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hsa_circ_0006156在胃癌组织和细胞中的表达及对胃癌细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响
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作者 邱小凤 赵文睫 +2 位作者 李娜 黄义莲 贺延新 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2024年第6期703-708,713,共7页
目的探究hsa_circ_0006156在胃癌组织和细胞中的表达及其对胃癌细胞迁移、侵袭和增殖能力的影响。方法运用RT-qPCR检测并比较胃癌组织与对应癌旁组织、正常胃上皮细胞(gastric epithclial cells-1,GES-1)与三种胃癌细胞(MKN-28、AGS、SG... 目的探究hsa_circ_0006156在胃癌组织和细胞中的表达及其对胃癌细胞迁移、侵袭和增殖能力的影响。方法运用RT-qPCR检测并比较胃癌组织与对应癌旁组织、正常胃上皮细胞(gastric epithclial cells-1,GES-1)与三种胃癌细胞(MKN-28、AGS、SGC-7901)中hsa_circ_0006156的表达水平。应用相关性分析验证胃癌组织的hsa_circ_0006156表达水平与临床特征的关系。应用CCK-8、克隆形成实验、划痕愈合实验、Transwell侵袭实验分别验证沉默或上调hsa_circ_0006156表达对胃癌细胞活性、克隆形成能力、迁移及侵袭能力的影响。结果与癌旁组织相比,胃癌组织中hsa_circ_0006156相对表达量降低(P<0.05),胃癌细胞MKN-28、SGC-7901中hsa_circ_0006156的相对表达量低于GES-1细胞(P<0.001)。hsa_circ_0006156表达下调与TNM分期和CA50的表达相关(P<0.05);与性别、年龄、肿瘤直径、淋巴结转移、CA199、CA242、CA724无相关性(P>0.05)。沉默hsa_circ_0006156,胃癌细胞的活性和克隆形成能力明显提高,迁移距离显著减小,侵袭能力也明显下降。而上调表达hsa_circ_0006156,胃癌细胞的活性和克隆形成能力显著下降,迁移距离明显升高,侵袭能力也明显升高。结论hsa_circ_0006156在胃癌组织和细胞中表达量均下降,hsa_circ_0006156抑制胃癌细胞的活力、增殖能力,但促进其迁移和侵袭能力。 展开更多
关键词 胃癌 hsa_circ_0006156 增殖 迁移 侵袭
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结直肠癌肝转移相关基因的生物信息学分析
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作者 黄义莲 邱小凤 +4 位作者 李娜 赵文睫 姜艳芳 孙烨煜 贺延新 《世界肿瘤研究》 2023年第3期120-132,共13页
目的:通过对美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库现有的基因表达数据以及相关临床数据进行数据挖掘分析,以期寻找结直肠癌(Colorectal Cancer, CRC)肝转移发生的关键基因及治疗靶点。方法:对GEO数据库进行数据检索,筛选出包含正... 目的:通过对美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库现有的基因表达数据以及相关临床数据进行数据挖掘分析,以期寻找结直肠癌(Colorectal Cancer, CRC)肝转移发生的关键基因及治疗靶点。方法:对GEO数据库进行数据检索,筛选出包含正常结直肠组织、CRC组织以及CRC肝转移组织的基因芯片。采用GEO2R工具筛选CRC和正常结直肠组织的差异表达基因以及CRC与CRC肝转移之间的差异表达基因,进一步筛选出两基因集的共有差异表达基因。使用注释、注释可视化和集成发现数据库(DAVID)进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)途径分析。利用STRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白–蛋白互作(PPI)网络的构建和Hub基因的筛选。使用R语言分析Hub基因在正常结直肠、CRC以及CRC肝转移组织中的表达情况,使用基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析Hub基因与CRC预后的相关性。结果:检索得到基因芯片GSE49355,CRC和正常结直肠组织的基因集中存在1394个差异表达基因,CRC与CRC肝转移的基因集中存在125个差异表达基因,两个基因集共有的差异表达基因有29个。