基于转录组测序的中华鳖SSR和SNP特征分析及性别标记筛选

【目的】挖掘更多中华鳖(Pelodiscus sinensis)性别分子标记,为中华鳖保护、繁育以及遗传多样性的分子机制等研究提供基础。【方法】基于中华鳖转录组测序数据,利用MISA和GATK挖掘中华鳖转录本中SSR和SNP位点信息,开发与中华鳖性别紧密相关的SNP标记。【结果和结论】共组装获得341632条Unigenes,识别到14804个SSR位点,含有SSR位点的Unigenes序列数量为13904条,占总序列的4.1%。中华鳖转录组中SSR位点类型较为丰富,共识别到6种不同核苷酸重复类型,单核苷酸串联重复基元类型的含量最多(10981个),占总位点数的74.18%。SSR位点以重复11~15次为主(6173个),占总位点数的41.70%。转录组SSR的片段长度大部分集中在10~14 bp,占SSR总数的50.01%。搜索到32299个SNP位点,SNP的分布密度为1/1339 bp。SNP变异类型以转换类型为主,转换类型占70.05%,颠换类型占29.95%。SNP测序深度统计发现,在31~100范围内,SNP数目最多,占43.68%。初步筛选并鉴定出位于Ptpn11基因上与性别紧密关联的SNP位点(29144910),为中华鳖性别分子标记提供候选基因和标记。

基于无壳孵化黄喉拟水龟胚胎发育活体观察

文章以黄喉拟水龟(Mauremys mutica)受精卵为材料,通过无壳孵化技术,对黄喉拟水龟胚胎发育进行活体观察,并记录胚胎发育全过程。在孵化温度为(32±0.5)℃时,孵化期平均为54d。在没有卵壳、没有外界水分和氧气的情况下,黄喉拟水龟胚胎能够完成发育全过程并成功孵出稚龟。根据胚胎发育的形态特征、时间将整个发育过程划分为1—19期。1—7期以卵黄囊血管丛、心脏形态与跳动作为分期依据;而8—19期主要以头部、四肢、背甲、颜色和尿囊等作为分期依据。无壳孵化技术在龟类胚胎发育观察中的成功应用,显示其有广泛的潜在应用前景。

中华鳖Dkkl1基因的分子特征及对外源性激素处理的响应

Dkkl1基因在哺乳动物睾丸发育和精子发生过程中扮演着重要角色,然而其在龟鳖类动物中的研究十分有限。为探索龟鳖类Dkkl1基因的潜在功能和作用机制,克隆了中华鳖(Pelodiscus sinensis)Dkkl1基因的cDNA片段,分析其序列特征、表达模式以及对外源性激素处理的响应。克隆获得的Dkkl 1基因cDN A序列长度为823 bp,其中3'-非编码区(UTR)为67 bp,5'UTR为90 bp,开放阅读框为666 bp,共编码222个氨基酸。中华鳖Dkkl1蛋白是一种稳定性较差、亲水性较强的碱性蛋白,其二级结构和三级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主。氨基酸序列同源性比对结果显示其与中华草龟(Chinemys reevesii)Dkkl1蛋白的相似性较高(81%),与棱皮龟(Dermochelys coriacea)Dkkl1蛋白的同源性较低(70%)。通过RT-PCR和RT-qPCR分析发现,中华鳖Dkkl1 mRNA在3冬龄成体精巢中极显著性高表达(P<0.001),而在其余体组织中几乎不表达。并且随着年龄的增长,中华鳖精巢中Dkkl1基因的表达量逐渐上升,并在3冬龄时达到顶峰。此外,17β-雌二醇(E2)和17α-甲基睾酮(17α-MT)处理均可显著抑制成体中华鳖精巢中Dkkl1基因的表达(P<0.05)。研究表明,Dkkl1基因可能在中华鳖睾丸发育和精子发生过程中起着重要作用。

