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燕山山脉西伯利亚杏的遗传多样性和遗传结构
被引量:
13
1
作者
刘华波
王哲
+4 位作者
刘君
麻丽颖
王斯琪
唐岩
庞晓明
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第8期68-74,共7页
以西伯利亚杏分布的核心区域燕山山脉地区的17个群体为材料,利用9对微卫星标记进行遗传多样性和遗传结构的分析。在533个个体扩增得到203个等位基因,每位点平均等位基因数为22.556个。分析表明燕山山脉西伯利亚杏群体具有较高的遗传多样...
以西伯利亚杏分布的核心区域燕山山脉地区的17个群体为材料,利用9对微卫星标记进行遗传多样性和遗传结构的分析。在533个个体扩增得到203个等位基因,每位点平均等位基因数为22.556个。分析表明燕山山脉西伯利亚杏群体具有较高的遗传多样性,每位点平均有效等位基因数(Ne)为5.714,多态位点百分率(P)为100%,期望杂合度(He)为0.788。根据有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)和Shannon信息指数(I)3个遗传多样性参数,遗传多样性最高的群体为北京八达岭,其次为平泉榆树林子,而最低的群体为崇礼驿马图。群体间总的遗传分化系数FST为0.065,总的基因流Nm为3.836。分子方差分析(AMOVA)结果显示燕山山脉地区西伯利亚杏群体的遗传变异主要存在于群体内(95.62%)。Mantel检验发现遗传距离与地理距离呈显著相关性(r=0.5894,P<0.0001)。UPGMA聚类结果显示,地理距离接近的群体聚在一起,进一步验证了Mantel检验结果。基于上述分析结果,提出西伯利亚杏的种质收集策略。研究结果为西伯利亚杏可持续利用与保护提供一定的理论依据。
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关键词
西伯利亚杏
微卫星
遗传多样性
群体遗传结构
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职称材料
36份枣品种SSR指纹图谱的构建
被引量:
64
2
作者
麻丽颖
孔德仓
+3 位作者
刘华波
王斯琪
李颖岳
庞晓明
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期647-654,共8页
利用12对SSR引物对36个枣品种进行分析,采用荧光M13毛细管电泳技术进行多态检测,共检测到99个多态位点,每对引物的多态位点数达到8.25,PIC值变幅为0.62~0.85,平均为0.75。依据12对SSR引物在36个品种中扩增的特异带型组合,采用引物—带...
利用12对SSR引物对36个枣品种进行分析,采用荧光M13毛细管电泳技术进行多态检测,共检测到99个多态位点,每对引物的多态位点数达到8.25,PIC值变幅为0.62~0.85,平均为0.75。依据12对SSR引物在36个品种中扩增的特异带型组合,采用引物—带型组合法构建了36个枣品种的指纹图谱,并对这36份枣品种做聚类分析,遗传相似系数在0.6667~0.9444之间。研究结果为枣树分类、种质鉴定和分子育种提供了重要的工具。
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关键词
枣
SSR
指纹图谱
毛细管电泳
遗传相似性
原文传递
利用SSR标记进行枣树子代苗父本鉴定
被引量:
24
3
作者
王斯琪
唐诗哲
+8 位作者
孔德仓
贺润平
刘华波
麻丽颖
刘君
王哲
李颖岳
申连英
庞晓明
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期2133-2141,共9页
利用SSR标记技术对‘冬枣’自然授粉实生苗1728株和‘灵宝大枣’自然授粉实生苗530株进行父本鉴定,利用可能的父本材料从376对引物中筛选出8对条带清晰、多态性较高且具有高度区分度的引物。采用荧光M13毛细管电泳技术,用这8对引物在亲...
