为了确定楚雄市冬春季城郊区鸟类多样性,采用样点法在4个样地内对随机设置的17个样点进行了调查。本次调查共记录了鸟类2808只次,隶属于4目、16科、44种,雀形目鸟类占调查总数的88.64%,非雀形目占11.36%。结果表明,郊区的鸟类种数(33,27...为了确定楚雄市冬春季城郊区鸟类多样性,采用样点法在4个样地内对随机设置的17个样点进行了调查。本次调查共记录了鸟类2808只次,隶属于4目、16科、44种,雀形目鸟类占调查总数的88.64%,非雀形目占11.36%。结果表明,郊区的鸟类种数(33,27 vs 18,16)、物种多样性(Shannon's index 2.21,2.43 vs 2.12,2.00)、均匀度(0,68,0,75 vs 0.74,0.69)、科属多样性(G-index 3.06,2.92 vs 2.63,2.39 and F-index 6.12,3.64 vs 1.48,0.95)均比城区高,但相对多度(abundance)较低。展开更多
通过DNA从头测序分析人胸膜间皮瘤发生的高关联度突变基因。提取恶性胸膜间皮瘤(MPM)组织和正常胸膜组织DNA,构建基因文库,用Illumina HiSeqX Ten PE 150平台测序,将测序结果与人类基因组数据库的参考序列进行比对、注释,并对测序结果...通过DNA从头测序分析人胸膜间皮瘤发生的高关联度突变基因。提取恶性胸膜间皮瘤(MPM)组织和正常胸膜组织DNA,构建基因文库,用Illumina HiSeqX Ten PE 150平台测序,将测序结果与人类基因组数据库的参考序列进行比对、注释,并对测序结果进行过滤、错误率分布检查、GC含量分布检查分析。MPM组织DNA平均过滤37829946 bp,错误率小于0.12%,GC含量占41.17%,而正常胸膜组织DNA平均过滤39089681 bp,错误率小于0.1%,GC含量占41.7%,两者测序质量均在Q 30(≥80%)以上,MPM为87.43%,正常胸膜为88.36%。以上高质量测序数据通过BWA比对到参考基因组(GRCh 37/hg 19),得到最初比对序列,利用重复标记后的比对序列进行覆盖度、深度等统计,覆盖深度达到10 X以上该突变位点可信。结果显示,实验病例XL14覆盖深度达到10 X的占98.59%,覆盖率达到99.83%;对照病例Z5占98.50%,覆盖率达到99.79%。对该序列进行基因注释分析,发现一系列单核苷酸多态性、基因插入缺失、基因结构变异、基因拷贝数变异,筛选出总变异位点数29277个,可能致病的变异位点数22个,致病性的变异位点数5个,不确定变异有害性的位点数为3353个,其余变异位点均为良性。进一步对突变基因进行富集、关联性分析,预测出突变基因TXNDC2与人胸膜间皮瘤的发生高度相关,相关系数达到0.8以上;突变基因PIEN、ABCC1、UGT1A7、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A9、ALDH3B1、UGT1A5等与人胸膜间皮瘤有一定关联性,关联度在0~0.2之间。基因TXNDC2、PIEN、ABCC1、UGT1A7、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A9、ALDH3B1、UGT1A5的变异可能与人胸膜间皮瘤的发生发展有关。本实验为人胸膜间皮瘤分子诊断提供了参考。展开更多
文摘为了确定楚雄市冬春季城郊区鸟类多样性,采用样点法在4个样地内对随机设置的17个样点进行了调查。本次调查共记录了鸟类2808只次,隶属于4目、16科、44种,雀形目鸟类占调查总数的88.64%,非雀形目占11.36%。结果表明,郊区的鸟类种数(33,27 vs 18,16)、物种多样性(Shannon's index 2.21,2.43 vs 2.12,2.00)、均匀度(0,68,0,75 vs 0.74,0.69)、科属多样性(G-index 3.06,2.92 vs 2.63,2.39 and F-index 6.12,3.64 vs 1.48,0.95)均比城区高,但相对多度(abundance)较低。
基金Innovative Research Team(in Science and Technology)in University of Yunnan Province for R&D of Characteristic Plant Resources(IRTSTYN)Key Discipline in Biology of Yunnan Province and Chuxiong Normal University(05YJJSXK03)Yunnan Province Universities Key Laboratory of Applied Biology
