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橡胶树甲基化过滤文库的构建
被引量:
3
1
作者
黄关青
华玉伟
+1 位作者
高战
黄华孙
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期1071-1076,共6页
为高通量富集橡胶树基因编码序列,文章首次利用大肠杆菌McrBC限制修饰系统构建了巴西橡胶树基因组甲基化过滤文库。该文库未扩增和扩增后的滴度分别为2.6×106pfu/mL和9×109pfu/mL,阳性克隆率为86.4%,插入片段大小为1~2.5kb,...
为高通量富集橡胶树基因编码序列,文章首次利用大肠杆菌McrBC限制修饰系统构建了巴西橡胶树基因组甲基化过滤文库。该文库未扩增和扩增后的滴度分别为2.6×106pfu/mL和9×109pfu/mL,阳性克隆率为86.4%,插入片段大小为1~2.5kb,平均长度为1.2kb。随机挑选100个克隆进行测序,共拼接出81个非冗余序列,其中包括6个重叠群(Contigs)和75个单一序列(Singlets),冗余度为17.35%。Blast分析发现,39.5%非冗余序列与Nr库中功能基因同源,14.81%与EST数据库中序列同源,32.1%序列为未知序列,且部分序列为开花调控、抗虫和抗病等功能相关的同源基因。橡胶树甲基化文库的建立为橡胶树重要功能基因发现和克隆提供一条重要途径。
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关键词
巴西橡胶树
甲基化过滤
基因富集
文库构建
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职称材料
橡胶树次生体胚发生及其再生植株遗传稳定性的分子检测
被引量:
12
2
作者
华玉伟
黄关青
+1 位作者
龙青姨
黄华孙
《热带作物学报》
CSCD
2009年第5期644-650,共7页
以热研7-33-97花药为材料,建立橡胶树次生体胚发生和植株再生体系,主要包括初生花药体胚诱导、次生体胚发生和次生胚植株再生三个步骤。结果表明,来自花药初生异常胚和初生子叶期胚的0.2~0.3cm胚块均能成功诱导次生体胚发生,并均能获...
以热研7-33-97花药为材料,建立橡胶树次生体胚发生和植株再生体系,主要包括初生花药体胚诱导、次生体胚发生和次生胚植株再生三个步骤。结果表明,来自花药初生异常胚和初生子叶期胚的0.2~0.3cm胚块均能成功诱导次生体胚发生,并均能获得成熟子叶期胚。以初生异常胚为外植体,每个胚块获得子叶期胚数为0.64个。以初生子叶期胚为外植体连续3次诱导次生体胚发生,随诱导次数增加,体胚发生频率先上升,后保持稳定。2,4-D对次生体胚植株再生具有明显影响,添加4.5μmol/L和9μmol/L2,4-D植株再生培养基中植株再生频率达到85.0%。AFLP检测次生体胚植株遗传稳定结果显示:(1)来自初生异常胚的次生体胚植株60.0%植株DNA发生变异;(2)来自初生子叶期胚的次生体胚植株,随次生体胚发生次数增加,检测到DNA变异植株频率由30.0%升高到52.4%。AFLP聚类分析结果显示,次生体胚植株与热研7-33-97高度相似,相似系数大于0.904。
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关键词
橡胶树
次生体胚发生
分子标记
遗传稳定性
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职称材料
PTC_(3)和PPM抑菌剂对橡胶树组培中常见污染菌的抑菌效果及对橡胶树次生体胚发生效率影响
被引量:
1
3
作者
成镜
李季
+4 位作者
戴雪梅
徐正伟
周权男
黄天带
黄关青
《热带农业科学》
2021年第3期68-73,共6页
以热研7-33-97橡胶树组织培养材料为试验材料,通过分子鉴定的方法确认橡胶树组织培养中常见污染源是红青霉菌。研究不同浓度植物组织抗菌剂PTC_(3)(0.2、0.4、0.6、0.8、1、1.2、1.4、1.6、1.8、2.0mL/L)和PPM (0.5、0.55、0.6、0.65、...
以热研7-33-97橡胶树组织培养材料为试验材料,通过分子鉴定的方法确认橡胶树组织培养中常见污染源是红青霉菌。研究不同浓度植物组织抗菌剂PTC_(3)(0.2、0.4、0.6、0.8、1、1.2、1.4、1.6、1.8、2.0mL/L)和PPM (0.5、0.55、0.6、0.65、0.7、0.75、0.8、0.85、0.9、0.95 mL/L)抑菌剂对红青霉菌的生长抑制率,及其对橡胶树次生体胚发生效率的影响,结果表明,当PTC_(3)抑菌剂浓度为1 mL/L时,对红青霉菌有一定的抑制作用,培养2 d时和培养5 d时,对真菌的生长抑制率最高分别为18.1%、22.3%。当PPM抑菌剂浓度为0.6、0.65、0.7、0.85、0.95 mL/L时,培养2 d,对真菌的生长抑制率分别为18.6%、17.4%、17.2%、19.2%、16.3%。培养5 d时,所有抑菌剂浓度处理对真菌均没有生长抑制作用。同时发现PTC_(3)和PPM对橡胶树次生体胚发生有一定的促进作用,PTC_(3)促进效果稍好一些。
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关键词
橡胶树
次生体胚发生
污染
红青霉菌
PTC_3
PPM
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职称材料
题名
橡胶树甲基化过滤文库的构建
被引量:
3
1
作者
黄关青
华玉伟
高战
黄华孙
机构
中国热带农业科学院橡胶研究所、农业部橡胶树生物学重点开放实验室、国家橡胶树育种中心
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期1071-1076,共6页
基金
国家天然橡胶产业技术体系项目(编号:nycytx-34)
农业部农作物种质资源保护项目(编号:NB09-2130135-14)资助
文摘
