Discovery Studio 2.0的模块扩展及应用:残基水平非键相互作用能量的自动批量计算

非键相互作用对于生物体系中的分子识别和结合过程起着关键作用。然而,传统的方法并不能在残基水平自动批量计算非键相互作用。近年来,已经发展了一些方法和工具进行非键相互作用的计算分析。该文研究发展了一种可以自动计算残基间非键相互作用的方法,即用Perl脚本调用Discovery Studio 2.0(DS 2.0,Accelrys Inc.)底层模块中的非键相互作用协议,实现了直接利用命令行批量计算非键相互作用能量,而无需通过DS2.0的图形界面。该方法扩展了DS2.0的计算模块,并于近期运用到了复合结构的研究分析中。

树鼩CD3ε全长编码序列的克隆及分子特征分析

树鼩可作为人类疾病的良好模型,但缺乏对其免疫功能研究的基本标志和单克隆抗体。该研究应用RT-PCR技术,分别从3只树鼩的肝脏、脾脏和血液中克隆了CD3ε全长编码序列并用Discovery Studio等软件对其分子特征进行了分析。结果显示,树鼩CD3εcDNA的开放阅读框全长582bp,编码193个氨基酸。树鼩与其他哺乳动物的CD3ε蛋白整体结构近似,与人和恒河猴CD3ε的亲缘关系较近,胞内域与跨膜域高度保守,但胞外域出现2个潜在的糖基化位点,表面电荷亦存在差异。该研究为今后制备树鼩CD3单克隆抗体及功能研究奠定初步的基础。

树鼩CD4全长编码序列的克隆及分子特征分析

树鼩作为多种人类疾病研究模型的可能性已受到广泛关注,但尚缺乏研究其免疫功能的基本标志以及单克隆抗体。该实验首先以树鼩外周血总RNA为材料,通过RT-PCR扩增得到长度为1365bp的树鼩CD4全长编码序列,并确定了数据库中缺失的两个片段,进而通过ClustalW等软件对其序列和分子特征进行分析,发现树鼩CD4氨基酸序列胞外和胞内域保守性较好,且与人类和猴的亲缘关系较近。虽然树鼩和人CD4分子表面大部分区域均带正电荷,但与人CD4胞外域D1相比,树鼩CD4D1结构区域表面带负电荷较多,且多出两个N-糖基化位点。这些差异对抗体的结合可能存在影响。该研究为今后树鼩CD4单克隆抗体制备及功能研究奠定了基础。

树鼩IL-2全长编码序列的克隆及分子特征分析

树鼩作为多种人类疾病模型已受到广泛关注,而免疫因子对于树鼩模型评价至关重要,但目前对其白细胞介素-2(IL-2)的研究鲜有报道。该实验以经ConA(concanavalin)诱导培养的树鼩淋巴细胞总RNA为模板,RT-PCR克隆出465bp的树鼩IL-2全长编码序列,并采用ClustalW软件分析其序列和分子特征。结果表明树鼩IL-2cDNA编码一个由154个氨基酸组成的蛋白质,其cDNA及氨基酸序列与人的同源性分别为93%及80%,且其整体结构与人IL-2相似。MEGA5.0软件构建的进化树表明,树鼩与人及恒河猴的亲缘关系较近。Pymol软件对树鼩和人IL-2氨基酸序列进行的三维结构模建表明,两者的IL-2分子三维空间结构基本相似,表面大部分区域所带电荷相同,但在某些区域差异较大,且树鼩多出一个糖基化位点,这些差异对抗体的结合可能存在影响。该研究为今后树鼩IL-2单克隆抗体的制备及功能研究奠定了基础。

稀土磁致伸缩材料Terfenol-D的变负载特性分析研究

关于稀土超磁载伸缩材料Terfenol D的磁致伸缩特性国内外已有大量报道,但大多数都是基于载荷(预紧力 )在磁致伸缩过程中保持不变条件下的磁致伸缩特性研究 .在这些研究的基础上分析了Terfenol D材料在变负载时的磁致伸缩特性 ,介绍了变负载动态特性曲线的绘制方法并讨论了恒载与变载的特性曲线的特点与差异 。

