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基于微小核糖核酸筛选和竞争性内源核糖核酸网络构建的尿酸盐肾沉积机制研究
1
作者
安笑叶
毛秋月
+4 位作者
刘泽宇
鲁程锦
张冰
林志健
王雨
《世界中医药》
CAS
北大核心
2024年第13期1896-1901,共6页
目的:构建竞争性内源核糖核酸(ceRNA)以揭示尿酸盐肾沉积分子调控机制。方法:复制尿酸盐肾沉积大鼠模型,采用高通量核糖核酸(RNA)测序技术分析尿酸盐肾沉积大鼠肾组织中微小核糖核酸(miRNA)的表达,并筛选出差异表达的miRNA。利用TargetS...
目的:构建竞争性内源核糖核酸(ceRNA)以揭示尿酸盐肾沉积分子调控机制。方法:复制尿酸盐肾沉积大鼠模型,采用高通量核糖核酸(RNA)测序技术分析尿酸盐肾沉积大鼠肾组织中微小核糖核酸(miRNA)的表达,并筛选出差异表达的miRNA。利用TargetScan、StarBase、miRDB、miRWalk 4个数据库预测miRNA的靶基因,通过DAVID和Metascape数据库对靶基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。运用Cytoscape构建主要信号通路的ceRNA调控网络。结果:测序共检测到14个差异miRNA(均为上调),该差异miRNA的靶基因主要富集在细胞衰老和癌症相关信号通路;构建获得的ceRNA调控网络含47个长链非编码RNA(lncRNA)节点、10个miRNA节点、27个信使RNA(mRNA)节点,该调控网络中miR-155-5p、miR-132-3p、miR-503-5p、miR-146b-5p和miR-212-5p为排名前5的HUB基因。结论:本研究通过筛选尿酸盐肾沉积差异miRNA,构建了尿酸盐肾沉积ceRNA网络,为尿酸盐肾沉积机制探讨提供了新思路。
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关键词
尿酸盐肾沉积
miRNA测序
miRNA
lncRNA
ceRNA
生信预测
作用机制
细胞衰老
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题名
基于微小核糖核酸筛选和竞争性内源核糖核酸网络构建的尿酸盐肾沉积机制研究
1
作者
安笑叶
毛秋月
刘泽宇
鲁程锦
张冰
林志健
王雨
机构
北京中医药大学中药学院
出处
《世界中医药》
CAS
北大核心
2024年第13期1896-1901,共6页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(82104475)——基于ABCG2靶向分子轴探讨尿酸盐肾沉积机制及中药干预研究
国家自然科学基金联合基金项目(U20A20406)——“整合论治”策略下菊苓颗粒抗痛风病基础研究。
文摘
目的:构建竞争性内源核糖核酸(ceRNA)以揭示尿酸盐肾沉积分子调控机制。方法:复制尿酸盐肾沉积大鼠模型,采用高通量核糖核酸(RNA)测序技术分析尿酸盐肾沉积大鼠肾组织中微小核糖核酸(miRNA)的表达,并筛选出差异表达的miRNA。利用TargetScan、StarBase、miRDB、miRWalk 4个数据库预测miRNA的靶基因,通过DAVID和Metascape数据库对靶基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。运用Cytoscape构建主要信号通路的ceRNA调控网络。结果:测序共检测到14个差异miRNA(均为上调),该差异miRNA的靶基因主要富集在细胞衰老和癌症相关信号通路;构建获得的ceRNA调控网络含47个长链非编码RNA(lncRNA)节点、10个miRNA节点、27个信使RNA(mRNA)节点,该调控网络中miR-155-5p、miR-132-3p、miR-503-5p、miR-146b-5p和miR-212-5p为排名前5的HUB基因。结论:本研究通过筛选尿酸盐肾沉积差异miRNA,构建了尿酸盐肾沉积ceRNA网络,为尿酸盐肾沉积机制探讨提供了新思路。
关键词
尿酸盐肾沉积
miRNA测序
miRNA
lncRNA
ceRNA
生信预测
作用机制
细胞衰老
Keywords
Urate deposition in kidneys
MiRNA sequencing
MiRNA
lncRNA
CeRNA
Bioinformatics prediction
Mechanism of action
Cell senescence
分类号
R255.6 [医药卫生—中医内科学]
R228 [医药卫生—中医基础理论]
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1
基于微小核糖核酸筛选和竞争性内源核糖核酸网络构建的尿酸盐肾沉积机制研究
安笑叶
毛秋月
刘泽宇
鲁程锦
张冰
林志健
王雨
《世界中医药》
CAS
北大核心
2024
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