利用SSR标记技术对‘冬枣’自然授粉实生苗1728株和‘灵宝大枣’自然授粉实生苗530株进行父本鉴定,利用可能的父本材料从376对引物中筛选出8对条带清晰、多态性较高且具有高度区分度的引物。采用荧光M13毛细管电泳技术,用这8对引物在亲本材料中共检测到45个多态等位条带,每对引物的平均多态条带数为5.625,PIC值变幅为0.58~0.86,平均为0.71。利用Cervus3.0软件对具有8对引物数据的子代进行父本分析,鉴定出‘冬枣’ב木枣’实生苗399株、‘冬枣’ב小芽枣’实生苗390株、‘冬枣’ב映山红’实生苗357株、‘灵宝大枣’ב紫圆枣’(‘紫枣’)实生苗204株、‘灵宝大枣’ב柿饼枣’实生苗126株。
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关键词
枣
SSR
父本鉴定
毛细管电泳
原文传递
题名
燕山山脉西伯利亚杏的遗传多样性和遗传结构
被引量:
13
1
作者
刘华波
王哲
刘君
麻丽颖
王斯琪
唐岩
庞晓明
机构
北京林业大学计算生物学中心北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012年第8期68-74,共7页
基金
教育部新世纪优秀人才计划(NCET-10-0223)
北京林业大学科研启动基金(2008-03)
文摘
以西伯利亚杏分布的核心区域燕山山脉地区的17个群体为材料,利用9对微卫星标记进行遗传多样性和遗传结构的分析。在533个个体扩增得到203个等位基因,每位点平均等位基因数为22.556个。分析表明燕山山脉西伯利亚杏群体具有较高的遗传多样性,每位点平均有效等位基因数(Ne)为5.714,多态位点百分率(P)为100%,期望杂合度(He)为0.788。根据有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)和Shannon信息指数(I)3个遗传多样性参数,遗传多样性最高的群体为北京八达岭,其次为平泉榆树林子,而最低的群体为崇礼驿马图。群体间总的遗传分化系数FST为0.065,总的基因流Nm为3.836。分子方差分析(AMOVA)结果显示燕山山脉地区西伯利亚杏群体的遗传变异主要存在于群体内(95.62%)。Mantel检验发现遗传距离与地理距离呈显著相关性(r=0.5894,P<0.0001)。UPGMA聚类结果显示,地理距离接近的群体聚在一起,进一步验证了Mantel检验结果。基于上述分析结果,提出西伯利亚杏的种质收集策略。研究结果为西伯利亚杏可持续利用与保护提供一定的理论依据。
关键词
西伯利亚杏
微卫星
遗传多样性
群体遗传结构
Keywords
Siberian apricot (Prunus sibirica)
microsatellite
genetic diversity
popnlation structure
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
S718.54 [农业科学—林学]
下载PDF
职称材料
题名
36份枣品种SSR指纹图谱的构建
被引量:
64
2
作者
麻丽颖
孔德仓
刘华波
王斯琪
李颖岳
庞晓明
机构
北京林业大学计算生物学中心
河北省沧县枣树国家良种基地
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期647-654,共8页
基金
中央高校基本业务费项目(BLYX200924
JD-03)
林业公益性行业专项(201004017)
文摘
利用12对SSR引物对36个枣品种进行分析,采用荧光M13毛细管电泳技术进行多态检测,共检测到99个多态位点,每对引物的多态位点数达到8.25,PIC值变幅为0.62~0.85,平均为0.75。依据12对SSR引物在36个品种中扩增的特异带型组合,采用引物—带型组合法构建了36个枣品种的指纹图谱,并对这36份枣品种做聚类分析,遗传相似系数在0.6667~0.9444之间。研究结果为枣树分类、种质鉴定和分子育种提供了重要的工具。
关键词
枣
SSR
指纹图谱
毛细管电泳
遗传相似性
Keywords
jujube
SSR
fingerprint
capillary electrophoresis
genetic similarity
分类号
S665.1 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
利用SSR标记进行枣树子代苗父本鉴定
被引量:
24
3
作者
王斯琪
唐诗哲
孔德仓
贺润平
刘华波
麻丽颖
刘君
王哲
李颖岳
申连英
庞晓明
机构
北京林业大学林木育种国家工程实验室
河北省沧县国家枣树良种基地
山西省农业科学院植物保护研究所
河北农业大学中国枣研究中心
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第11期2133-2141,共9页
基金
林业公益性行业专项项目(201004017)
中央高校基本业务费项目(BLYX200924
JD-03)
文摘
利用SSR标记技术对‘冬枣’自然授粉实生苗1728株和‘灵宝大枣’自然授粉实生苗530株进行父本鉴定,利用可能的父本材料从376对引物中筛选出8对条带清晰、多态性较高且具有高度区分度的引物。采用荧光M13毛细管电泳技术,用这8对引物在亲本材料中共检测到45个多态等位条带,每对引物的平均多态条带数为5.625,PIC值变幅为0.58~0.86,平均为0.71。利用Cervus3.0软件对具有8对引物数据的子代进行父本分析,鉴定出‘冬枣’ב木枣’实生苗399株、‘冬枣’ב小芽枣’实生苗390株、‘冬枣’ב映山红’实生苗357株、‘灵宝大枣’ב紫圆枣’(‘紫枣’)实生苗204株、‘灵宝大枣’ב柿饼枣’实生苗126株。
关键词
枣
SSR
父本鉴定
毛细管电泳
Keywords
jujube, SSR, paternal parent analysis, capillary electrophoresis
分类号
S665.1 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
燕山山脉西伯利亚杏的遗传多样性和遗传结构
刘华波
王哲
刘君
麻丽颖
王斯琪
唐岩
庞晓明
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2012
13
下载PDF
职称材料
2
36份枣品种SSR指纹图谱的构建
麻丽颖
孔德仓
刘华波
王斯琪
李颖岳
庞晓明
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
64
原文传递
3
利用SSR标记进行枣树子代苗父本鉴定
王斯琪
唐诗哲
孔德仓
贺润平
刘华波
麻丽颖
刘君
王哲
李颖岳
申连英
庞晓明
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
24
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