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基于广泛靶向代谢组学揭示不同时期漆树生漆中代谢物变化规律
1
作者
商慧颖
翟云雁
+4 位作者
鬲晓敏
刘帅
王尚林
周涛
柏国清
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期66-74,共9页
生漆是一种重要的天然涂料,具有耐热、耐腐蚀和抗酸等优良特性,已广泛应用于各领域。揭示漆树(Toxicodendron vernicifluum)生长过程中生漆代谢物的变化规律是充分挖掘其应用潜力的关键。利用广泛靶向代谢组学技术,通过主成分分析、正...
生漆是一种重要的天然涂料,具有耐热、耐腐蚀和抗酸等优良特性,已广泛应用于各领域。揭示漆树(Toxicodendron vernicifluum)生长过程中生漆代谢物的变化规律是充分挖掘其应用潜力的关键。利用广泛靶向代谢组学技术,通过主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析和聚类热图分析等方法,对不同发育阶段(基于割漆时间)漆树的韧皮部汁液进行分析,探讨不同时期漆树生漆中代谢物的差异和变化规律。结果显示,在不同时期生漆中共鉴定出529种代谢物,包括黄酮类、酚酸类、生物碱、鞣质、糖和醇类及脂质等13类。多元统计分析表明,第Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ期生漆的代谢特征相似,且与第Ⅰ期存在较大差异。对不同发育时期生漆代谢物进行比较分析,鉴定出92种共同差异代谢物,其中黄酮类化合物主要积累于第I期生漆中,而氨基酸及其衍生物、糖和醇类在后期生漆中含量较高。研究结果为全面了解不同时期漆树生漆的代谢特征提供了依据,对漆树资源的开发利用具有重要意义。
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关键词
漆树
代谢组学
生漆
差异代谢物
原文传递
细辛叶绿体基因组结构特征与系统进化分析
2
作者
周军辉
鬲晓敏
+4 位作者
李莎莎
陈尘
贾芸
张明英
柏国清
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第24期8191-8199,共9页
目的以细辛药材为材料,采用高通量测序和生物信息学技术组装完整的叶绿体基因组序列,明确其结构特征、系统发育位置。方法基于Illumina测序平台对细辛叶绿体基因组序列进行结构特征分析;同时,采用最大似然法(maximum likelihood,ML)构...
目的以细辛药材为材料,采用高通量测序和生物信息学技术组装完整的叶绿体基因组序列,明确其结构特征、系统发育位置。方法基于Illumina测序平台对细辛叶绿体基因组序列进行结构特征分析;同时,采用最大似然法(maximum likelihood,ML)构建马兜铃科的系统发育关系。结果华细辛和辽细辛叶绿体基因组全长为160521~160555 bp,表现出典型的四分体结构,且两者叶绿体基因组GC含量均为38.5%。细辛叶绿体基因组包含128个基因,其中85个蛋白质编码基因,34个t RNA基因,8个r RNA基因。此外,系统发育分析结果显示,基于完整的叶绿体基因组和蛋白编码数据集构建的拓扑树一致,细辛属物种和马蹄香属物种形成一个支持率的单系分支。结论细辛叶绿体基因组测序、组装、结构特征分析,发现其大小介于Asarum bracteolata和A.sieboldii var.seoulense之间,IR区存在rpl16、rps19、ycf1、rpl23等基因扩张,研究结果丰富了细辛属植物遗传资源,为该属物种分子鉴定、系统发育以及野生资源保护与开发利用等研究提供理论基础。
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关键词
细辛
华细辛
辽细辛
叶绿体基因组
组装
系统发育
原文传递
题名
基于广泛靶向代谢组学揭示不同时期漆树生漆中代谢物变化规律
1
作者
商慧颖
翟云雁
鬲晓敏
刘帅
王尚林
周涛
柏国清
机构
陕西省西安植物园(陕西省植物研究所)
西安交通大学药学院
中华全国供销合作总社西安生漆涂料研究所
出处
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期66-74,共9页
基金
国家自然科学基金(No.32201588,No.31800554)
陕西省重点研发计划(No.2020NY-083)。
