青岛文昌鱼硫氧还蛋白基因的克隆及同源性分析

通过对文昌鱼神经胚cDNA文库进行测序 ,获得含文昌鱼硫氧还蛋白基因全部读框的cDNA序列 ,并演绎出对应的氨基酸序列 ,对其可编码蛋白进行了分析预测 ,还与多种脊椎动物和无脊椎动物中同种蛋白的同源性进行比较分析 .发现该蛋白具有典型的硫氧还蛋白活性部位 ,与脊椎动物硫氧还蛋白的同源性大于无脊椎动物 ,说明作为脊椎动物和无脊椎动物之间典型的过渡类型 ,文昌鱼在进化上更接近于脊椎动物 .

青岛文昌鱼核糖体蛋白AmphiL37a基因的克隆和同源性分析

对青岛文昌鱼神经胚cDNA进行测序 ,获得了 3个AmphiL3 7a的EST ,经拼接得到编码文昌鱼核糖体蛋白的AmphiL3 7a基因全长cDNA序列并演绎出AmphiL3 7a的氨基酸序列 .通过对AmphiL3 7a蛋白的结构分析及其与多种脊椎动物和无脊椎动物中同种蛋白的同源性进行比较 ,发现AmphiL3 7a具有典型的四个半胱氨酸的锌指结构 ,与人、鼠、鸡的L3 7a ,尤其与果蝇、隐板石鳖等高等无脊椎动物核糖体L3 7a具有较高的同源性 ,说明文昌鱼在进化上更接近于高等无脊椎动物 ;同时说明核糖体蛋白L3

文昌鱼eIF5A基因的克隆和进化学分析

对文昌鱼神经胚cDNA文库进行测序和系统分析 ,首次从青岛文昌鱼 (Brachiostomabelcheritsingtauense)中成功得到 1个eIF5A基因的cDNA序列 ,分析其推导的氨基酸序列揭示该基因产物具有eIF 5A家族蛋白质共有的保守区 .对其二级结构进行预测 ,序列同源性分析表明eIF 5A家族基因在所有的真核生物中都高度保守 .进化生物学的分析显示文昌鱼的eIF5A基因与脊椎动物的同源性较高 .

青岛文昌鱼碱性肌球蛋白轻链MLC-alk基因片段的克隆

碱性肌球蛋白轻链是构成肌球蛋白头部的必需分子 .采用简并引物PCR方法获得青岛文昌鱼碱性肌球蛋白轻链基因片段 ,并对其氨基酸序列与其他生物如鸡和人的胚胎型、骨骼肌型、平滑肌型、心肌型、非肌型等多种碱性肌球蛋白轻链基因家族成员相应片段进行了同源性分析 ,均显示较高的同源性 .研究结果支持青岛文昌鱼具有 1个 ,可能也仅有 1个碱性肌球蛋白轻链基因 .

中华大蟾蜍尾部程序性死亡的形态学和相关酶的研究

为了研究两栖类变态过程中程序性死亡的分子机制 ,本文利用尾部离体培养、DNA含量分析、组织切片和形态学分析等方法 ,观察和分析了中华大蟾蜍变态过程中尾部程序性死亡的形态学变化 ;同时研究了磷脂酰胆碱特异性磷脂酶C的抑制剂对蝌蚪尾部程序性死亡的影响 .发现这一特异性抑制剂明显阻止了中华大蟾蜍变态中尾部的萎缩 ,表明该酶在其尾部的程序性死亡中发挥重要作用 .本文的这一发现为深入研究发育过程中程序性死亡的分子机制奠定了基础 .

青岛文昌鱼hedgehog及两个hedgehog-like片段的克隆

采用RT PCR方法获得了青岛文昌鱼 2 4 97bp长的hedgehog基因片段 ,其所编码的氨基酸序列与多种生物hh基因家族成员的相应片段显示了较高的同源性 .同时获得 2个含有部分hedgehog基因片段的序列hedgehog like 1和hedgehog like 2 ,提示文昌鱼中发生hedgehog基因倍增过程和有多拷贝hh基因存在的可能性 .为研究hh基因的分子进化提供了线索 .

文昌鱼profilin同源基因的胚胎发育表达图式

本研究利用胚胎整体原位杂交技术结合系列组织学切片技术,以及Northern blot 分析,对进化上处于特殊地位的模式动物文昌鱼profilin 基因不同发育时期的表达图式进行了系统研究,揭示了该基因的动态表达图式与肌肉分化的过程一致,文昌鱼profilin 基因可能与胚胎早期肌肉的发育相关。同时,通过Southern blot 检测对青岛文昌鱼profilin 基因可能存在的同源体进行了探讨,试图为弄清文昌鱼肌肉发育分化的分子机制提供资料。

AmphiSox1/2/3-like基因的系统进化学分析和在文昌鱼胚胎发育中的表达

为了研究文昌鱼胚胎发育中神经管发育的分子机制和脊椎动物中枢神经系统的起源,我们筛选和分析了与佛罗里达文昌鱼AmphiSox1/2/3基因同源的青岛文昌鱼AmphiSox1/2/3-like 基因,对其推测的氨基酸序列与17个脊椎动物和无脊椎动物的同源基因进行了系统的进化学分析,并利用胚胎整体原位杂交技术结合系列组织学切片技术,对该基因在青岛文昌鱼胚胎发育中的时空表达模式进行了系统的研究.AmphiSox1/2/3-like在原肠胚早中期开始在背部上胚层和预定神经外胚层中明显表达.在神经胚早期其表达定位于神经板.此后,表达区域位于形成中的神经管和胚胎中、后部分化中的神经管的两侧,其表达的水平从前向后逐渐下调和终止.此外,该基因在神经胚晚期和幼虫期的消化道壁中也有明显表达.研究结果显示,该基因与文昌鱼的神经分化和消化道分化密切相关.

文昌鱼RACK1基因在胚胎发育中的表达

脊椎动物活化的(蛋白)激酶C受体1(receptor for activated C-kinase1,RACK1)在胚胎发育过程中起着至关重要的作用.克隆了RACK1基因在青岛文昌鱼(Branchiostoma belcheri)中的同源基因AmphiRACK1,对其进行了系统的进化学分析,并研究了该基因在正常胚胎发育过程中和经LiCl处理胚胎发育中的时空表达图式.系统进化学分析结果表明,文昌鱼RACK1位于脊椎动物进化枝的基部.在正常胚胎发育中,AmphiRACK1基因在脑泡、神经管和体节中都有明显的表达.在经LiCl处理的胚胎中,该基因在体节中的分节型表达变模糊,表达下调;在脑泡和神经管中的表达下调甚至消失.此外,在成体文昌鱼的轮器、鳃血管、肝盲囊和肠上皮以及精巢中都检测到AmphiRACK1基因不同程度的表达.