目的通过网络药理学方法探讨川芎嗪治疗冠心病的分子机制。方法利用Pharmmapper数据库、中药分子机制生物学分析平台(BATMAN-TCM)预测化合物靶点,通过与人类基因数据库(Genecards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)治疗冠心病的相关靶...目的通过网络药理学方法探讨川芎嗪治疗冠心病的分子机制。方法利用Pharmmapper数据库、中药分子机制生物学分析平台(BATMAN-TCM)预测化合物靶点,通过与人类基因数据库(Genecards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)治疗冠心病的相关靶点进行匹配,得到化合物-疾病共同靶蛋白。利用Cytoscape3.7.1软件构建化合物-靶点网络,然后借助STRING数据库进行蛋白互作网络分析,最后利用R语言进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果经过筛选得到川芎嗪作用于冠心病的靶点115个,这些靶点主要富集在磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3 kinase/protein kinase B,PI3K-Akt)、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)等多条信号通路上。结论川芎嗪可能主要通过抗凋亡、抗凝血、抗炎、促进血管新生、应对缺氧等多方面对冠心病进行干预,体现了中药多靶点、多通路的作用特点。展开更多
目的:基于网络药理学探讨双心方治疗心肌梗死后抑郁的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库及分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)获取双心方活性成分及其对应靶点...目的:基于网络药理学探讨双心方治疗心肌梗死后抑郁的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库及分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)获取双心方活性成分及其对应靶点,GeneCards、PharmGKB数据库搜集心肌梗死与抑郁的相关靶点并整合,将药物靶点与疾病靶点取交集后得到双心方的潜在作用靶点。使用Cytoscape 3.8.2软件构建药物—成分—潜在作用靶点网络,利用STRING数据库进行蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络分析,并利用DAVID V6.8数据库进行基因本体论(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析。结果:获得双心方的有效成分88个,潜在作用靶点89个,核心靶点10个。通过GO和KEGG富集分析分别获得229条生物学过程条目和34条信号通路。通过HIF-1、PI3K/Akt等多条信号通路介导,双心方中的多重活性成分有心脏保护作用,可通过抗心肌细胞凋亡、抗炎、抗氧化应激反应,促进心肌梗死后心脏内的血管生成等治疗心肌梗死及改善预后,通过抑制神经元的氧化应激损伤、减少炎症介导的细胞毒性和神经元死亡等改善抑郁。结论:双心方主要是通过多靶点、多通路来发挥治疗心肌梗死后抑郁的作用,该研究为后续深入开展双心方治疗心肌梗死后抑郁的作用机制研究提供了依据与方向。展开更多
文摘目的通过网络药理学方法探讨川芎嗪治疗冠心病的分子机制。方法利用Pharmmapper数据库、中药分子机制生物学分析平台(BATMAN-TCM)预测化合物靶点,通过与人类基因数据库(Genecards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)治疗冠心病的相关靶点进行匹配,得到化合物-疾病共同靶蛋白。利用Cytoscape3.7.1软件构建化合物-靶点网络,然后借助STRING数据库进行蛋白互作网络分析,最后利用R语言进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果经过筛选得到川芎嗪作用于冠心病的靶点115个,这些靶点主要富集在磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3 kinase/protein kinase B,PI3K-Akt)、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)等多条信号通路上。结论川芎嗪可能主要通过抗凋亡、抗凝血、抗炎、促进血管新生、应对缺氧等多方面对冠心病进行干预,体现了中药多靶点、多通路的作用特点。
文摘目的:基于网络药理学探讨双心方治疗心肌梗死后抑郁的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库及分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)获取双心方活性成分及其对应靶点,GeneCards、PharmGKB数据库搜集心肌梗死与抑郁的相关靶点并整合,将药物靶点与疾病靶点取交集后得到双心方的潜在作用靶点。使用Cytoscape 3.8.2软件构建药物—成分—潜在作用靶点网络,利用STRING数据库进行蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络分析,并利用DAVID V6.8数据库进行基因本体论(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析。结果:获得双心方的有效成分88个,潜在作用靶点89个,核心靶点10个。通过GO和KEGG富集分析分别获得229条生物学过程条目和34条信号通路。通过HIF-1、PI3K/Akt等多条信号通路介导,双心方中的多重活性成分有心脏保护作用,可通过抗心肌细胞凋亡、抗炎、抗氧化应激反应,促进心肌梗死后心脏内的血管生成等治疗心肌梗死及改善预后,通过抑制神经元的氧化应激损伤、减少炎症介导的细胞毒性和神经元死亡等改善抑郁。结论:双心方主要是通过多靶点、多通路来发挥治疗心肌梗死后抑郁的作用,该研究为后续深入开展双心方治疗心肌梗死后抑郁的作用机制研究提供了依据与方向。