BEguider:一个单碱基编辑器sgRNA设计与编辑效率预测工具

单碱基编辑器是实用且高效的基因编辑工具,其编辑效率与单向导RNA(single guide RNA,sgRNA)序列的设计密切相关。目前单碱基编辑器sgRNA序列的设计缺少特定的法则,主要依靠经验和大量尝试完成。本研究基于卷积神经网络,开发了一个单碱基编辑器sgRNA序列设计工具BEguider。BEguider利用TensorFlow 2深度学习框架建立编辑效率预测模型,能够在人基因组范围内针对NGG PAM序列依赖的单碱基编辑器ABE7.10-NGG和BE4-NGG批量设计sgRNA序列,预测编辑效率。此外,通过整合Cas-OFFinder,BEguider能够提供对sgRNA脱靶情况的评估。利用BEguider设计sgRNA序列,有助于研究人员提高实验效率,节约实验成本。

基于糖类物质差异鉴别掺假蜂蜜技术研究进展

天然蜂蜜具有较高的营养价值,但目前市场上蜂蜜产品的质量却良莠不齐。随着蜂蜜掺假手段的提高,我国现行的国家检测标准已无法满足市场需求。近几年来,蜂蜜中最难检测的掺假手段就是在天然蜂蜜中掺入高果糖浆。高果糖浆与真蜂蜜中糖类物质的组成较为相似,检测蜂蜜中掺入高果糖浆一直是研究的难点,但是蜂蜜中的糖类物质的稳定性碳同位素比值、空间结构、热力学温度、寡糖组成等方面与掺假糖浆是有一定区别的。主要对基于糖类物质差异鉴别掺假蜂蜜的技术进行了综述,提出了今后掺假蜂蜜鉴别技术的发展方向,以期促进蜂蜜市场的规范化发展。