发现生物大分子高亲和性配体的新方法——SAR-by-NMR

由于许多药物通过和生物体内的大分子（如蛋白质和核酸）的选择性结合发挥效用，因此快速、有效地发现靶分子的高亲和性配体成为各种药物发现方法的首要目标。在现代生物技术和ＮＭＲ技术高度发展的基础上产生的一种发现生物大分子高亲和性配体的新方法——ＳＡＲ－ｂｙ－ＮＭＲ，由于采用ＮＭＲ技术可以综合多种药物设计方法的优势，能够在短时间内得到先导化合物，从而大大加快了药物发现的速度并能节省大量的费用。本文介绍了ＳＡＲ－ｂｙ－ＮＭＲ发现高亲和性配体的基本原理。

生物素衍生化环孢素A的合成及其与人亲环素A的相互作用研究

通过ε-氨基己酸二聚体的乙酯与生物素缩合将其羧端延伸14个原子,然后与氨基衍生化的环孢素A缩合合成了生物素衍生化的环孢素A.经过药物免疫印迹和表面等离子体共振(Surface Plasmon Resonance)测定表明生物素衍生化的环孢素A还保留了与人亲环素A结合的活力.

Lin28特异性结合let-7 RNA结构基础（英文）

let-7 mi RNA家族控制许多决定细胞命运的基因的表达,从而影响细胞的多能性、分化和转化.Lin28是一个let-7生物合成的转录后抑制因子,其碳端的锌指结构域特异性地结合一个保守的GGAG或者一个类似GGAG的let-7 mi RNA模块.作者报道了人源Lin28与5′-A–2A–1G1G2A3G4-3′let-7 RNA复合物的核磁共振结构.Lin28中两个Lin28 ZKD识别了RNA中的G1G2A3G4.复合物所有的碱基采取反式构象,RNA的骨架因为Lin28的结合变得弯曲,与之前报道的晶体结构一致而与NMR结构不同,从而进一步确认了Lin28识别RNA的作用模式.

生物活性小分子与靶点相互作用研究中的新方法和新技术

活性小分子与靶蛋白的相互作用是生命中基本的相互作用之一，因而靶蛋白和活性小分子的筛选是生命有机化学及药物化学研究的重要内容．在活性小分子筛选方面，细胞印迹（ｃｙｔｏｂｌｏｔ）、以核磁共振为基础的结构活性关系研究（ＳＡＲ－ｂｙ－ＮＭＲ）及反双杂交（ｒｅｖｅｒｓｅ ｔｗｏ－ｈｙｂｒｉｄ）系统分别是以细胞、靶蛋白及蛋白间的相互作用为靶点的高通量、快速的筛选方法．另外，在由活性小分子鉴定靶蛋白的研究中，三杂交（ｔｈｒｅｅ－ｈｙｂｒｉｄ）系统、功能表达克隆（ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ－ｃｌｏｎｉｎｇ）及药物印迹（ｄｒｕｇ－ｗｅｓｔｅｒｎ）等方法大大加速了靶蛋白的鉴定进程；而展示克隆（ｄｉｓｐｌａｙ ｃｌｏｎｉｎｇ）方法可以直接完成由活性小分子到靶蛋白基因的克隆．结合ＤＮＡ芯片技术，以基因组为基础的筛选方法同时还可以明确小分子参与的一系列生物大分子调控．而小分子印迹（ｓｍａｌｌ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｐｒｉｎｔｉｎｇ）是从组合化学出发适应人类基因组要求的筛选靶蛋白及活性小分子、研究小分子参与调控的方法．概要介绍这几种最新筛选方法，并对中草药现代化进行了初步探讨．

一种结合SELEX与二代测序技术筛选RNA结合蛋白特异识别序列新方法的建立

RNA结合蛋白通过特异识别RNA底物发挥重要的生物学作用。指数富集的配体系统进化(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术是一种体外筛选核酸底物的基本方法,SELEX技术通过重复多轮筛选从随机核酸序列库中筛选出特异性与靶物质高度亲和的核酸底物,本研究将利用该技术与二代高通量测序(NGS)相结合,体外合成含有20个随机碱基的RNA文库,将所要研究的蛋白构建到带有可被链亲和酶素磁珠捕获的SBP标记的载体上去,显著提高筛选效率,仅需1轮筛选即可获得所需RNA底物motif。通过该方法获得了人的hn RNP A1的UP1结构域特异识别AGG和AG二种RNA序列,并通过EMSA实验证实其可以与获得的RNA motif结合。这一方法的建立对于研究RNA结合蛋白识别底物的序列特异性,并进一步了解其在生物体内的调控机制有重要意义。