诗歌写意——作文想像力、创造力训练一例

近年来的高考作文越来越注重考查学生的想像力与创造力,因此平时的作文教学也应注重这些能力的培养。我国的古典诗歌素以言简意丰著称。短短二三十字往往蕴含着极为丰富的情感。诗中既绘景又抒情,吟诵之间,其无穷韵味便缓缓而出。以诗为底本,用现代散文的笔法去抒写自己对古典诗歌的理解与体会,既是对原涛的深层挖掘,更是自己想像力、创造力的体现。诗歌写意不是简单的诗歌翻译,而是作者的再创造。

树鼩干扰素家族的基本构成及分子特征分析

干扰素(IFN)是在"危险信号"刺激下,由细胞分泌的具有抗病毒、抗肿瘤、抑制细胞增殖和免疫调节等多重作用的糖蛋白家族,在机体免疫系统中具有重要地位。树鼩作为多种人类疾病研究模型的前景已受到广泛关注,但对其IFN家族的研究尚属空白。该研究在现有的树鼩全基因组数据基础上,应用大片段核酸序列比对、基因预测等方法,对树鼩IFN家族的基本构成和分子特征进行预测和分析。结果显示,树鼩具有I型IFN:α(5个亚型)、β、ω、κ、ε、δ;II型IFN-γ;III型IFN:IFN-λ1、λ2/3,所编码的氨基酸序列及蛋白空间结构与其它哺乳动物具有较高的相似性,但在半胱氨酸位置和N糖基化个数上具有部分差异。该研究以全基因组数据对树鼩IFN家族信息进行系统挖掘和分析,为树鼩IFN的基因克隆以及其在感染免疫学中的作用和机理研究奠定了基础。

语至真处情亦深

记事抒情的文章怎样才能写出浓浓的情意呢?叶圣陶先生曾对此作出回答:“写自己的诚实的话。”叶老的这句话应该成为我们写作的指南。“写自己的”是要你写真正属于自己的生活。生活是写作的源泉,写作的目的就是表达自己对生活的理解。

开放性考场作文写作指津

从目前高考改革的趋势看,1999年高考作文题应作为我国高考史上的里程碑。可以想像,今后高考作文(也包括中考作文)会朝全方位的开放性迈进。因此,平时的作文教学也应顺应这一趋势,培养学生的创新能力与想像力。下面列举一例,谈谈开放性作文的写作思路。题目:以”

写作教学中语言训练一得

以寓教于乐的形式和循序渐进的步骤把语言训练贯穿在每一节语文课，通过系统的语言训练达到改善学生语言习惯．提高语言素养，激活形象思维，提升思维品质的目的，从而提高学生的写作水平。

云南省科技奖励成果贡献力分析

科技成果奖励是国家科技奖励制度的重要组成部分,是国家科技发展水平的重要体现,其获奖项目的类别、等级、数量是衡量一个地区、单位、个人自主创新能力和成就的重要评价指标之一,集中反映了科技创新领域的特点和方向。本文总结“十三五”期间云南科技成果奖励的成效及存在问题,重点对影响获奖项目的科研单位与科技人员的贡献力进行多维度数据分析,提出加强云南科技成果奖励制度管理,培养科技创新人才、提升技术创新与协同创新能力、提升技术成果转化率与技术产业规模化发展的相关对策。

面向中国—东盟自贸区的云南仪器设备境外共享服务策略研究

云南省的区位优势得天独厚,中国(云南)自贸区的建成为云南区域经济带来了新的发展机遇和挑战。本文针对包括自贸区在内的云南省昆明市及8个边境州市的仪器设备境外共享服务情况进行分析,从仪器设备、服务范围、服务能力和服务模式等方面开展积极探索,提出充分利用云南大型仪器设备共享平台发挥仪器设备检测服务的技术优势和区位优势,依托自贸区建立"一市三州"仪器设备共享服务子平台,创建"共建共享、区域联动、协同创新"的服务网络体系,为优化全省科技资源、创新仪器设备境外共享服务,推进云南东盟经贸发展提供有益借鉴。

