克雷伯氏肺炎杆菌内抗亚碲酸盐蛋白质TerZ延伸环降低对钙离子亲合性（英文）

亚碲酸盐是碲的一含氧阴离子,其对微生物具高度毒性.在许多的致病菌内已经鉴定出数个抗亚碲酸盐基因(terZABCDEF).之前,作者解出抗亚碲酸盐蛋白质TerD液体核磁共振结构并指出在细菌内TerD可能是一钙离子传感器.TerZ与TerD在序列上有40%相同性,其包括了一额外的9氨基酸片段L36-N44,并且显示出非常弱的钙离子亲合性.有趣的是,少了额外片段的TerZdel拥有与TerD可比较的钙离子亲合性.根据化学位移指数及同源模拟结果,此额外片段为一无二级结构且延伸的loop,可能扰乱钙离子结合位置的构形,同时也阻碍了钙离子接近其结合位置,因此大大降低钙离子亲合性.

gRNA二级结构对拟南芥HD2基因CRISPR/Cas9编辑率的影响

近年来,利用基因编辑工具编辑特定基因逐渐成为一种获得突变体的主要方法。CRISPR/Cas9编辑技术是目前最新和最高效的基因编辑技术。然而,这一技术在植物中的编辑率受到很多因素的影响,例如如何设计gRNA以及如何避免脱靶效应等。为了探究gRNA的二级结构对拟南芥基因编辑的影响,我们选择了拟南芥基因组中的组蛋白去乙酰化酶(HDACs)基因家族中一个植物特有的亚家族(HD2)为靶基因,通过设计这一亚家族中3个HD2基因不同的CRISPR/Cas9靶点,观察不同gRNA接头二级结构对CIRSPR/Cas9编辑率的影响。结果显示:不同gRNA接头二级结构对基因的编辑率会有一定的影响,当二级结构由一段单链RNA、5个茎环、2个突环和3个发夹环组成的时候,编辑率最高。该研究可为后续人们使用以tRNA为策略设计gRNA的CRISPR/Cas9工具时选择合适的靶点,为提高基因编辑率提供基础。