大豆中GmRAD与GmDIV基因的in silico鉴定及表达分析

RAD与DIV属于MYB转录因子家族成员,在金鱼草研究中发现它们对花对称性的形成起着重要作用。本研究利用全基因组信息鉴定了大豆中的GmRAD与GmDIV基因,分析了其蛋白的理化性质、二级结构,基因结构与其在染色体上的分布,并对其系统发生和表达方式进行了研究。研究表明:大豆中存在5个GmRAD基因和5个GmDIV基因,它们分别属于MYB家族的R1和R2R3类,分布在大豆的9条染色体上;进化分析显示GmRAD和GmDIV基因具有不同的进化历程,GmDIV比GmRAD基因更趋于单元发生;表达分析证明,GmDIV和GmRAD成员具有不同的表达模式,其中GmRAD3和GmRAD5以及GmDIV1、GmDIV3、GmDIV4和GmDIV5在花组织中有较高的表达。

W-POS语言模型及其选择与匹配算法

n-grams语言模型旨在利用多个词的组合形式生成文本特征,以此训练分类器对文本进行分类。然而n-grams自身存在冗余词,并且在与训练集匹配量化的过程中会产生大量稀疏数据,严重影响分类准确率,限制了其使用范围。对此,基于n-grams语言模型,提出一种改进的n-grams语言模型——W-POS。将分词后文本中出现概率较小的词和冗余词用词性代替,得到由词和词性的不规则排列组成的W-POS语言模型,并提出该语言模型的选择规则、选择算法以及与测试集的匹配算法。在复旦大学中文语料库和英文语料库20Newsgroups中的实验结果表明,W-POS语言模型既继承了n-grams语言模型减少特征数量、携带部分语义和提高精度的优点,又克服了n-grams语言模型产生大量稀疏数据、含有冗余词的缺陷,并验证了选择和匹配算法的有效性。

新基建背景下的智慧灯杆建设与发展分析

随着5G网络建设范围的不断扩大,各级政府部门对于新型基础设施建设给予了高度的关注,尤其是针对以物联网为基础的智慧灯杆的建设,不仅制定了相应的基建政策要求,而且也结合实际发展现状提出了新的完善措施,以便更好地发挥智慧灯杆的应用优势和应用性能,为促进智慧城市建设打下良好的基础。本文针对新基建背景下如何加强智慧灯杆建设进行着重的分析,并根据灯杆建设过程中存在的问题以及发展现状等提出相应的优化措施,以便有关人士参考借鉴。

大豆AP2/ERF基因家族的分子进化分析

AP2/ERF类型基因家族在植物发育中起着重要的作用,本文鉴定了大豆AP2/ERF基因家族,分析了该基因家族的进化途径,研究了其在种子发育过程中的基因表达模式,并对其功能进行了预测。研究表明:大豆AP2/ERF家族包括355个基因,分属于AP2、RAV和ERF三个亚家族;AP2/ERF基因在进化过程中出现了两次较大的分歧;发现了7个与大豆分化显著相关的AP2/ERF基因,利用拟南芥直系同源基因对这些基因的功能进行了预测;在大豆种子发育的过程中,该家族基因呈现10类不同的表达模式,在种子发育的各个过程中起着不同的作用。

油菜裂外壁小孢子胚在分子水平上具有胚体/胚柄分化

早期合子胚取材困难,难以开展相关研究。前人的工作表明,油菜(Brassica napus)裂外壁小孢子胚胎发生系统能够较好地模拟合子胚的分化模式,因而可替代早期合子胚胎作为研究材料。但目前尚缺乏该胚胎发生系统中胚胎具有胚体/胚柄分化的分子水平的证据。该文首次证明了油菜WOX家族基因能够用于标记胚体/胚柄的分化过程,利用胚柄标记基因Bn WOX8的表达模式,从分子水平上证明了带胚柄的裂外壁小孢子胚的确存在胚体/胚柄的分化。研究结果为充分利用油菜裂外壁小孢子胚胎发生系统,解决早期胚胎取材困难的问题奠定了坚实的基础。同时,建立了活体激光切割分离特定细胞的技术,结合用于少量细胞RNA提取的活体特异细胞RNA提取技术,为鉴定少量特异分化细胞的基因表达模式提供了一个可行且明确的解决方案。

大豆KNOX基因家族的结构和表达分析

KNOX基因家族编码同源异型盒蛋白,在植物生长发育过程中起重要调控作用。利用生物信息学手段在全基因组水平上对大豆(Glycinemax)KNOX家族基因进行鉴定和分类,并分析其基因结构、蛋白同源结构域特征以及基因表达方式。研究结果表明:大豆中的27个GmKNOX基因可以分为GmKNOXI和GmKNOXII两个亚类,其中GmKNOXI类可分为3个主要的进化支,GmKNOXII类分为2个主要的进化支;26个GmKNOX基因不均匀地分布在16条染色体上,GmKNOX27尚无法定位。不同组织表达谱的分析表明:GmKNOXI类基因表达部位比较集中,以茎顶端分生组织中表达量最高;而GmKNOXII类基因的表达特异性较GmKNOXI类低,表达部位更广泛。

盐芥和拟南芥在不同胁迫下生理及ABA受体基因的响应

本文以盐生植物盐芥和甜土植物拟南芥为实验对象,利用生物信息学手段分析两者ABA受体的进化关系和保守结构域,比较和研究了盐芥和拟南芥在400 mmol·L-1甘露醇、200 mmol·L-1 Na Cl和50μmol·L-1 ABA处理下的根生长,相对含水量和渗透压等生理指标的差异及ABA受体基因在胁迫条件下的表达变化。结果表明,在盐和干旱胁迫条件下,盐芥根的伸长率和侧根数目显著高于拟南芥,表明前者抗逆性较强。ABA受体基因的表达在两者之间存在差异,PYL4、PYL5、PYL6、PYL7和PYL9在两者中表达变化趋势一致,PYR1、PYL1、PYL10和PYL13在盐芥和拟南芥中表达趋势相反,结合生理指标推测两者在ABA信号途径中可能存在差异。