云斑尖塘鳢幼鱼摄食特性的初步研究

研究了云斑尖塘鳢(Oxyeleotris marmorata)幼鱼的摄食特性。结果表明:在幼鱼阶段,云斑尖塘鳢的摄食方式为主动掠食;个体全长10mm的日摄食量约为体重的11.66%,40mm的日摄食量约为体重的51.04%,69mm的日摄食量约为体重的55.30%;日摄食量与幼鱼全长呈正相关关系:A=11.3577+0.7664L(r=0.876);云斑尖塘鳢幼鱼的适口饵料鱼全长为其全长的25%～50%,幼鱼摄食15～17h后可完全消化饵料鱼;云斑尖塘鳢幼鱼昼夜摄食节律明显,一昼夜出现一个摄食高峰,高峰时段为19:00-01:00。

不同饵料对黄喉拟水龟稚龟生长的影响

进行了3种饵料对黄喉拟水龟(Mauremys mutica Cantor)稚龟生长影响的试验研究.试验历时154 d.结果表明:1)稚龟平均日增重,鳙鱼肉组为0.13 g,配合饲料组为0.12 g,黄粉虫组为0.09 g.2)成活率,配合饲料组最高,为100%;黄粉虫组次之,为97.1%;鳙鱼肉组最低,为88.6%.3)饵料系数,鳙鱼肉组最高,为6.38,黄粉虫组次之,为3.56,配合饲料组最低,为1.83.结果显示,用配合饲料喂养黄喉拟水龟稚龟效果良好.

不同放养密度对云斑尖塘鳢幼鱼生长和存活的影响

对云斑尖塘鳢(Oxyeleotris marmorata)幼鱼在3种不同放养密度下的生长速度和成活率进行了对比试验。培育60 d后的调查结果表明,密度为每667 m2水体放养30 000尾比放养10 000尾或50 000尾更为合适,幼鱼成活率分别为91.3%、88.9%和85.7%。

三线闭壳龟的人工养殖与繁育技术

三线闭壳龟具有极高的食用、药用及观赏价值,但其野生资源已频临灭绝,人工繁育的龟苗数量极少,导致其价格连年剧升。在研究三线闭壳龟生物学特性基础上,阐述其人工养殖与繁育技术。

平胸龟的生物学特性与人工驯养

平胸龟是古老的龟类,长相奇特,具有较高的观赏价值;肉质鲜美,肉、壳均可入药。但人工养殖平胸龟较少,人工繁殖仍未获成功。介绍了平胸龟的生物学特性及人工驯养技术。

三线闭壳龟的研究进展及发展对策

三线闭壳龟(Cuora trifasciata)是分布较广的一种淡水龟。介绍了三线闭壳龟的地理分布、生物学特性、人工繁养殖技术、病害防治技术、营养成分的分析及种类鉴定等方面的研究进展,指出现今三线闭壳龟养殖及发展中存在的问题,并提出相应的对策,以期为三线闭壳龟的人工养殖和产业发展提供参考。

三线闭壳龟的养殖潜力及提高繁殖力的关键环节

三线闭壳龟因繁殖力低、野生资源枯竭、市场需求旺盛等因素,致其人工养殖有很好的市场前景.了解其生物学特性,挑选性成熟的成龟作为亲龟,加上精心培育等措施,可提高其繁殖力.

如何饲养平胸龟

平胸龟，别名鹰嘴龟、大头龟、鹰嘴龙尾鱼、三不像、鹦鹉龟等，是古老的龟类，我国及东南亚各国人民很久以前就把平胸龟作为著名的食用龟。其肉质细腻、味道鲜美；其肉、壳可入药，有滋阴祛风去湿的作用，对小孩遗尿有一定的疗效。平胸龟长相奇持，具有较高的观赏价值，其威武凶猛的气质顿受青少年喜爱。以平胸龟为基龟培育的绿毛龟，被称为鹰嘴龙尾绿毛龟，是绿毛龟品种中的珍品。

