单细胞Hi-C数据分析及应用研究进展

染色质三维基因组结构在细胞功能和基因调控中起着关键作用。单细胞Hi-C技术可以在细胞水平上捕获基因组结构信息,这为研究不同细胞类型之间基因组结构的变化提供了机会。最近,针对单细胞HiC数据分析出现了一些很好的计算分析方法。本文首先对可用的单细胞Hi-C数据分析方法进行综述,包括单细胞Hi-C数据的预处理方法、基于单细胞Hi-C数据的多尺度结构识别方法、基于单细胞Hi-C数据集的类bulk HiC接触矩阵生成方法、伪时间序列分析和细胞分类研究;然后阐述了单细胞Hi-C数据在细胞分化、结构变异的应用研究;最后展望了基于单细胞Hi-C数据的未来发展前景。