为高通量富集橡胶树基因编码序列,文章首次利用大肠杆菌McrBC限制修饰系统构建了巴西橡胶树基因组甲基化过滤文库。该文库未扩增和扩增后的滴度分别为2.6×106pfu/mL和9×109pfu/mL,阳性克隆率为86.4%,插入片段大小为1~2.5kb,平均长度为1.2kb。随机挑选100个克隆进行测序,共拼接出81个非冗余序列,其中包括6个重叠群(Contigs)和75个单一序列(Singlets),冗余度为17.35%。Blast分析发现,39.5%非冗余序列与Nr库中功能基因同源,14.81%与EST数据库中序列同源,32.1%序列为未知序列,且部分序列为开花调控、抗虫和抗病等功能相关的同源基因。橡胶树甲基化文库的建立为橡胶树重要功能基因发现和克隆提供一条重要途径。
关键词
巴西橡胶树
甲基化过滤
基因富集
文库构建
Keywords
Hevea brasiliensis
methylation filtration
gene enrichment
library construction
分类号
S794.1 [农业科学—林木遗传育种]
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
橡胶树次生体胚发生及其再生植株遗传稳定性的分子检测
被引量:
12
2
作者
华玉伟
黄关青
龙青姨
黄华孙
机构
中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学重点开放实验室
出处
《热带作物学报》
CSCD
2009年第5期644-650,共7页
基金
国家自然科技资源平台项目(No.2005DKA21000-5-11)
国家天然橡胶产业技术体系(No.NYCYTY-34)资助
文摘
以热研7-33-97花药为材料,建立橡胶树次生体胚发生和植株再生体系,主要包括初生花药体胚诱导、次生体胚发生和次生胚植株再生三个步骤。结果表明,来自花药初生异常胚和初生子叶期胚的0.2~0.3cm胚块均能成功诱导次生体胚发生,并均能获得成熟子叶期胚。以初生异常胚为外植体,每个胚块获得子叶期胚数为0.64个。以初生子叶期胚为外植体连续3次诱导次生体胚发生,随诱导次数增加,体胚发生频率先上升,后保持稳定。2,4-D对次生体胚植株再生具有明显影响,添加4.5μmol/L和9μmol/L2,4-D植株再生培养基中植株再生频率达到85.0%。AFLP检测次生体胚植株遗传稳定结果显示:(1)来自初生异常胚的次生体胚植株60.0%植株DNA发生变异;(2)来自初生子叶期胚的次生体胚植株,随次生体胚发生次数增加,检测到DNA变异植株频率由30.0%升高到52.4%。AFLP聚类分析结果显示,次生体胚植株与热研7-33-97高度相似,相似系数大于0.904。
关键词
橡胶树
次生体胚发生
分子标记
遗传稳定性
Keywords
Hevea
secondary somatic embryogenesis
molecular marker
somaclonal variation
分类号
S794.1 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
PTC_(3)和PPM抑菌剂对橡胶树组培中常见污染菌的抑菌效果及对橡胶树次生体胚发生效率影响
被引量:
1
3
作者
成镜
李季
戴雪梅
徐正伟
周权男
黄天带
黄关青
机构
中国热带农业科学院橡胶研究所/农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室/热带林木种子种苗工程中心
出处
《热带农业科学》
2021年第3期68-73,共6页
基金
中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项(No.1630022018001)
中国热带农业科学院国家基金培育专项(No.1630022019019)
+1 种基金
国家重点研发计划(No.SQ2020YFF0424243)
国家重点研发计划(No.2019YFD1001102)。
文摘
以热研7-33-97橡胶树组织培养材料为试验材料,通过分子鉴定的方法确认橡胶树组织培养中常见污染源是红青霉菌。研究不同浓度植物组织抗菌剂PTC_(3)(0.2、0.4、0.6、0.8、1、1.2、1.4、1.6、1.8、2.0mL/L)和PPM (0.5、0.55、0.6、0.65、0.7、0.75、0.8、0.85、0.9、0.95 mL/L)抑菌剂对红青霉菌的生长抑制率,及其对橡胶树次生体胚发生效率的影响,结果表明,当PTC_(3)抑菌剂浓度为1 mL/L时,对红青霉菌有一定的抑制作用,培养2 d时和培养5 d时,对真菌的生长抑制率最高分别为18.1%、22.3%。当PPM抑菌剂浓度为0.6、0.65、0.7、0.85、0.95 mL/L时,培养2 d,对真菌的生长抑制率分别为18.6%、17.4%、17.2%、19.2%、16.3%。培养5 d时,所有抑菌剂浓度处理对真菌均没有生长抑制作用。同时发现PTC_(3)和PPM对橡胶树次生体胚发生有一定的促进作用,PTC_(3)促进效果稍好一些。
关键词
橡胶树
次生体胚发生
污染
红青霉菌
PTC_3
PPM
Keywords
Hevea
secondary somatic embryogenesis
contamination
Penicillium rubrum
Plant Tissue Culture Contamination Control(PTC3)
Plant Preservative Mixture(PPM)
分类号
S482.299 [农业科学—农药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
橡胶树甲基化过滤文库的构建
黄关青
华玉伟
高战
黄华孙
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
下载PDF
职称材料
2
橡胶树次生体胚发生及其再生植株遗传稳定性的分子检测
华玉伟
黄关青
龙青姨
黄华孙
《热带作物学报》
CSCD
2009
12
下载PDF
职称材料
3
PTC_(3)和PPM抑菌剂对橡胶树组培中常见污染菌的抑菌效果及对橡胶树次生体胚发生效率影响
成镜
李季
戴雪梅
徐正伟
周权男
黄天带
黄关青
《热带农业科学》
2021
1
下载PDF
职称材料
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