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棉花苯丙氨酸解氨酶基因家族的生物信息学分析
被引量:
8
1
作者
李雨哲
邢淋雪
+3 位作者
刘梦洁
刘苏瑶
鲍梦楠
刘震
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2021年第1期66-74,共9页
【目的】苯丙氨酸解氨酶是苯丙烷类代谢的关键酶,对调节植物生长和抗逆有重要作用。从全基因组层次了解棉花苯丙氨酸解氨酶基因家族的进化和功能,可为相关研究提供数据支撑。【方法】利用HMMER和BLASTP从棉花基因组筛选苯丙氨酸解氨酶...
【目的】苯丙氨酸解氨酶是苯丙烷类代谢的关键酶,对调节植物生长和抗逆有重要作用。从全基因组层次了解棉花苯丙氨酸解氨酶基因家族的进化和功能,可为相关研究提供数据支撑。【方法】利用HMMER和BLASTP从棉花基因组筛选苯丙氨酸解氨酶基因家族,利用MEGA-X进行进化分析,利用MCScanX进行共线性分析,并利用NCBI SRA的数据进行表达分析。【结果】本研究分别从陆地棉、海岛棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉基因组中筛选到12、13、7、8个苯丙氨酸解氨酶基因,依据进化分析和共线性关系数据,我们推测四种棉花的二倍体祖先起初应有6个苯丙氨酸解氨酶基因。顺式作用元件分析结果表明,苯丙氨酸解氨酶基因家族含有较多的光响应、激素响应、胁迫响应和生长发育相关的元件。苯丙氨酸解氨酶的蛋白序列具有保守的基序。陆地棉的12个苯丙氨酸解氨酶在低温、高温、盐和PEG胁迫下有不同的表达方式。【结论】本研究明确了苯丙氨酸解氨酶在棉花基因组中的数量、理化性质、进化和表达特征,为苯丙氨酸解氨酶的深入研究提供了参考。
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关键词
苯丙氨酸解氨酶
棉花
基因家族
表达
生物信息学
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职称材料
汤川瘿蜂寄生性天敌调查及其优势天敌长尾小蜂生物学特性
2
作者
张元臣
鲍梦楠
+4 位作者
薛爽
王璞
王兴云
张坤朋
王景顺
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期112-117,共6页
【目的】明确汤川瘿蜂虫瘿内寄生性天敌种类,研究其优势天敌的生物学特性,为利用寄生性天敌防治汤川瘿蜂提供科学依据。【方法】对汤川瘿蜂虫瘿进行林间调查、室内解剖和室内试验,明确虫瘿内寄生性天敌种类及其优势天敌长尾小蜂的生物...
【目的】明确汤川瘿蜂虫瘿内寄生性天敌种类,研究其优势天敌的生物学特性,为利用寄生性天敌防治汤川瘿蜂提供科学依据。【方法】对汤川瘿蜂虫瘿进行林间调查、室内解剖和室内试验,明确虫瘿内寄生性天敌种类及其优势天敌长尾小蜂的生物学特性。【结果】汤川瘿蜂无性世代虫瘿内主要有长尾小蜂、金小蜂和啮小蜂3种寄生性天敌,其中长尾小蜂为优势天敌。长尾小蜂1年发生1代,以幼虫在无性虫瘿内越冬,越冬成虫10月下旬开始出瘿,产卵于无性虫瘿内。2019和2020年连续2年虫瘿调查发现,长尾小蜂对汤川瘿蜂无性世代寄生率分别为18.00%和21.86%。寄生蜂羽化期持续81~85天,雌雄虫羽化高峰期分别在11月下旬和11月中旬,羽化时间集中在上午8:00―12:00,雌雄性比为1∶2。长尾小蜂善跳跃,有假死性,雌雄成虫羽化后当天即可交配,有多次交配现象。补充蜂蜜水可显著延长雄性长尾小蜂寿命,对雌性长尾小蜂寿命没有显著影响。【结论】汤川瘿蜂无性世代虫瘿内有长尾小蜂、金小蜂和啮小蜂3种寄生性天敌,长尾小蜂对汤川瘿蜂寄生率最高,为优势寄生蜂种,可作为防治汤川瘿蜂的重要手段。
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关键词
汤川瘿蜂
长尾小蜂
虫瘿
生物学特性
寄生天敌
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职称材料
题名
棉花苯丙氨酸解氨酶基因家族的生物信息学分析
被引量:
8
1
作者
李雨哲
邢淋雪
刘梦洁
刘苏瑶
鲍梦楠
刘震
机构
安阳工学院
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2021年第1期66-74,共9页