文摘
生漆是一种重要的天然涂料,具有耐热、耐腐蚀和抗酸等优良特性,已广泛应用于各领域。揭示漆树(Toxicodendron vernicifluum)生长过程中生漆代谢物的变化规律是充分挖掘其应用潜力的关键。利用广泛靶向代谢组学技术,通过主成分分析、正交偏最小二乘法判别分析和聚类热图分析等方法,对不同发育阶段(基于割漆时间)漆树的韧皮部汁液进行分析,探讨不同时期漆树生漆中代谢物的差异和变化规律。结果显示,在不同时期生漆中共鉴定出529种代谢物,包括黄酮类、酚酸类、生物碱、鞣质、糖和醇类及脂质等13类。多元统计分析表明,第Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ期生漆的代谢特征相似,且与第Ⅰ期存在较大差异。对不同发育时期生漆代谢物进行比较分析,鉴定出92种共同差异代谢物,其中黄酮类化合物主要积累于第I期生漆中,而氨基酸及其衍生物、糖和醇类在后期生漆中含量较高。研究结果为全面了解不同时期漆树生漆的代谢特征提供了依据,对漆树资源的开发利用具有重要意义。
关键词
漆树
代谢组学
生漆
差异代谢物
Keywords
Toxicodendron vernicifluum
metabolomics
raw lacquer
differentially abundant metabolites
分类号
S794.2 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
细辛叶绿体基因组结构特征与系统进化分析
2
作者
周军辉
鬲晓敏
李莎莎
陈尘
贾芸
张明英
柏国清
机构
陕西省西安植物园(陕西省植物研究所)
陕西中医药大学药学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第24期8191-8199,共9页
基金
陕西省科学院科技计划项目(2017K-12,2021K-10)
西安市科技计划项目(20193021YF009NS009)
+2 种基金
西安市科学技术局“科技+”行动计划(20NYF0056)
陕西省创新能力支撑计划(2022KJXX-27)
陕西省自然科学基础研究计划项目(2022JM-458)。
文摘
目的以细辛药材为材料,采用高通量测序和生物信息学技术组装完整的叶绿体基因组序列,明确其结构特征、系统发育位置。方法基于Illumina测序平台对细辛叶绿体基因组序列进行结构特征分析;同时,采用最大似然法(maximum likelihood,ML)构建马兜铃科的系统发育关系。结果华细辛和辽细辛叶绿体基因组全长为160521~160555 bp,表现出典型的四分体结构,且两者叶绿体基因组GC含量均为38.5%。细辛叶绿体基因组包含128个基因,其中85个蛋白质编码基因,34个t RNA基因,8个r RNA基因。此外,系统发育分析结果显示,基于完整的叶绿体基因组和蛋白编码数据集构建的拓扑树一致,细辛属物种和马蹄香属物种形成一个支持率的单系分支。结论细辛叶绿体基因组测序、组装、结构特征分析,发现其大小介于Asarum bracteolata和A.sieboldii var.seoulense之间,IR区存在rpl16、rps19、ycf1、rpl23等基因扩张,研究结果丰富了细辛属植物遗传资源,为该属物种分子鉴定、系统发育以及野生资源保护与开发利用等研究提供理论基础。
关键词
细辛
华细辛
辽细辛
叶绿体基因组
组装
系统发育
Keywords
Asari Radix et Rhizoma
Asarum sieboldii Miq.
A.heterotropoides Fr.Schmidt var.mandshuricum(Maxim.)Kitag.
chloroplast genome
assembly
phylogenetic
分类号
R286.12 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于广泛靶向代谢组学揭示不同时期漆树生漆中代谢物变化规律
商慧颖
翟云雁
鬲晓敏
刘帅
王尚林
周涛
柏国清
《植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
2
细辛叶绿体基因组结构特征与系统进化分析
周军辉
鬲晓敏
李莎莎
陈尘
贾芸
张明英
柏国清
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
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