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基于BERT和集成学习的抗菌肽预测
1
作者
高皖陵
赵俊
岳振宇
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期635-640,共6页
利用计算方法准确识别抗菌肽是近年来生物信息学领域研究的重点问题。传统的机器学习方法需要自主从序列信息中提取和选择特征,导致抗菌肽识别准确率低。为此提出基于BERT的深度学习预测方法,从预训练策略、词向量嵌入、预测性能等方面...
利用计算方法准确识别抗菌肽是近年来生物信息学领域研究的重点问题。传统的机器学习方法需要自主从序列信息中提取和选择特征,导致抗菌肽识别准确率低。为此提出基于BERT的深度学习预测方法,从预训练策略、词向量嵌入、预测性能等方面比较了4种现有基于BERT的抗菌肽预测模型,并基于集成学习思想提出了一个新的抗菌肽预测工具。实验结果表明,该模型在多个性能评价指标上都有所提升。
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关键词
抗菌肽
评估
BERT
集成学习
预训练模型
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职称材料
题名
基于BERT和集成学习的抗菌肽预测
1
作者
高皖陵
赵俊
岳振宇
机构
安徽农业大学信息与人工智能学院
出处
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期635-640,共6页
基金
国家自然科学基金(62102004)。
文摘
利用计算方法准确识别抗菌肽是近年来生物信息学领域研究的重点问题。传统的机器学习方法需要自主从序列信息中提取和选择特征,导致抗菌肽识别准确率低。为此提出基于BERT的深度学习预测方法,从预训练策略、词向量嵌入、预测性能等方面比较了4种现有基于BERT的抗菌肽预测模型,并基于集成学习思想提出了一个新的抗菌肽预测工具。实验结果表明,该模型在多个性能评价指标上都有所提升。
关键词
抗菌肽
评估
BERT
集成学习
预训练模型
Keywords
antimicrobial peptides
assessment
BERT
ensemble learning
pre-trained model
分类号
TP399 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于BERT和集成学习的抗菌肽预测
高皖陵
赵俊
岳振宇
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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