
马雪曼
机构
青海大学医学部
出处
《巴楚医学》
2022年第3期106-109,共4页
基金
青海省自然科学基金项目(No:2020-ZJ-949Q)。
文摘
乳腺癌居女性恶性肿瘤首位,其发病率、死亡率逐年上升。中医乳腺癌属“癌肿”类,其病机可用“痰、瘀、虚、毒”四字概括。其中,瘀血是肿瘤的病理基础,贯穿乳腺癌发生发展。活血化瘀法切中肿瘤瘀血阻滞病理的关键,在临床乳腺癌治疗中应用广泛,疗效显著。本综述拟对近年来活血化瘀法治疗乳腺癌的研究进行归纳总结,从抑制乳腺癌细胞增殖、促进癌细胞凋亡、改善血液高凝状态、增强免疫、逆转肿瘤耐药、增效减毒等多方面探索活血化瘀法抗乳腺癌的作用机制,以期为其临床应用提供参考。
关键词
活血化瘀法
乳腺癌
癌肿
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接探讨小青龙汤合人参汤防治高原肺水肿的作用机制
马莉娉
马雪曼
杨文珂
王强
赵玉荣
《中医学》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
基于网络药理学方法和分子对接技术探究六君二陈解毒汤治疗非小细胞肺癌的潜在作用机制
杨文珂
赵玉荣
王强
马莉娉
苏占海
董秋霞
马雪曼
《中国高原医学与生物学杂志》
CAS
2023
0
下载PDF
职称材料
3
活血化瘀法治疗乳腺癌的研究进展
王强
赵玉荣
杨文珂
马莉娉
彭艳
高祎
马雪曼
《巴楚医学》
2022
0
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职称材料
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