GO分析显示,它们的生物学过程可能主要富集在补体激活、正向调节多肽酶活性、替代途径等;细胞学组分主要定位于血液微粒以及细胞外周;分子功能富集于补体和凝血级联、IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等。KEGG信号通路的富集分析显示,差异基因主要富集于补体和凝血级联、IL-17信号通路、TNF信号通路等。对蛋白质相互作用分析中有关联的基因进行排序,前5个Hub基因为SPP1、MMP1、MMP3、CXCL1、CXCL5,它们在CRC中的表达均高于正常结直肠组织,SPP1的表达量在正常结直肠、CRC以及CRC肝转移组织逐渐增高,并且SPP1的高表达与CRC患者较差的生存显著相关。结论:SPP1、MMP1、MMP3、CXCL1、CXCL5与CRC肝转移具有相关性,或可为进一步研究CRC肝转移发生发展的分子机制提供一定基础。 展开更多
关键词 结直肠癌 肝转移 生物信息学分析 GEO
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基于GEO数据库对高风险胃肠道间质瘤的差异基因的生物信息学分析
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作者 邱小凤 黄义莲 +3 位作者 赵文睫 李娜 孙烨煜 贺延新 《临床医学进展》 2023年第4期6073-6079,共7页
目的:采用生物信息学的方法探讨影响胃肠道间质瘤风险分级的差异基因表达及其生物学功能富集。方法:检索并获取GEO数据库中关于胃肠道间质瘤恶性程度差异基因表达的数据,利用GER2O工具对差异基因进行筛选和分析,采用DAVID数据库进行GO、... 目的:采用生物信息学的方法探讨影响胃肠道间质瘤风险分级的差异基因表达及其生物学功能富集。方法:检索并获取GEO数据库中关于胃肠道间质瘤恶性程度差异基因表达的数据,利用GER2O工具对差异基因进行筛选和分析,采用DAVID数据库进行GO、KEGG富集分析,使用STRING,Cytoscape软件行蛋白–蛋白互作(PPI)网络构建。结果:筛选出两个数据集:GSE31802和GSE47911,查找出其中共有的差异表达基因有42个,它们的生物学过程可能主要富集在cAMP分解代谢过程、信号转导、基因表达的正向调控和酪氨酸激酶信号通路这几个方面。细胞学组分主要定位于质膜以及内质网腔。分子功能富集于信号素受体活性、序列特异性双链DNA结合。KEGG信号通路的富集分析显示差异基因主要富集于轴突的指导、癌症的转录失调等。对蛋白质相互作用分析中有关联的基因进行排序,显示IL-6,PGR的节点分数最高。结论:通过对影响胃肠道间质瘤风险分级的差异基因的分析,本研究发现的关键差异基因有助于了解影响胃肠道间质瘤危险分级的潜在因子。 展开更多
关键词 胃肠道间质瘤 危险度分级 生物信息学分析
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班主任应做好后进生转化工作
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作者 黄义莲 《教师博览(下旬刊)》 2014年第12期72-72,共1页
做好后进生的转化工作,是班级管理工作的重中之重,对于青少年学生的健康成长同样具有非常重要的意义。班主任要全面了解学生,发现他们身上的闪光点,帮助学生树立自信心,成为学生的良师益友,实现班级的良性发展和学生的素质提升。
关键词 班主任工作 后进生 转化工作
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新课标初中英语词汇教学例谈
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作者 黄义莲 《教师博览(下旬刊)》 2013年第8期46-46,共1页
在初中英语词汇教学中,教师要结合学生的实际,采取灵活多样的教学方法,帮助学生获得学习词汇的方法,促使他们真正记忆、理解、运用词汇进行语言交际和语言运用,提高学生用英语进行思维和表达的能力。
关键词 中学英语 词汇教学 理解与运用
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初一《英语》新教材的教法
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作者 黄义莲 《江西教育(综合版)(C)》 2014年第4期25-25,共1页
《英语课程标准》明确指出:“教师要避免单纯传授语言知识,倡导任务型的教学模式,让学生在教师的指导下,通过感知、体验、实践、合作等方式,完成目标,感受成功。”笔者结合自己对新课程改革初一英语教学的实践,谈谈几点初步的认... 《英语课程标准》明确指出:“教师要避免单纯传授语言知识,倡导任务型的教学模式,让学生在教师的指导下,通过感知、体验、实践、合作等方式,完成目标,感受成功。”笔者结合自己对新课程改革初一英语教学的实践,谈谈几点初步的认识与做法。 展开更多
关键词 《英语》 初一 新教材 《英语课程标准》 教法 新课程改革 语言知识 教学模式
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