大麦核仁蛋白基因HvNOP58的克隆和表达分析

Nop(nucleolar protein)结构域蛋白可参与核糖体装配、核苷酸甲基化修饰、基因表达调控等生物进程,是制约真核生物发育遗传、细胞周期调控和衰老机制等研究的关键因素,但少有大麦Nop结构域核仁蛋白基因的报道。本研究以北青7号和Ynbs突变体为材料,克隆了大麦HvNOP58基因的CDS序列。结果表明,HvNOP58基因位于大麦Chr2H基因组负链的49019790~49023604 bp区间,具有10个外显子,编码区长度为1674 bp。所编码蛋白属于亲水性的稳定蛋白,其高级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,具有N端结构域、NOSIC结构域和Nop结构域。同源比对和系统进化分析表明,HvNOP58蛋白与同族物种的核仁蛋白具有更近的亲缘关系。亚细胞定位、RT-PCR检测和荧光定量检测结果表明,HvNOP58基因定位于细胞核,在叶、茎、幼穗、根和叶鞘5种组织中有表达。