过表达阿尔茨海默病细胞模型中lncRNA SNHG16后DNA甲基转移酶1的变化

目的:探讨过表达阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)细胞模型中lncRNA SNHG16后DNA甲基转移酶1(DNMT1)的变化,为治疗阿尔茨海默病提供新的思路。方法:实验分为SH-SY5Y组;SH-SY5Y+Aβ1-42组;SH-SY5Y+Aβ1-42+pcDNA3.1(+)组;SH-SY5Y+Aβ1-42+pcDNA3.1(+)-SNHG16组进行,采用CCK 8检测法检测各实验组细胞的存活率;应用Real-time PCR实时荧光定量PCR检测各个实验组细胞中SNHG16和DNMT1的mRNA表达情况;用免疫细胞化学检测法检测各个实验组细胞中DNA甲基化转移酶1(DNMT1)蛋白的表达量。结果:通过比较SH-SY5Y组和SH-SY5Y+Aβ1-42组,后者SNHG16和DNMT1的mRNA表达降低;SH-SY5Y+Aβ1-42+pcDNA3.1(+)-SNHG16组较SH-SY5Y+Aβ1-42组DNMT1蛋白表达增加。结论:过表达lncRNA SNHG16可能提高阿尔茨海默病细胞模型中DNA甲基化转移酶1的表达量。

阿尔兹海默病细胞模型中差异表达lncRNA筛选分析

目的:通过基因测序筛查阿尔兹海默病模型SH-SY5Y细胞中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的差异表达,发现与AD发病相关的lncRNA,分析其生物学功能。方法:通过Illumina X10基因测序技术检测3组AD模型SH-SY5Y细胞及正常SH-SY5Y细胞中差异表达lncRNA情况,利用GO和KEGG富集分析进一步分析lncRNA的功能,确定AD模型SH-SY5Y细胞及正常SH-SY5Y细胞的差异表达谱,Real-time PCR验证部分差异表达lncRNA。结果:差异表达lncRNA共100个,其中40个lncRNA表达上调,60个lncRNA表达下调;GO和KEGG通路分析表明这些差异表达基因主要参与到MAPK信号通路、p53信号通路、细胞周期等信号通路。Real-time PCR验证结果显示7个差异表达的lncRNA上调或下调趋势与测序结果一致。结论:与正常SH-SY5Y细胞相比,AD模型SH-SY5Y细胞中lncRNA的表达水平明显改变,这些lncRNA可能通过某些信号通路参与AD的发生发展,这对进一步寻找诊断和治疗AD的新靶点具有重要意义。