生物多样性视角下的云南省生物医药产业发展对策研究

云南省生态环境复杂多样,生物物种多样性资源富集,是我国生物医药资源最大的省份。经过多年建设,云南省已发展成为中国生物医药产业的重点区域,特别是全球生物多样性第十五次缔约方大会在云南省昆明市的召开,为云南省生物医药产业持续发展带来了新的机遇。基于生物多样性保护与生物医药产业发展的密切关系,从生物多样性的视角重点分析云南省生物医药产业发展现状及存在问题,进而提出充分发挥云南省生物多样性优势、加强生物资源可持续利用、提高生物医药产业技术创新能力、推动云南省生物医药产业持续发展的对策建议。

基于C#的工作备忘系统设计与实现

随着社会分工的细化和工作节奏的加快,对协同工作的能力提出了更高的要求。工作备忘系统基于C#编程环境和Access数据库,利用网络通信、多线程、缓冲、异常处理等编程技术,实现任务管理和定时提醒功能,能够减少工作失误,提高工作效率。

逍遥丸联合舍曲林治疗抑郁症40例

目的探讨逍遥丸联合舍曲林治疗抑郁症的临床疗效和不良反应。方法将76例患者随机分成两组,对照组36例,单用舍曲林治疗,实验组40例,逍遥丸联合舍曲林治疗,疗程8周。采用汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评定疗效,采用副反应量表(TESS)评定治疗过程中的不良反应。结果治疗后两组HAMD评分均低于治疗前,实验组与对照组于第2、4、6、8周末比较,差异均有统计学意义(P<0.05);TESS显示实验组不良反应少,两组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论逍遥丸联合舍曲林治疗抑郁症可以显著改善临床症状,提高临床疗效,且不良反应少,安全性高。

通窍活血汤与涤痰汤加减治疗脑卒中后抑郁症30例疗效观察

目的:观察通窍活血汤与涤痰汤加减配合氟西治疗对脑卒中后抑郁症(PSD)的临床疗效。方法:将58例PSD患者随机分为治疗组和对照组,2组均服用氟西汀治疗,治疗组在西药氟西汀治疗的基础上加服通窍涤痰汤合涤痰汤加减治疗,观察分析2组的疗效评分。结果:治疗组的HAMD与MSSS评分都优于对照组(P<0.05)。结论:中西医结合治疗卒中后抑郁症安全有效,能显著改善患者抑郁状态,且副作用较小,值得临床推广应用。

中医药治疗高脂血症研究进展

高脂血症（hyperlipidemia，HLP）是由于脂质代谢紊乱或转运异常使血清或血浆中的一种或多种脂质高于正常的疾病。通常情况下，血清总胆固醇检测〉5．72mmol／L，甘油三酯检测〉2．3mmol／L，就可以诊断为高脂血症。大量研究表明高脂血症是动脉粥样硬化的主要危险因素之一。近年来，随着人们生活习惯特别是饮食结构的改变等多种因素的影响，高脂血症的发病率有明显上升的趋势。《中国成人血脂异常防治指南2007》指出：我国18岁以上血脂异常人群已经达到1．6亿，在35岁以上的人群中，有2500万人同时患有高血压和高脂血症。

通货膨胀对住房公积金的影响

通过现行经济形式下的中国通货膨胀对住房公积金的影响,摆事实,讲道理,从不同角度深入浅出的谈了关于通货膨胀到底对住房公积金发展有利还是有弊,以及解决之道,并对住房公积金的发展初衷提出了深刻的考问。

一种实用数字频率计的实现方法

目前测量频率的方法主要有计数法和周期法两种[1],其计数工作一般需要使用单片机来完成,虽然测量精度较高,但也会增加设计的工作量。本文介绍一种利用低频频压转换芯片设计高频数字频率计的方法,不仅可实现对高达200k Hz脉冲信号的测量,而且还能够大幅度降低设计成本。

聚焦“1+1”,构建纵横交互作业管理新范式

自“双减”政策实施以来,如何真正实现“减负提质增效”,成为学校面临的严峻课题。南乐县求实小学依据教育部办公厅发布的《关于加强义务教育学校作业管理的通知》要求,积极开展专题研究,进行科学诊断,深入探索“减总量、提质量”的作业设计管理新路径,最终形成了聚焦“1+1”,构建纵横交互的作业管理新范式。具体来说,“1+1”指作业的“总量+质量”。