黄缘盒龟及其人工养殖优势

黄缘盒龟，原名黄缘闭壳龟，别名金头龟、断板龟、食蛇龟、黄板龟等，隶属于龟科、盒龟属。主要分布于我国南方各省，国外分布于日本等国。黄缘盒龟具有很高的药用和食用价值，人们更看重其观赏价值：此龟背甲奇高，看上去像半个皮球；胆子大，性情温顺，能与人建立感情，随人手势舞动，幼体的黄缘盒龟体色鲜艳，活跃而聪明，特别适合女孩子饲养。

金钱龟的人工繁殖

金钱龟Cuora trifasciata(Bell)，学名三线闭壳龟。又称红肚龟、断板龟等。分类上属爬行纲、龟鳖目、龟科、闭壳龟属。金钱龟是龟科中最名贵品种之一，集药用、食用、观赏于一身，其经济价值及药用价值已受国内外关注。金钱龟的人工繁殖较为复杂。但科学的管理会提高孵化成功率至85％以上。

黄喉拟水龟的养殖优势及其常见病害的防治

黄喉拟水龟是龟鳖类中名贵种之一.本文从黄喉拟水龟的开发利用的空间、野生资源状况、养殖条件等方面描述了其养殖优势;介绍了其人工饲养技术;分别列举了稚幼龟、成龟、亲龟的一些常见病害并提出了防治措施.

八种主要经济龟类简介及其养殖前景（二）

5平胸龟 平胸龟（Platysternon megacephalum），别名鹰嘴龟、大头龟、鹰嘴龙尾龟、三不像、鹦鹉龟等，分类上属爬行纲、龟鳖目、平胸龟科、平胸龟属。其分布较广，在我国南方各省及香港特别行政区均有出产。

八种主要经济龟类简介及其养殖前景（一）

本文主要介绍了黄喉拟水龟、三线闭壳龟、乌龟、黄缘盒龟、平胸龟、四眼斑龟、鳄龟、红耳龟的形态特征与生活习性、养殖技术及人工养殖前景。

黄喉拟水龟、三线闭壳龟、鳄龟的生长比较研究

本文对黄喉拟水龟、三线闭壳龟、鳄龟周年生长进行了研究与比较。在广州自然温度下 ,人工饲养黄喉拟水龟 343d ,平均体重由 10 .3g增到 71.9g ,生长率为 4 .37mg·g-1·d-1;三线闭壳龟 343d ,由 15 .6g增到 6 8.2g ,生长率为 3.6 8mg·g-1·d-1;鳄龟 36 3d ,由 10 .8g增到 2 6 3.1g ,生长率为 5 .0 8mg·g-1·d-1。即在生长速度上 ,鳄龟 >黄喉拟水龟 >三线闭壳龟。在周年生长中 ,三种龟体重、背甲长、背甲宽与日龄 ;背甲长与宽 ;背甲长、宽与体重 ;均有着显著的正相关关系。温度与龟的生长有密切关系 ,低温抑制龟的生长 ,其影响程度依次为黄喉拟水龟 >三线闭壳龟 >鳄龟。同等条件下 ,三种龟个体间生长有差异 ,差异大小为鳄龟 >黄喉拟水龟 >三线闭壳龟。饵料转化效果 ,鳄龟 >黄喉拟水龟 >三线闭壳龟。日粮需求 ,三线闭壳龟 >黄喉拟水龟 >

黄喉拟水龟雌、雄生长及形态差异

人工饲养新孵出黄喉拟水龟(MauremysmuticCantor)龟苗,试验期为44个月。观察与测量结果表明,雌、雄性别在背甲长、背甲宽、体高的形态参数及其与体重的相关关系上没有明显差异;雌、雄性别形态的区别在于第二性征的出现,即雌性腹甲平坦,尾巴短小,泄殖孔近尾基部;雄性腹甲内凹,尾巴粗壮,泄殖孔远离尾基部。雌、雄生长存在明显差异,雄性生长快于雌性。在试验期间,雄性个体增重为雌性个体的1.253倍。