肉鸭肠道微生物空间异质性分析

【目的】本试验旨在通过宏基因组测序、物种注释和功能注释比较肉鸭不同肠段的微生物群落多样性、种类、相对丰度差异,探究肉鸭肠道微生物的空间异质性。【方法】选取饲养于相同环境的6周龄北京鸭和连城白鸭共6个个体,依次采集其十二指肠、空肠、回肠和盲肠内容物,基于宏基因组测序方法获得肠道微生物的种类和相对丰度。基于微生物丰度表,利用wilcoxon秩和检验进行不同肠段的优势微生物、微生物种类数、微生物相对丰度、微生物群落多样性和微生物功能多样性差异比较,并利用t检验筛选了北京鸭和连城白鸭各肠段的显著差异菌属。【结果】本试验共鉴定到45个菌门、84个菌纲、186个菌目、418个菌科、1400个菌属和3467个菌种。其中4个肠段的优势菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria),四大菌门在不同肠段之间分布存在差异。4个肠段的优势菌属均为拟杆菌属(Bacteroides)和Phocaeicola等10个相同菌属,而且优势菌属的种类和丰度在不同肠段存在组间差异。从十二指肠到盲肠,微生物的组成、相对丰度和群落多样性变化显著(P<0.05),其中十二指肠、空肠和回肠的微生物组成相似性很高,与盲肠微生物存在明显分离;同时,盲肠微生物的群落多样性也极显著高于其他肠段(P<0.01)。与十二指肠、空肠、回肠相比,盲肠微生物的细菌趋化性、氨基糖、核苷酸糖代谢脂肪酸的生物合成等代谢通路均上调,且盲肠富集到31个北京鸭和连城白鸭差异菌属,数量高于十二指肠、空肠、回肠。【结论】肉鸭盲肠富集的微生物数量、相对丰度、群落多样性均高于十二指肠、空肠和回肠。本研究结果为解析肉鸭肠道微生物调控机制和精准调控肉鸭的能量代谢水平和免疫机能提供理论依据,为肉鸭肠道微生物的进一步研究提供借鉴。

鸭掌相关性状研究进展与分析

鸭掌作为具有重要经济价值的家禽副产品,其消费需求迅速增加。尺寸越大、重量越重的鸭掌越受消费者喜爱,品质育种是获得该优良性状的手段之一。国内外学者开展了关于鸭掌形态、重量、尺寸、肉质等性状的研究,但与鸭掌品质育种的相关研究未见报道。全面理解鸭掌生长发育的调控机制,筛选与之相关的遗传标记,是开展鸭掌品质育种的重要理论基础,可为肉鸭品种改良工作提供重要的遗传资源。因此,作者就有关鸭掌各性状的研究进展进行综述,介绍了鸭掌的基本构造及鸭掌外观形态、重量、尺寸、肉质的测量指标和方法,简述了鸭掌在鸭胚胎时期的发育过程,重点讨论了影响鸭掌的尺寸、重量、外观形态和肉质的因素,从遗传角度分析了对鸭掌进行品质育种的可行性,整理了在前期研究中发现的与鸭掌有关的基因和遗传标记,分析了鸭掌肉品质研究的现代技术和应用前景。最后,对未来鸭掌的育种方向提出了展望,主张利用现代技术对鸭掌进行准确评估,并且通过筛选与跖骨和趾骨相关的分子遗传标记,培育出拥有尺寸更大、重量更重的鸭掌的肉鸭品系,不仅有更高的经济价值,还有利于鸭的健康,进一步提高生产性能,为肉鸭遗传改良和相关行业的发展奠定基础。