基金
中国博士后科学基金(2018M632761)。
文摘
【目的】苯丙氨酸解氨酶是苯丙烷类代谢的关键酶,对调节植物生长和抗逆有重要作用。从全基因组层次了解棉花苯丙氨酸解氨酶基因家族的进化和功能,可为相关研究提供数据支撑。【方法】利用HMMER和BLASTP从棉花基因组筛选苯丙氨酸解氨酶基因家族,利用MEGA-X进行进化分析,利用MCScanX进行共线性分析,并利用NCBI SRA的数据进行表达分析。【结果】本研究分别从陆地棉、海岛棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉基因组中筛选到12、13、7、8个苯丙氨酸解氨酶基因,依据进化分析和共线性关系数据,我们推测四种棉花的二倍体祖先起初应有6个苯丙氨酸解氨酶基因。顺式作用元件分析结果表明,苯丙氨酸解氨酶基因家族含有较多的光响应、激素响应、胁迫响应和生长发育相关的元件。苯丙氨酸解氨酶的蛋白序列具有保守的基序。陆地棉的12个苯丙氨酸解氨酶在低温、高温、盐和PEG胁迫下有不同的表达方式。【结论】本研究明确了苯丙氨酸解氨酶在棉花基因组中的数量、理化性质、进化和表达特征,为苯丙氨酸解氨酶的深入研究提供了参考。
关键词
苯丙氨酸解氨酶
棉花
基因家族
表达
生物信息学
Keywords
phenylalanine ammonia-lyase
cotton
gene family
expression
bioinformatics
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
汤川瘿蜂寄生性天敌调查及其优势天敌长尾小蜂生物学特性
2
作者
张元臣
鲍梦楠
薛爽
王璞
王兴云
张坤朋
王景顺
机构
安阳工学院生物与食品工程学院
河南省太行山林业有害生物野外科学观测研究站
南京林业大学生物与环境学院
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期112-117,共6页
基金
国家青年自然科学基金项目(31802007)
河南省教育厅高校重点项目(22B220001)
+1 种基金
河南省科技攻关计划(212102110449)
安阳工学院博士后科研启动基金(BSH2020006,BHJ2019002)。
文摘
【目的】明确汤川瘿蜂虫瘿内寄生性天敌种类,研究其优势天敌的生物学特性,为利用寄生性天敌防治汤川瘿蜂提供科学依据。【方法】对汤川瘿蜂虫瘿进行林间调查、室内解剖和室内试验,明确虫瘿内寄生性天敌种类及其优势天敌长尾小蜂的生物学特性。【结果】汤川瘿蜂无性世代虫瘿内主要有长尾小蜂、金小蜂和啮小蜂3种寄生性天敌,其中长尾小蜂为优势天敌。长尾小蜂1年发生1代,以幼虫在无性虫瘿内越冬,越冬成虫10月下旬开始出瘿,产卵于无性虫瘿内。2019和2020年连续2年虫瘿调查发现,长尾小蜂对汤川瘿蜂无性世代寄生率分别为18.00%和21.86%。寄生蜂羽化期持续81~85天,雌雄虫羽化高峰期分别在11月下旬和11月中旬,羽化时间集中在上午8:00―12:00,雌雄性比为1∶2。长尾小蜂善跳跃,有假死性,雌雄成虫羽化后当天即可交配,有多次交配现象。补充蜂蜜水可显著延长雄性长尾小蜂寿命,对雌性长尾小蜂寿命没有显著影响。【结论】汤川瘿蜂无性世代虫瘿内有长尾小蜂、金小蜂和啮小蜂3种寄生性天敌,长尾小蜂对汤川瘿蜂寄生率最高,为优势寄生蜂种,可作为防治汤川瘿蜂的重要手段。
关键词
汤川瘿蜂
长尾小蜂
虫瘿
生物学特性
寄生天敌
Keywords
Cerroneuroterus yukawamasudai
Torymus sp.
galls
biological characteristics
parasitoids
分类号
S718.7 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
棉花苯丙氨酸解氨酶基因家族的生物信息学分析
李雨哲
邢淋雪
刘梦洁
刘苏瑶
鲍梦楠
刘震
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2021
8
下载PDF
职称材料
2
汤川瘿蜂寄生性天敌调查及其优势天敌长尾小蜂生物学特性
张元臣
鲍梦楠
薛爽
王璞
王兴云
张坤朋
王景顺
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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